MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-4

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017234	ACA	2	6	904	909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206320
2	NC_017234	AAC	2	6	1049	1054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206320
3	NC_017234	ACC	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206320
4	NC_017234	AGA	2	6	1088	1093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206320
5	NC_017234	ATG	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206320
6	NC_017234	TGA	2	6	1193	1198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206320
7	NC_017234	ACA	2	6	1203	1208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206320
8	NC_017234	TTA	2	6	1419	1424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206320
9	NC_017234	GAT	2	6	1458	1463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206320
10	NC_017234	AAC	2	6	1538	1543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206320
11	NC_017234	GAA	2	6	2852	2857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206321
12	NC_017234	AGA	2	6	2914	2919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206321
13	NC_017234	AGA	2	6	2954	2959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206321
14	NC_017234	AGC	2	6	3059	3064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206321
15	NC_017234	TAT	2	6	3174	3179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206321
16	NC_017234	TAA	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206321
17	NC_017234	TTA	2	6	3218	3223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206321
18	NC_017234	TAA	2	6	3262	3267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206321
19	NC_017234	GAA	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206321
20	NC_017234	TAA	2	6	3354	3359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206321
21	NC_017234	TAA	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206322
22	NC_017234	AGA	3	9	4993	5001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206322
23	NC_017234	ACT	2	6	5026	5031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206322
24	NC_017234	AAT	2	6	5089	5094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206322
25	NC_017234	AGA	2	6	5198	5203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206322
26	NC_017234	AGC	2	6	5306	5311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206322
27	NC_017234	TAT	2	6	5421	5426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206322
28	NC_017234	TAA	2	6	5430	5435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206322
29	NC_017234	TTA	2	6	5465	5470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206322
30	NC_017234	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206322
31	NC_017234	TTA	2	6	6870	6875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206323
32	NC_017234	TTA	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206324
33	NC_017234	TAC	2	6	7424	7429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206324
34	NC_017234	AGA	2	6	7485	7490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206324
35	NC_017234	AAG	2	6	7545	7550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206324
36	NC_017234	TAA	5	15	7576	7590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
37	NC_017234	AGA	2	6	7597	7602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206324
38	NC_017234	TAA	2	6	7648	7653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
39	NC_017234	TTC	2	6	7677	7682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206324
40	NC_017234	AAT	2	6	7723	7728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
41	NC_017234	TAA	2	6	7758	7763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
42	NC_017234	AAT	4	12	7769	7780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
43	NC_017234	CAA	2	6	7874	7879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206324
44	NC_017234	TAA	2	6	7963	7968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206324
45	NC_017234	TTA	3	9	8167	8175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206324
46	NC_017234	ATT	2	6	8179	8184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206324
47	NC_017234	ATG	2	6	8374	8379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206325
48	NC_017234	ATA	2	6	8402	8407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206325
49	NC_017234	GAA	2	6	8461	8466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206325
50	NC_017234	AAG	2	6	8486	8491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206325
51	NC_017234	TAT	2	6	8512	8517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206325
52	NC_017234	TAC	2	6	8599	8604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206325
53	NC_017234	AGA	2	6	8766	8771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206325
54	NC_017234	ATA	2	6	8808	8813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206325
55	NC_017234	GGT	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206326
56	NC_017234	AAT	2	6	8858	8863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206326
57	NC_017234	TTA	2	6	8874	8879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
58	NC_017234	GCT	2	6	8922	8927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206326
59	NC_017234	TAT	3	9	8937	8945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
60	NC_017234	TAA	2	6	9020	9025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206326
61	NC_017234	TAT	2	6	9029	9034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
62	NC_017234	ATA	3	9	9043	9051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206326
63	NC_017234	TGA	2	6	9080	9085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206326
64	NC_017234	ATT	3	9	9097	9105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
65	NC_017234	TAG	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206326
66	NC_017234	CAG	2	6	9262	9267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206326
