MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-4

Total Repeats: 348

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017234	ATA	3	9	126	134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017234	GCA	3	9	321	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017234	GAT	2	6	337	342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017234	TAT	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017234	ATC	2	6	352	357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017234	TAG	2	6	498	503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017234	ATT	2	6	509	514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017234	ATT	2	6	578	583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017234	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017234	ATT	2	6	629	634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017234	AAT	2	6	706	711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017234	ATA	2	6	814	819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017234	TGT	2	6	836	841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017234	GAG	2	6	882	887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017234	ACA	2	6	904	909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206320
16	NC_017234	AAC	2	6	1049	1054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206320
17	NC_017234	ACC	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206320
18	NC_017234	AGA	2	6	1088	1093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206320
19	NC_017234	ATG	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206320
20	NC_017234	TGA	2	6	1193	1198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206320
21	NC_017234	ACA	2	6	1203	1208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206320
22	NC_017234	TTA	2	6	1419	1424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206320
23	NC_017234	GAT	2	6	1458	1463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206320
24	NC_017234	AAC	2	6	1538	1543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206320
25	NC_017234	TAT	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017234	TAA	2	6	1619	1624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017234	GAA	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017234	GCC	2	6	1863	1868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017234	TTA	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017234	TTA	2	6	1954	1959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017234	TAT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017234	TCT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017234	ATA	2	6	2333	2338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017234	ATT	2	6	2479	2484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017234	AAT	2	6	2507	2512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017234	ATA	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017234	TAT	2	6	2547	2552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017234	TAC	2	6	2594	2599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017234	TAA	2	6	2686	2691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017234	AGA	2	6	2710	2715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017234	AAG	2	6	2751	2756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017234	ACT	2	6	2782	2787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017234	GAA	2	6	2852	2857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206321
44	NC_017234	AGA	2	6	2914	2919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206321
45	NC_017234	AGA	2	6	2954	2959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206321
46	NC_017234	AGC	2	6	3059	3064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206321
47	NC_017234	TAT	2	6	3174	3179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206321
48	NC_017234	TAA	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206321
49	NC_017234	TTA	2	6	3218	3223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206321
50	NC_017234	TAA	2	6	3262	3267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206321
51	NC_017234	GAA	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206321
52	NC_017234	TAA	2	6	3354	3359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206321
53	NC_017234	TTA	2	6	3388	3393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017234	TTA	2	6	3460	3465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017234	ATT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017234	CCT	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017234	TAT	2	6	3810	3815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017234	AAT	2	6	3909	3914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017234	AAT	2	6	3958	3963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017234	ATT	2	6	3994	3999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017234	TAT	2	6	4029	4034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017234	TAA	3	9	4192	4200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017234	TTA	2	6	4368	4373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017234	ACT	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017234	ATT	2	6	4446	4451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017234	TCA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017234	TTA	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017234	TAA	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206322
69	NC_017234	AGA	3	9	4993	5001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206322
70	NC_017234	ACT	2	6	5026	5031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206322
71	NC_017234	AAT	2	6	5089	5094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206322
72	NC_017234	AGA	2	6	5198	5203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206322
73	NC_017234	AGC	2	6	5306	5311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206322
74	NC_017234	TAT	2	6	5421	5426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206322
75	NC_017234	TAA	2	6	5430	5435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206322
76	NC_017234	TTA	2	6	5465	5470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206322
77	NC_017234	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206322
78	NC_017234	TAA	2	6	5509	5514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017234	GAA	2	6	5564	5569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017234	ATC	2	6	5593	5598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017234	TTA	2	6	5632	5637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017234	TTA	2	6	5700	5705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017234	ATT	2	6	5728	5733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017234	AAT	2	6	5749	5754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017234	TTA	2	6	5824	5829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017234	ACC	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017234	TAA	2	6	5915	5920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017234	ATG	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017234	ACT	2	6	6039	6044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017234	AAT	2	6	6103	6108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017234	TTA	2	6	6231	6236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017234	ATT	2	6	6278	6283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017234	AAT	2	6	6375	6380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017234	ATT	2	6	6407	6412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017234	GTT	2	6	6416	6421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017234	ATA	2	6	6457	6462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017234	ATT	2	6	6506	6511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017234	TAA	2	6	6573	6578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017234	TTA	2	6	6602	6607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017234	TTG	2	6	6701	6706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017234	TTA	3	9	6732	6740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017234	TAT	2	6	6774	6779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017234	TTA	2	6	6870	6875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206323
