MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-3

Total Repeats: 14

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017233	ATTAAT	2	12	1521	1532	50 %	50 %	0 %	0 %	384206299
2	NC_017233	TAGTAA	2	12	4269	4280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206303
3	NC_017233	AATTGC	2	12	4371	4382	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206303
4	NC_017233	TAATTT	2	12	5468	5479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206305
5	NC_017233	ATTTTG	2	12	7152	7163	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384206306
6	NC_017233	TTTTCT	2	12	8263	8274	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384206307
7	NC_017233	TTTTCA	2	12	12387	12398	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384206309
8	NC_017233	AATTAT	2	12	12400	12411	50 %	50 %	0 %	0 %	384206309
9	NC_017233	CTAAAA	2	12	13936	13947	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384206310
10	NC_017233	AGACTT	2	12	14422	14433	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206311
11	NC_017233	TAAAAA	2	12	19205	19216	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206316
12	NC_017233	TTGATC	2	12	22246	22257	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384206318
13	NC_017233	TCTTGA	2	12	22388	22399	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384206318
14	NC_017233	TAAAAA	2	12	22496	22507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206318

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.