MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-4

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017234	TTAAT	2	10	1	10	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017234	ATTAA	2	10	39	48	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017234	ATAGC	2	10	1252	1261	40 %	20 %	20 %	20 %	384206320
4	NC_017234	TATAT	2	10	1730	1739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017234	AATTA	2	10	3687	3696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017234	CTTTT	2	10	6217	6226	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017234	AAATT	2	10	9147	9156	60 %	40 %	0 %	0 %	384206326
8	NC_017234	AAAGA	2	10	9686	9695	80 %	0 %	20 %	0 %	384206327
9	NC_017234	CAAAA	2	10	9998	10007	80 %	0 %	0 %	20 %	384206327
10	NC_017234	AAATA	2	10	10318	10327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017234	AATTA	2	10	11576	11585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017234	TAATA	2	10	13317	13326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017234	TAAAT	2	10	13467	13476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017234	TAAAT	2	10	13960	13969	60 %	40 %	0 %	0 %	384206332
15	NC_017234	TTGCT	2	10	14027	14036	0 %	60 %	20 %	20 %	384206332
16	NC_017234	ACTGA	2	10	14344	14353	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017234	TTTTA	2	10	14980	14989	20 %	80 %	0 %	0 %	384206333
18	NC_017234	ATAAA	2	10	15627	15636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017234	TAAAA	2	10	15732	15741	80 %	20 %	0 %	0 %	384206334
20	NC_017234	AAGAA	2	10	16260	16269	80 %	0 %	20 %	0 %	384206334
21	NC_017234	GTAAT	2	10	16286	16295	40 %	40 %	20 %	0 %	384206334
22	NC_017234	AGATA	2	10	16461	16470	60 %	20 %	20 %	0 %	384206334
23	NC_017234	GTATG	2	10	17215	17224	20 %	40 %	40 %	0 %	384206334
24	NC_017234	GAATT	2	10	17903	17912	40 %	40 %	20 %	0 %	384206334
25	NC_017234	CAAAA	2	10	18037	18046	80 %	0 %	0 %	20 %	384206334
26	NC_017234	TTTAA	2	10	18202	18211	40 %	60 %	0 %	0 %	384206334
27	NC_017234	TCAAT	2	10	18621	18630	40 %	40 %	0 %	20 %	384206334
28	NC_017234	ATTAT	2	10	20091	20100	40 %	60 %	0 %	0 %	384206336
29	NC_017234	AAGAG	2	10	20223	20232	60 %	0 %	40 %	0 %	384206336
30	NC_017234	AAATT	2	10	20693	20702	60 %	40 %	0 %	0 %	384206336
31	NC_017234	AGAAA	2	10	21524	21533	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017234	GAAAT	2	10	21803	21812	60 %	20 %	20 %	0 %	384206337

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.