MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-4

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017234	ATA	3	9	126	134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017234	GCA	3	9	321	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017234	GAT	2	6	337	342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017234	TAT	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017234	ATC	2	6	352	357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017234	TAG	2	6	498	503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017234	ATT	2	6	509	514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017234	ATT	2	6	578	583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017234	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017234	ATT	2	6	629	634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017234	AAT	2	6	706	711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017234	ATA	2	6	814	819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017234	TGT	2	6	836	841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017234	GAG	2	6	882	887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017234	TAT	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017234	TAA	2	6	1619	1624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017234	GAA	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017234	GCC	2	6	1863	1868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017234	TTA	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017234	TTA	2	6	1954	1959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017234	TAT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017234	TCT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017234	ATA	2	6	2333	2338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017234	ATT	2	6	2479	2484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017234	AAT	2	6	2507	2512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017234	ATA	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017234	TAT	2	6	2547	2552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017234	TAC	2	6	2594	2599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017234	TAA	2	6	2686	2691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017234	AGA	2	6	2710	2715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017234	AAG	2	6	2751	2756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017234	ACT	2	6	2782	2787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017234	TTA	2	6	3388	3393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017234	TTA	2	6	3460	3465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017234	ATT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017234	CCT	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017234	TAT	2	6	3810	3815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017234	AAT	2	6	3909	3914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017234	AAT	2	6	3958	3963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017234	ATT	2	6	3994	3999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017234	TAT	2	6	4029	4034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017234	TAA	3	9	4192	4200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017234	TTA	2	6	4368	4373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017234	ACT	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017234	ATT	2	6	4446	4451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017234	TCA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017234	TTA	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017234	TAA	2	6	5509	5514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017234	GAA	2	6	5564	5569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017234	ATC	2	6	5593	5598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017234	TTA	2	6	5632	5637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017234	TTA	2	6	5700	5705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017234	ATT	2	6	5728	5733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017234	AAT	2	6	5749	5754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017234	TTA	2	6	5824	5829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017234	ACC	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017234	TAA	2	6	5915	5920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017234	ATG	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017234	ACT	2	6	6039	6044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017234	AAT	2	6	6103	6108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017234	TTA	2	6	6231	6236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017234	ATT	2	6	6278	6283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017234	AAT	2	6	6375	6380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017234	ATT	2	6	6407	6412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017234	GTT	2	6	6416	6421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017234	ATA	2	6	6457	6462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017234	ATT	2	6	6506	6511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017234	TAA	2	6	6573	6578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017234	TTA	2	6	6602	6607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017234	TTG	2	6	6701	6706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017234	TTA	3	9	6732	6740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017234	TAT	2	6	6774	6779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017234	GTA	2	6	6963	6968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017234	TAA	2	6	7004	7009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017234	TCT	2	6	7017	7022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017234	ATT	2	6	7044	7049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017234	AGT	2	6	7136	7141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017234	TAA	2	6	9553	9558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017234	ATA	2	6	10340	10345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017234	TAA	2	6	10380	10385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017234	TAT	2	6	10445	10450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017234	TAA	2	6	10452	10457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017234	TAG	2	6	10467	10472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017234	CTT	2	6	10473	10478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017234	TAC	2	6	10594	10599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017234	ATA	2	6	10827	10832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017234	TAA	2	6	10924	10929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017234	AAG	2	6	10970	10975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017234	TGG	2	6	11019	11024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017234	CAA	2	6	11164	11169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017234	TAG	2	6	11269	11274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017234	TAT	2	6	11314	11319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017234	TAA	2	6	11343	11348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017234	TAT	2	6	11362	11367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017234	AAG	2	6	11408	11413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017234	TAT	2	6	11441	11446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017234	AAT	2	6	11488	11493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017234	ATT	3	9	11527	11535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017234	TAA	2	6	11539	11544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017234	TTA	2	6	11688	11693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017234	TAC	2	6	12074	12079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017234	TAT	2	6	12080	12085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017234	TAA	2	6	12121	12126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017234	CTT	2	6	12156	12161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017234	TCT	3	9	12195	12203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017234	TTC	3	9	12231	12239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017234	TTA	2	6	12287	12292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017234	CCG	2	6	12399	12404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017234	TTA	2	6	12429	12434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017234	CTT	2	6	12442	12447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017234	GAA	2	6	12579	12584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017234	TAT	2	6	12653	12658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017234	CTC	2	6	12680	12685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017234	TAA	2	6	12689	12694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017234	AAT	2	6	12766	12771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017234	CAC	2	6	12852	12857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017234	TAA	2	6	13120	13125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017234	TTC	2	6	13160	13165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017234	CTT	2	6	13184	13189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017234	TAA	2	6	13310	13315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017234	ATT	2	6	13359	13364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017234	AAT	3	9	13367	13375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017234	TTA	2	6	13380	13385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017234	ATA	2	6	13477	13482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017234	ATT	2	6	13621	13626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017234	AGA	2	6	14253	14258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017234	GAA	2	6	14305	14310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017234	ATT	2	6	14330	14335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017234	TGG	2	6	14337	14342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017234	TTA	2	6	14373	14378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017234	ATT	2	6	14462	14467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017234	TTA	2	6	14525	14530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017234	ATT	2	6	14559	14564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017234	ATT	2	6	14568	14573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017234	ATT	2	6	14613	14618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017234	GTT	2	6	14620	14625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017234	TCT	2	6	14657	14662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017234	TAT	2	6	14718	14723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017234	TTA	2	6	14738	14743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017234	GTT	2	6	14758	14763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017234	ATA	2	6	14787	14792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017234	GTA	3	9	14860	14868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017234	GCT	2	6	14893	14898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017234	TAT	2	6	15141	15146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017234	CTT	2	6	15208	15213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017234	ATT	2	6	15288	15293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017234	ATT	2	6	15324	15329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017234	ATA	3	9	15389	15397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017234	TTA	3	9	15399	15407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017234	CTT	2	6	15457	15462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017234	ATT	2	6	15613	15618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017234	ATT	2	6	19544	19549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017234	AAG	2	6	19769	19774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017234	ATA	2	6	21047	21052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017234	ATT	3	9	21154	21162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017234	AGA	2	6	21183	21188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017234	TGA	2	6	21202	21207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017234	TAA	3	9	21297	21305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017234	TAA	2	6	21345	21350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017234	AAG	2	6	21365	21370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017234	TAA	2	6	21375	21380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017234	ATT	2	6	21412	21417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017234	TGA	2	6	21518	21523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017234	AAT	2	6	21542	21547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017234	AAT	2	6	21620	21625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017234	TAA	2	6	21632	21637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017234	ATG	2	6	21650	21655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017234	ATA	2	6	22215	22220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017234	ATA	2	6	22321	22326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.