MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-7

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017235	AT	3	6	571	576	50 %	50 %	0 %	0 %	384206452
2	NC_017235	AT	3	6	615	620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017235	AT	3	6	696	701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017235	AT	3	6	1117	1122	50 %	50 %	0 %	0 %	384206453
5	NC_017235	CA	3	6	1961	1966	50 %	0 %	0 %	50 %	384206454
6	NC_017235	TC	3	6	2003	2008	0 %	50 %	0 %	50 %	384206454
7	NC_017235	AT	3	6	2617	2622	50 %	50 %	0 %	0 %	384206454
8	NC_017235	AT	3	6	2913	2918	50 %	50 %	0 %	0 %	384206454
9	NC_017235	AT	3	6	3520	3525	50 %	50 %	0 %	0 %	384206454
10	NC_017235	AT	3	6	4389	4394	50 %	50 %	0 %	0 %	384206454
11	NC_017235	AT	3	6	4496	4501	50 %	50 %	0 %	0 %	384206454
12	NC_017235	AG	3	6	5247	5252	50 %	0 %	50 %	0 %	384206455
13	NC_017235	TA	3	6	5682	5687	50 %	50 %	0 %	0 %	384206456
14	NC_017235	TA	3	6	5715	5720	50 %	50 %	0 %	0 %	384206456
15	NC_017235	AT	3	6	6364	6369	50 %	50 %	0 %	0 %	384206457
16	NC_017235	AT	3	6	6707	6712	50 %	50 %	0 %	0 %	384206458
17	NC_017235	AT	3	6	6820	6825	50 %	50 %	0 %	0 %	384206458
18	NC_017235	AT	3	6	6905	6910	50 %	50 %	0 %	0 %	384206458
19	NC_017235	AT	3	6	6946	6951	50 %	50 %	0 %	0 %	384206458
20	NC_017235	AT	3	6	7203	7208	50 %	50 %	0 %	0 %	384206458
21	NC_017235	TA	3	6	7598	7603	50 %	50 %	0 %	0 %	384206459
22	NC_017235	TA	3	6	8089	8094	50 %	50 %	0 %	0 %	384206460
23	NC_017235	TA	3	6	8234	8239	50 %	50 %	0 %	0 %	384206460
24	NC_017235	TA	3	6	8347	8352	50 %	50 %	0 %	0 %	384206460
25	NC_017235	TA	3	6	8441	8446	50 %	50 %	0 %	0 %	384206460
26	NC_017235	AT	3	6	9247	9252	50 %	50 %	0 %	0 %	384206461
27	NC_017235	GT	3	6	10094	10099	0 %	50 %	50 %	0 %	384206461
28	NC_017235	TA	3	6	11302	11307	50 %	50 %	0 %	0 %	384206462
29	NC_017235	CT	5	10	12131	12140	0 %	50 %	0 %	50 %	384206463
30	NC_017235	TA	3	6	13145	13150	50 %	50 %	0 %	0 %	384206465
31	NC_017235	GA	3	6	14567	14572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017235	TA	3	6	14850	14855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017235	GT	3	6	16907	16912	0 %	50 %	50 %	0 %	384206469
34	NC_017235	TC	3	6	17480	17485	0 %	50 %	0 %	50 %	384206469
35	NC_017235	AT	3	6	20597	20602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017235	TA	4	8	21314	21321	50 %	50 %	0 %	0 %	384206475
37	NC_017235	GT	3	6	22887	22892	0 %	50 %	50 %	0 %	384206477
38	NC_017235	TA	3	6	22956	22961	50 %	50 %	0 %	0 %	384206477
39	NC_017235	AG	3	6	24297	24302	50 %	0 %	50 %	0 %	384206478
40	NC_017235	GA	3	6	24322	24327	50 %	0 %	50 %	0 %	384206478
41	NC_017235	AT	3	6	24678	24683	50 %	50 %	0 %	0 %	384206479
42	NC_017235	AT	3	6	25436	25441	50 %	50 %	0 %	0 %	384206480
43	NC_017235	AT	3	6	26680	26685	50 %	50 %	0 %	0 %	384206481
44	NC_017235	TA	3	6	27052	27057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017235	AT	3	6	27212	27217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.