67	NC_017234	AAG	2	6	9313	9318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206326
68	NC_017234	TTA	2	6	9337	9342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
69	NC_017234	TAT	2	6	9491	9496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206326
70	NC_017234	ATA	2	6	9728	9733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206327
71	NC_017234	ATT	2	6	9754	9759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206327
72	NC_017234	AAG	2	6	9793	9798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206327
73	NC_017234	AGG	2	6	9810	9815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206327
74	NC_017234	CAG	2	6	9893	9898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206327
75	NC_017234	TTA	2	6	9910	9915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206327
76	NC_017234	AAT	2	6	9984	9989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206327
77	NC_017234	ATG	2	6	10090	10095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206327
78	NC_017234	TAA	2	6	10128	10133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206327
79	NC_017234	ATA	2	6	10163	10168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206327
80	NC_017234	TAA	2	6	10687	10692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206328
81	NC_017234	TAA	2	6	10761	10766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206328
82	NC_017234	TCA	2	6	11730	11735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206329
83	NC_017234	TTA	2	6	11844	11849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206329
84	NC_017234	TAG	2	6	11938	11943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206329
85	NC_017234	CAA	2	6	11957	11962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206329
86	NC_017234	TAA	2	6	12975	12980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206330
87	NC_017234	ATC	2	6	12995	13000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206330
88	NC_017234	AAT	2	6	13630	13635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206331
89	NC_017234	TAT	2	6	13639	13644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206331
90	NC_017234	TGT	2	6	13648	13653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206331
91	NC_017234	AGC	2	6	13688	13693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206331
92	NC_017234	GTT	2	6	13785	13790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206331
93	NC_017234	TAG	2	6	13927	13932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206332
94	NC_017234	AGA	2	6	13935	13940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206332
95	NC_017234	TCA	2	6	14993	14998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206333
96	NC_017234	TTA	2	6	15011	15016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206333
97	NC_017234	ATG	2	6	15650	15655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206334
98	NC_017234	GAT	2	6	15781	15786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206334
99	NC_017234	GAA	2	6	15832	15837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
100	NC_017234	AAC	2	6	15854	15859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206334
101	NC_017234	TAA	2	6	15939	15944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
102	NC_017234	ATA	2	6	15965	15970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
103	NC_017234	AGA	2	6	16062	16067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
104	NC_017234	GAA	2	6	16204	16209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
105	NC_017234	AGA	2	6	16212	16217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
106	NC_017234	GAC	2	6	16375	16380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206334
107	NC_017234	AAG	2	6	16415	16420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
108	NC_017234	GAA	2	6	16474	16479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
109	NC_017234	AGA	2	6	16551	16556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
110	NC_017234	ATA	2	6	16601	16606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
111	NC_017234	TTA	2	6	16610	16615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206334
112	NC_017234	AAG	2	6	16622	16627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
113	NC_017234	TAA	2	6	16640	16645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
114	NC_017234	TAA	2	6	16679	16684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
115	NC_017234	AGA	2	6	16716	16721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
116	NC_017234	ATA	2	6	16739	16744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
117	NC_017234	TGA	2	6	16761	16766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206334
118	NC_017234	AGA	2	6	16818	16823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
119	NC_017234	TTG	2	6	16928	16933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206334
120	NC_017234	AGA	2	6	17073	17078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
121	NC_017234	GAG	2	6	17110	17115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206334
122	NC_017234	AAT	2	6	17148	17153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
123	NC_017234	ATT	2	6	17198	17203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206334
124	NC_017234	ATT	3	9	17275	17283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206334
125	NC_017234	TGC	2	6	17345	17350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206334
126	NC_017234	CAT	2	6	17461	17466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206334
127	NC_017234	AGA	2	6	17523	17528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
128	NC_017234	TAC	2	6	17625	17630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206334
129	NC_017234	AGA	2	6	17634	17639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206334
130	NC_017234	AAT	2	6	17703	17708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206334
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.