MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-3

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017233	TC	3	6	184	189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017233	CT	3	6	221	226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017233	AT	3	6	343	348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017233	TA	3	6	456	461	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
5	NC_017233	TA	3	6	588	593	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
6	NC_017233	AG	3	6	783	788	50 %	0 %	50 %	0 %	384206298
7	NC_017233	AG	3	6	1135	1140	50 %	0 %	50 %	0 %	384206298
8	NC_017233	AG	3	6	2555	2560	50 %	0 %	50 %	0 %	384206301
9	NC_017233	AT	4	8	3064	3071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017233	AT	3	6	3552	3557	50 %	50 %	0 %	0 %	384206302
11	NC_017233	AT	3	6	3949	3954	50 %	50 %	0 %	0 %	384206302
12	NC_017233	AT	3	6	4236	4241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017233	TA	3	6	4841	4846	50 %	50 %	0 %	0 %	384206304
14	NC_017233	AT	3	6	4983	4988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017233	TA	3	6	5006	5011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017233	AT	3	6	5044	5049	50 %	50 %	0 %	0 %	384206305
17	NC_017233	AT	3	6	5273	5278	50 %	50 %	0 %	0 %	384206305
18	NC_017233	AT	3	6	5299	5304	50 %	50 %	0 %	0 %	384206305
19	NC_017233	TA	4	8	5631	5638	50 %	50 %	0 %	0 %	384206305
20	NC_017233	AT	3	6	6392	6397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017233	AT	3	6	6615	6620	50 %	50 %	0 %	0 %	384206306
22	NC_017233	AG	3	6	7214	7219	50 %	0 %	50 %	0 %	384206306
23	NC_017233	AT	3	6	7225	7230	50 %	50 %	0 %	0 %	384206306
24	NC_017233	AT	3	6	8042	8047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017233	TA	3	6	8601	8606	50 %	50 %	0 %	0 %	384206307
26	NC_017233	AT	3	6	8917	8922	50 %	50 %	0 %	0 %	384206307
27	NC_017233	AT	3	6	11035	11040	50 %	50 %	0 %	0 %	384206307
28	NC_017233	AT	4	8	11142	11149	50 %	50 %	0 %	0 %	384206307
29	NC_017233	TC	3	6	11198	11203	0 %	50 %	0 %	50 %	384206307
30	NC_017233	AT	3	6	11374	11379	50 %	50 %	0 %	0 %	384206307
31	NC_017233	TA	3	6	11477	11482	50 %	50 %	0 %	0 %	384206307
32	NC_017233	AT	3	6	11873	11878	50 %	50 %	0 %	0 %	384206307
33	NC_017233	AC	3	6	12279	12284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017233	TA	3	6	12848	12853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017233	TA	4	8	13700	13707	50 %	50 %	0 %	0 %	384206310
36	NC_017233	TA	3	6	13855	13860	50 %	50 %	0 %	0 %	384206310
37	NC_017233	AT	3	6	13868	13873	50 %	50 %	0 %	0 %	384206310
38	NC_017233	AT	4	8	13876	13883	50 %	50 %	0 %	0 %	384206310
39	NC_017233	TA	3	6	14641	14646	50 %	50 %	0 %	0 %	384206311
40	NC_017233	TA	3	6	14741	14746	50 %	50 %	0 %	0 %	384206311
41	NC_017233	TA	3	6	15042	15047	50 %	50 %	0 %	0 %	384206312
42	NC_017233	AT	3	6	15416	15421	50 %	50 %	0 %	0 %	384206312
43	NC_017233	GA	3	6	15632	15637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017233	TA	3	6	15675	15680	50 %	50 %	0 %	0 %	384206313
45	NC_017233	AT	3	6	15919	15924	50 %	50 %	0 %	0 %	384206313
46	NC_017233	AT	3	6	16011	16016	50 %	50 %	0 %	0 %	384206313
47	NC_017233	TA	3	6	16038	16043	50 %	50 %	0 %	0 %	384206313
48	NC_017233	AT	3	6	16160	16165	50 %	50 %	0 %	0 %	384206313
49	NC_017233	AG	3	6	16174	16179	50 %	0 %	50 %	0 %	384206313
50	NC_017233	TC	4	8	16317	16324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017233	TA	3	6	16460	16465	50 %	50 %	0 %	0 %	384206314
52	NC_017233	TA	3	6	16753	16758	50 %	50 %	0 %	0 %	384206314
53	NC_017233	AT	3	6	16826	16831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017233	AT	3	6	17033	17038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017233	TA	3	6	17917	17922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017233	TA	3	6	19676	19681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017233	AT	3	6	19954	19959	50 %	50 %	0 %	0 %	384206317
58	NC_017233	AT	3	6	21209	21214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017233	AT	3	6	21518	21523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017233	AT	3	6	21839	21844	50 %	50 %	0 %	0 %	384206318
61	NC_017233	AT	3	6	22696	22701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.