104	NC_017234	GTA	2	6	6963	6968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017234	TAA	2	6	7004	7009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017234	TCT	2	6	7017	7022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017234	ATT	2	6	7044	7049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017234	AGT	2	6	7136	7141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017234	TTA	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206324
110	NC_017234	TAC	2	6	7424	7429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206324
111	NC_017234	AGA	2	6	7485	7490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206324
112	NC_017234	AAG	2	6	7545	7550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206324
113	NC_017234	TAA	5	15	7576	7590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
114	NC_017234	AGA	2	6	7597	7602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206324
115	NC_017234	TAA	2	6	7648	7653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
116	NC_017234	TTC	2	6	7677	7682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206324
117	NC_017234	AAT	2	6	7723	7728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
118	NC_017234	TAA	2	6	7758	7763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
119	NC_017234	AAT	4	12	7769	7780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
120	NC_017234	CAA	2	6	7874	7879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206324
121	NC_017234	TAA	2	6	7963	7968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
122	NC_017234	TTA	3	9	8167	8175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206324
123	NC_017234	ATT	2	6	8179	8184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206324
124	NC_017234	ATG	2	6	8374	8379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206325
125	NC_017234	ATA	2	6	8402	8407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206325
126	NC_017234	GAA	2	6	8461	8466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206325
127	NC_017234	AAG	2	6	8486	8491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206325
128	NC_017234	TAT	2	6	8512	8517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206325
129	NC_017234	TAC	2	6	8599	8604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206325
130	NC_017234	AGA	2	6	8766	8771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206325
131	NC_017234	ATA	2	6	8808	8813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206325
132	NC_017234	GGT	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206326
133	NC_017234	AAT	2	6	8858	8863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206326
134	NC_017234	TTA	2	6	8874	8879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
135	NC_017234	GCT	2	6	8922	8927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206326
136	NC_017234	TAT	3	9	8937	8945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
137	NC_017234	TAA	2	6	9020	9025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206326
138	NC_017234	TAT	2	6	9029	9034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
139	NC_017234	ATA	3	9	9043	9051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206326
140	NC_017234	TGA	2	6	9080	9085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206326
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274	NC_017234	ATT	2	6	17198	17203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206334
275	NC_017234	ATT	3	9	17275	17283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206334
276	NC_017234	TGC	2	6	17345	17350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206334
277	NC_017234	CAT	2	6	17461	17466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206334
278	NC_017234	AGA	2	6	17523	17528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
279	NC_017234	TAC	2	6	17625	17630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206334
280	NC_017234	AGA	2	6	17634	17639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
281	NC_017234	AAT	2	6	17703	17708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
282	NC_017234	TAG	2	6	17778	17783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206334
283	NC_017234	AAT	2	6	17821	17826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
284	NC_017234	TTA	2	6	17880	17885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206334
285	NC_017234	TCC	2	6	17952	17957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206334
286	NC_017234	ATC	2	6	18074	18079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206334
287	NC_017234	GAA	2	6	18100	18105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
288	NC_017234	GTG	2	6	18164	18169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206334
289	NC_017234	AGT	2	6	18448	18453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206334
290	NC_017234	ATT	2	6	18568	18573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206334
291	NC_017234	GAA	2	6	18589	18594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
292	NC_017234	TAA	2	6	18681	18686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
293	NC_017234	TTA	2	6	18697	18702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206334
294	NC_017234	TCA	2	6	18753	18758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206334
295	NC_017234	TGA	2	6	18783	18788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206334
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297	NC_017234	AGA	2	6	19057	19062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
298	NC_017234	GAA	2	6	19120	19125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
299	NC_017234	ATT	2	6	19142	19147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206334
300	NC_017234	CTT	2	6	19172	19177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206334
301	NC_017234	TAA	2	6	19242	19247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
302	NC_017234	AGA	2	6	19281	19286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
303	NC_017234	AAT	2	6	19315	19320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
304	NC_017234	AGA	2	6	19353	19358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
305	NC_017234	TAA	2	6	19427	19432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
306	NC_017234	ATT	2	6	19445	19450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206334
307	NC_017234	ATA	2	6	19457	19462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
308	NC_017234	ATT	2	6	19544	19549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_017234	TGA	2	6	19679	19684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206335
310	NC_017234	TAA	2	6	19724	19729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206335
311	NC_017234	AAG	2	6	19769	19774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
312	NC_017234	CAA	2	6	20106	20111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206336
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314	NC_017234	ATT	2	6	20178	20183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206336
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331	NC_017234	ATT	2	6	21023	21028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206336
332	NC_017234	ATA	2	6	21047	21052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_017234	ATT	3	9	21154	21162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
334	NC_017234	AGA	2	6	21183	21188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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339	NC_017234	TAA	2	6	21375	21380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
340	NC_017234	ATT	2	6	21412	21417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
341	NC_017234	TGA	2	6	21518	21523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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343	NC_017234	AAT	2	6	21620	21625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
344	NC_017234	TAA	2	6	21632	21637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
345	NC_017234	ATG	2	6	21650	21655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
346	NC_017234	TAT	2	6	21864	21869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206337
347	NC_017234	ATA	2	6	22215	22220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
348	NC_017234	ATA	2	6	22321	22326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.