MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-7

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017235	TTA	2	6	92	97	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206452
2	NC_017235	TCA	2	6	112	117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206452
3	NC_017235	GAA	2	6	154	159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206452
4	NC_017235	TCT	2	6	163	168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206452
5	NC_017235	AAC	2	6	232	237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206452
6	NC_017235	TTA	2	6	283	288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206452
7	NC_017235	ACT	2	6	456	461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206452
8	NC_017235	TCA	2	6	475	480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206452
9	NC_017235	AAC	2	6	521	526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206452
10	NC_017235	ATT	2	6	541	546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206452
11	NC_017235	ATT	2	6	838	843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017235	AGG	2	6	844	849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017235	AGA	2	6	919	924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206453
14	NC_017235	ACT	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206453
15	NC_017235	TGG	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206453
16	NC_017235	AGG	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206453
17	NC_017235	CCA	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206453
18	NC_017235	TAC	2	6	1176	1181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206453
19	NC_017235	ATT	2	6	1229	1234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206453
20	NC_017235	TTA	2	6	1357	1362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206453
21	NC_017235	TAT	2	6	1425	1430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
22	NC_017235	AAT	2	6	1465	1470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
23	NC_017235	TTA	2	6	1483	1488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
24	NC_017235	TCT	2	6	1503	1508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
25	NC_017235	TCT	2	6	1557	1562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
26	NC_017235	ATT	2	6	1595	1600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
27	NC_017235	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206454
28	NC_017235	CTT	3	9	1660	1668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
29	NC_017235	TTC	2	6	1790	1795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
30	NC_017235	CAT	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206454
31	NC_017235	ATA	2	6	1899	1904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
32	NC_017235	AAT	2	6	1905	1910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
33	NC_017235	TCT	2	6	2088	2093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
34	NC_017235	TGA	2	6	2160	2165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206454
35	NC_017235	TCA	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206454
36	NC_017235	TAA	2	6	2216	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
37	NC_017235	ATT	2	6	2231	2236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
38	NC_017235	TAA	2	6	2311	2316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
39	NC_017235	TAT	2	6	2345	2350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
40	NC_017235	TAA	2	6	2452	2457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
41	NC_017235	ACT	2	6	2465	2470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206454
42	NC_017235	CAC	2	6	2749	2754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206454
43	NC_017235	ATT	2	6	2786	2791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
44	NC_017235	GAT	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206454
45	NC_017235	TCA	2	6	2937	2942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206454
46	NC_017235	GGA	2	6	2961	2966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206454
47	NC_017235	CTT	2	6	2989	2994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
48	NC_017235	TCT	2	6	3267	3272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
49	NC_017235	TAG	2	6	3274	3279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206454
50	NC_017235	CAT	2	6	3280	3285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206454
51	NC_017235	TCT	2	6	3312	3317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
52	NC_017235	ATA	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
53	NC_017235	AGC	2	6	3358	3363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206454
54	NC_017235	TAA	2	6	3448	3453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
55	NC_017235	GTG	2	6	3460	3465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206454
56	NC_017235	CAA	2	6	3469	3474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206454
57	NC_017235	TTC	2	6	3565	3570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
58	NC_017235	TAA	2	6	3625	3630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
59	NC_017235	TTC	2	6	3794	3799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
60	NC_017235	TCT	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
61	NC_017235	TTC	2	6	3944	3949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
62	NC_017235	AAT	2	6	3977	3982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206454
63	NC_017235	TAG	2	6	3991	3996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206454
64	NC_017235	AAG	2	6	4110	4115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206454
65	NC_017235	TTC	2	6	4133	4138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
66	NC_017235	ATT	2	6	4166	4171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
67	NC_017235	TCT	2	6	4188	4193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
68	NC_017235	TCC	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206454
69	NC_017235	TAT	2	6	4265	4270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206454
70	NC_017235	TCA	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206454
