MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-4

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017234	TATG	2	8	916	923	25 %	50 %	25 %	0 %	384206320
2	NC_017234	AGAA	2	8	1280	1287	75 %	0 %	25 %	0 %	384206320
3	NC_017234	TAAT	2	8	1288	1295	50 %	50 %	0 %	0 %	384206320
4	NC_017234	TATT	2	8	4896	4903	25 %	75 %	0 %	0 %	384206322
5	NC_017234	TAAA	2	8	5004	5011	75 %	25 %	0 %	0 %	384206322
6	NC_017234	GAAT	2	8	5121	5128	50 %	25 %	25 %	0 %	384206322
7	NC_017234	TTGG	2	8	5139	5146	0 %	50 %	50 %	0 %	384206322
8	NC_017234	CAAC	2	8	7377	7384	50 %	0 %	0 %	50 %	384206324
9	NC_017234	AATA	2	8	7469	7476	75 %	25 %	0 %	0 %	384206324
10	NC_017234	AATT	2	8	7713	7720	50 %	50 %	0 %	0 %	384206324
11	NC_017234	ATAA	2	8	7781	7788	75 %	25 %	0 %	0 %	384206324
12	NC_017234	GAAA	2	8	7997	8004	75 %	0 %	25 %	0 %	384206324
13	NC_017234	AAAT	2	8	8040	8047	75 %	25 %	0 %	0 %	384206324
14	NC_017234	AATG	2	8	8413	8420	50 %	25 %	25 %	0 %	384206325
15	NC_017234	TTTA	2	8	8439	8446	25 %	75 %	0 %	0 %	384206325
16	NC_017234	AAAT	2	8	8980	8987	75 %	25 %	0 %	0 %	384206326
17	NC_017234	CTAT	2	8	9120	9127	25 %	50 %	0 %	25 %	384206326
18	NC_017234	AGTA	2	8	9392	9399	50 %	25 %	25 %	0 %	384206326
19	NC_017234	TAAA	2	8	9442	9449	75 %	25 %	0 %	0 %	384206326
20	NC_017234	GGGT	2	8	13743	13750	0 %	25 %	75 %	0 %	384206331
21	NC_017234	TAGA	2	8	13973	13980	50 %	25 %	25 %	0 %	384206332
22	NC_017234	TTTA	2	8	16242	16249	25 %	75 %	0 %	0 %	384206334
23	NC_017234	TATT	2	8	16487	16494	25 %	75 %	0 %	0 %	384206334
24	NC_017234	CTTG	2	8	16881	16888	0 %	50 %	25 %	25 %	384206334
25	NC_017234	TTAA	2	8	17716	17723	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
26	NC_017234	AGGA	2	8	17924	17931	50 %	0 %	50 %	0 %	384206334
27	NC_017234	GAAT	2	8	18264	18271	50 %	25 %	25 %	0 %	384206334
28	NC_017234	AGTA	2	8	18304	18311	50 %	25 %	25 %	0 %	384206334
29	NC_017234	TTAA	2	8	18601	18608	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
30	NC_017234	AAAG	2	8	18793	18800	75 %	0 %	25 %	0 %	384206334
31	NC_017234	GATA	2	8	18816	18823	50 %	25 %	25 %	0 %	384206334
32	NC_017234	TTAT	2	8	19009	19016	25 %	75 %	0 %	0 %	384206334
33	NC_017234	TAAA	2	8	19669	19676	75 %	25 %	0 %	0 %	384206335
34	NC_017234	ATGT	2	8	19709	19716	25 %	50 %	25 %	0 %	384206335
35	NC_017234	GGTA	2	8	20810	20817	25 %	25 %	50 %	0 %	384206336
36	NC_017234	TAAA	2	8	20847	20854	75 %	25 %	0 %	0 %	384206336
37	NC_017234	GATA	2	8	21756	21763	50 %	25 %	25 %	0 %	384206337
38	NC_017234	CTTT	2	8	21824	21831	0 %	75 %	0 %	25 %	384206337
39	NC_017234	AAAT	2	8	21977	21984	75 %	25 %	0 %	0 %	384206337

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.