MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-3

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017233	ATATT	3	15	3100	3114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017233	ATATA	2	10	3117	3126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017233	ATATA	2	10	3156	3165	60 %	40 %	0 %	0 %	384206302
4	NC_017233	TTATT	2	10	4787	4796	20 %	80 %	0 %	0 %	384206304
5	NC_017233	CTATT	2	10	6264	6273	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017233	ATTAA	2	10	6538	6547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017233	AAAAT	2	10	7567	7576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017233	ATTAA	2	10	8051	8060	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017233	AAGTA	2	10	8347	8356	60 %	20 %	20 %	0 %	384206307
10	NC_017233	AATTA	2	10	8961	8970	60 %	40 %	0 %	0 %	384206307
11	NC_017233	AATTC	2	10	9043	9052	40 %	40 %	0 %	20 %	384206307
12	NC_017233	TAAAT	2	10	9357	9366	60 %	40 %	0 %	0 %	384206307
13	NC_017233	TAAAA	2	10	11058	11067	80 %	20 %	0 %	0 %	384206307
14	NC_017233	TCAAA	2	10	12753	12762	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017233	CTAAA	2	10	14050	14059	60 %	20 %	0 %	20 %	384206310
16	NC_017233	ATAAA	2	10	14170	14179	80 %	20 %	0 %	0 %	384206310
17	NC_017233	AAATT	2	10	15773	15782	60 %	40 %	0 %	0 %	384206313
18	NC_017233	ATATA	2	10	16279	16288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017233	ATTAT	2	10	19233	19242	40 %	60 %	0 %	0 %	384206316
20	NC_017233	TAATA	3	15	19296	19310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017233	ATCAA	2	10	19476	19485	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017233	TTAAT	2	10	19567	19576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017233	ATTAA	2	10	19879	19888	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017233	ATTTT	2	10	20972	20981	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017233	ATTTA	2	10	21716	21725	40 %	60 %	0 %	0 %	384206318
26	NC_017233	ATTAT	2	10	22524	22533	40 %	60 %	0 %	0 %	384206318
27	NC_017233	ATTGT	2	10	22666	22675	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.