71	NC_017235	TCT	2	6	4353	4358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
72	NC_017235	TTC	2	6	4430	4435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206454
73	NC_017235	GTC	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206454
74	NC_017235	TCA	2	6	4660	4665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206454
75	NC_017235	TTG	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017235	TCA	2	6	4695	4700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017235	ATT	2	6	4775	4780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017235	AGG	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017235	AGA	2	6	4922	4927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206455
80	NC_017235	AGT	2	6	5339	5344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206455
81	NC_017235	TAA	2	6	5348	5353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017235	AGA	2	6	5492	5497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206456
83	NC_017235	CAC	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206456
84	NC_017235	GAA	2	6	5817	5822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206456
85	NC_017235	TAC	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017235	TTG	2	6	5934	5939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017235	CAA	2	6	5964	5969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017235	AAT	2	6	6132	6137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206457
89	NC_017235	TAA	2	6	6163	6168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206457
90	NC_017235	CAA	2	6	6270	6275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206457
91	NC_017235	TCC	2	6	6560	6565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206457
92	NC_017235	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206457
93	NC_017235	AAT	2	6	6604	6609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206457
94	NC_017235	TAT	2	6	6652	6657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017235	ATA	2	6	6738	6743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206458
96	NC_017235	ATT	2	6	6771	6776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206458
97	NC_017235	TAT	2	6	6794	6799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206458
98	NC_017235	TCA	2	6	6953	6958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206458
99	NC_017235	AAT	2	6	7002	7007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206458
100	NC_017235	AAG	2	6	7139	7144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206458
101	NC_017235	TTA	2	6	7153	7158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206458
102	NC_017235	TCT	2	6	7243	7248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206458
103	NC_017235	ATT	2	6	7266	7271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206458
104	NC_017235	ATA	2	6	7381	7386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206458
105	NC_017235	CCT	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206458
106	NC_017235	ATT	2	6	7432	7437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206458
107	NC_017235	TAA	2	6	7681	7686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206459
108	NC_017235	TCA	2	6	7752	7757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206459
109	NC_017235	CTT	2	6	7765	7770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206459
110	NC_017235	TAA	2	6	7828	7833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206459
111	NC_017235	TAT	2	6	8227	8232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206460
112	NC_017235	ATT	2	6	8246	8251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206460
113	NC_017235	CAT	2	6	8362	8367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206460
114	NC_017235	ATT	2	6	8408	8413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206460
115	NC_017235	TAA	2	6	8471	8476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206460
116	NC_017235	AAT	2	6	8486	8491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206460
117	NC_017235	TTA	2	6	8496	8501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206460
118	NC_017235	AAT	2	6	8569	8574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206460
119	NC_017235	TAG	2	6	8833	8838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017235	ATA	2	6	8899	8904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017235	ATT	2	6	9087	9092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017235	TTA	2	6	9124	9129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206461
123	NC_017235	TCT	2	6	9133	9138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206461
124	NC_017235	AAT	2	6	9141	9146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206461
125	NC_017235	TGG	2	6	9521	9526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206461
126	NC_017235	TTC	2	6	9585	9590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206461
127	NC_017235	TCA	2	6	9649	9654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206461
128	NC_017235	CTT	2	6	9714	9719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206461
129	NC_017235	TTC	2	6	9747	9752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206461
130	NC_017235	GTT	2	6	9767	9772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206461
131	NC_017235	TTG	2	6	9929	9934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206461
132	NC_017235	GCA	2	6	9943	9948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206461
133	NC_017235	ATC	2	6	10140	10145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206461
134	NC_017235	TTC	2	6	10188	10193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206461
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254	NC_017235	AGT	2	6	20371	20376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_017235	TAG	2	6	20379	20384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
256	NC_017235	TCT	2	6	20442	20447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_017235	GAG	2	6	20487	20492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
258	NC_017235	GAT	2	6	20573	20578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.