MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-3

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017233	TA	3	6	456	461	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
2	NC_017233	TA	3	6	588	593	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
3	NC_017233	AG	3	6	783	788	50 %	0 %	50 %	0 %	384206298
4	NC_017233	AG	3	6	1135	1140	50 %	0 %	50 %	0 %	384206298
5	NC_017233	AG	3	6	2555	2560	50 %	0 %	50 %	0 %	384206301
6	NC_017233	AT	3	6	3552	3557	50 %	50 %	0 %	0 %	384206302
7	NC_017233	AT	3	6	3949	3954	50 %	50 %	0 %	0 %	384206302
8	NC_017233	TA	3	6	4841	4846	50 %	50 %	0 %	0 %	384206304
9	NC_017233	AT	3	6	5044	5049	50 %	50 %	0 %	0 %	384206305
10	NC_017233	AT	3	6	5273	5278	50 %	50 %	0 %	0 %	384206305
11	NC_017233	AT	3	6	5299	5304	50 %	50 %	0 %	0 %	384206305
12	NC_017233	TA	4	8	5631	5638	50 %	50 %	0 %	0 %	384206305
13	NC_017233	AT	3	6	6615	6620	50 %	50 %	0 %	0 %	384206306
14	NC_017233	AG	3	6	7214	7219	50 %	0 %	50 %	0 %	384206306
15	NC_017233	AT	3	6	7225	7230	50 %	50 %	0 %	0 %	384206306
16	NC_017233	TA	3	6	8601	8606	50 %	50 %	0 %	0 %	384206307
17	NC_017233	AT	3	6	8917	8922	50 %	50 %	0 %	0 %	384206307
18	NC_017233	AT	3	6	11035	11040	50 %	50 %	0 %	0 %	384206307
19	NC_017233	AT	4	8	11142	11149	50 %	50 %	0 %	0 %	384206307
20	NC_017233	TC	3	6	11198	11203	0 %	50 %	0 %	50 %	384206307
21	NC_017233	AT	3	6	11374	11379	50 %	50 %	0 %	0 %	384206307
22	NC_017233	TA	3	6	11477	11482	50 %	50 %	0 %	0 %	384206307
23	NC_017233	AT	3	6	11873	11878	50 %	50 %	0 %	0 %	384206307
24	NC_017233	TA	4	8	13700	13707	50 %	50 %	0 %	0 %	384206310
25	NC_017233	TA	3	6	13855	13860	50 %	50 %	0 %	0 %	384206310
26	NC_017233	AT	3	6	13868	13873	50 %	50 %	0 %	0 %	384206310
27	NC_017233	AT	4	8	13876	13883	50 %	50 %	0 %	0 %	384206310
28	NC_017233	TA	3	6	14641	14646	50 %	50 %	0 %	0 %	384206311
29	NC_017233	TA	3	6	14741	14746	50 %	50 %	0 %	0 %	384206311
30	NC_017233	TA	3	6	15042	15047	50 %	50 %	0 %	0 %	384206312
31	NC_017233	AT	3	6	15416	15421	50 %	50 %	0 %	0 %	384206312
32	NC_017233	TA	3	6	15675	15680	50 %	50 %	0 %	0 %	384206313
33	NC_017233	AT	3	6	15919	15924	50 %	50 %	0 %	0 %	384206313
34	NC_017233	AT	3	6	16011	16016	50 %	50 %	0 %	0 %	384206313
35	NC_017233	TA	3	6	16038	16043	50 %	50 %	0 %	0 %	384206313
36	NC_017233	AT	3	6	16160	16165	50 %	50 %	0 %	0 %	384206313
37	NC_017233	AG	3	6	16174	16179	50 %	0 %	50 %	0 %	384206313
38	NC_017233	TA	3	6	16460	16465	50 %	50 %	0 %	0 %	384206314
39	NC_017233	TA	3	6	16753	16758	50 %	50 %	0 %	0 %	384206314
40	NC_017233	AT	3	6	19954	19959	50 %	50 %	0 %	0 %	384206317
41	NC_017233	AT	3	6	21839	21844	50 %	50 %	0 %	0 %	384206318

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.