MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-4

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017234	TA	3	6	108	113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017234	TG	3	6	922	927	0 %	50 %	50 %	0 %	384206320
3	NC_017234	TA	3	6	1770	1775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017234	AC	3	6	1845	1850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017234	TA	3	6	1939	1944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017234	AT	3	6	2412	2417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017234	TA	4	8	2492	2499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017234	AG	3	6	2726	2731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017234	AC	3	6	2820	2825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017234	TA	3	6	2837	2842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017234	AT	3	6	3436	3441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017234	AT	3	6	3774	3779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017234	TA	3	6	3834	3839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017234	AT	3	6	4308	4313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017234	AT	3	6	4321	4326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017234	AT	3	6	4750	4755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017234	AT	3	6	4805	4810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017234	TA	3	6	4880	4885	50 %	50 %	0 %	0 %	384206322
19	NC_017234	TA	3	6	5081	5086	50 %	50 %	0 %	0 %	384206322
20	NC_017234	GA	3	6	5180	5185	50 %	0 %	50 %	0 %	384206322
21	NC_017234	AT	5	10	5679	5688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017234	AC	3	6	5933	5938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017234	TA	3	6	6461	6466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017234	TA	3	6	6494	6499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017234	TA	3	6	6883	6888	50 %	50 %	0 %	0 %	384206323
26	NC_017234	TA	5	10	7102	7111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017234	AC	3	6	7173	7178	50 %	0 %	0 %	50 %	384206324
28	NC_017234	TA	3	6	7830	7835	50 %	50 %	0 %	0 %	384206324
29	NC_017234	TA	3	6	9069	9074	50 %	50 %	0 %	0 %	384206326
30	NC_017234	AT	3	6	9745	9750	50 %	50 %	0 %	0 %	384206327
31	NC_017234	AT	3	6	9876	9881	50 %	50 %	0 %	0 %	384206327
32	NC_017234	AT	3	6	10328	10333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017234	TA	3	6	10674	10679	50 %	50 %	0 %	0 %	384206328
34	NC_017234	TA	3	6	11102	11107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017234	AT	3	6	11390	11395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017234	AT	3	6	11714	11719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017234	TA	4	8	12034	12041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017234	TA	3	6	12313	12318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017234	AT	3	6	13047	13052	50 %	50 %	0 %	0 %	384206330
40	NC_017234	GT	4	8	13575	13582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017234	AT	3	6	14163	14168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017234	GA	3	6	14638	14643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017234	TA	3	6	14867	14872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017234	AT	3	6	15134	15139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017234	AT	3	6	15184	15189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017234	AT	3	6	15231	15236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017234	AT	3	6	15899	15904	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
48	NC_017234	AT	3	6	16176	16181	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
49	NC_017234	TA	4	8	16407	16414	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
50	NC_017234	TA	3	6	16514	16519	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
51	NC_017234	TA	3	6	17791	17796	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
52	NC_017234	AT	3	6	18296	18301	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
53	NC_017234	AT	3	6	18645	18650	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
54	NC_017234	TA	3	6	18967	18972	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
55	NC_017234	TA	3	6	19573	19578	50 %	50 %	0 %	0 %	384206335
56	NC_017234	AT	3	6	20595	20600	50 %	50 %	0 %	0 %	384206336
57	NC_017234	TA	3	6	21051	21056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017234	AT	4	8	21167	21174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017234	TA	3	6	21223	21228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017234	TA	3	6	21353	21358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017234	GT	4	8	21601	21608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017234	TG	3	6	21901	21906	0 %	50 %	50 %	0 %	384206337
63	NC_017234	AG	3	6	22062	22067	50 %	0 %	50 %	0 %	384206337

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.