MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-4

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017234	AAAG	2	8	421	428	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017234	AATA	2	8	727	734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017234	ATAC	2	8	869	876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017234	TTTA	2	8	1652	1659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017234	ATTA	2	8	1682	1689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017234	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017234	TAAT	2	8	2132	2139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017234	ATTA	2	8	2155	2162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017234	TAAC	2	8	2238	2245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017234	ATTA	2	8	2401	2408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017234	TATG	2	8	2607	2614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017234	TAAA	2	8	2760	2767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017234	ATTA	2	8	4104	4111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017234	AATT	2	8	4211	4218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017234	TTAA	2	8	4547	4554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017234	TAAC	2	8	5805	5812	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017234	TAAT	2	8	6145	6152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017234	AAAT	2	8	6919	6926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017234	TAAA	2	8	8228	8235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017234	GATT	2	8	9572	9579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017234	TATT	2	8	10635	10642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017234	AAAT	2	8	11188	11195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017234	AGTA	2	8	11368	11375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017234	ATTG	2	8	11467	11474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017234	TAGA	2	8	11586	11593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017234	TAAA	2	8	12870	12877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017234	TCTT	2	8	12885	12892	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017234	TTAA	2	8	12911	12918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017234	AAAT	2	8	13258	13265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017234	TAAT	2	8	13330	13337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017234	ATTA	2	8	13348	13355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017234	TGAT	2	8	13440	13447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017234	TGAT	2	8	14169	14176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017234	GAAA	2	8	14192	14199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017234	TAAA	2	8	14364	14371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017234	TAAA	2	8	14769	14776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017234	TACT	2	8	14846	14853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017234	AGAA	2	8	19752	19759	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017234	ATTT	2	8	19822	19829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017234	AATT	2	8	19833	19840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017234	TTAA	2	8	21141	21148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017234	TTCT	2	8	21508	21515	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017234	TGAT	2	8	22114	22121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017234	AGGC	2	8	22337	22344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.