MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-4

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017234	ATAGC	2	10	1252	1261	40 %	20 %	20 %	20 %	384206320
2	NC_017234	AAATT	2	10	9147	9156	60 %	40 %	0 %	0 %	384206326
3	NC_017234	AAAGA	2	10	9686	9695	80 %	0 %	20 %	0 %	384206327
4	NC_017234	CAAAA	2	10	9998	10007	80 %	0 %	0 %	20 %	384206327
5	NC_017234	TAAAT	2	10	13960	13969	60 %	40 %	0 %	0 %	384206332
6	NC_017234	TTGCT	2	10	14027	14036	0 %	60 %	20 %	20 %	384206332
7	NC_017234	TTTTA	2	10	14980	14989	20 %	80 %	0 %	0 %	384206333
8	NC_017234	TAAAA	2	10	15732	15741	80 %	20 %	0 %	0 %	384206334
9	NC_017234	AAGAA	2	10	16260	16269	80 %	0 %	20 %	0 %	384206334
10	NC_017234	GTAAT	2	10	16286	16295	40 %	40 %	20 %	0 %	384206334
11	NC_017234	AGATA	2	10	16461	16470	60 %	20 %	20 %	0 %	384206334
12	NC_017234	GTATG	2	10	17215	17224	20 %	40 %	40 %	0 %	384206334
13	NC_017234	GAATT	2	10	17903	17912	40 %	40 %	20 %	0 %	384206334
14	NC_017234	CAAAA	2	10	18037	18046	80 %	0 %	0 %	20 %	384206334
15	NC_017234	TTTAA	2	10	18202	18211	40 %	60 %	0 %	0 %	384206334
16	NC_017234	TCAAT	2	10	18621	18630	40 %	40 %	0 %	20 %	384206334
17	NC_017234	ATTAT	2	10	20091	20100	40 %	60 %	0 %	0 %	384206336
18	NC_017234	AAGAG	2	10	20223	20232	60 %	0 %	40 %	0 %	384206336
19	NC_017234	AAATT	2	10	20693	20702	60 %	40 %	0 %	0 %	384206336
20	NC_017234	GAAAT	2	10	21803	21812	60 %	20 %	20 %	0 %	384206337

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.