MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp17

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017232	CTCATA	2	12	1240	1251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206381
2	NC_017232	TCAAAA	2	12	2239	2250	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384206384
3	NC_017232	ATTACG	2	12	6122	6133	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206389
4	NC_017232	ACAAAA	2	12	6145	6156	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384206389
5	NC_017232	AGCTTA	2	12	8138	8149	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017232	AATTAA	2	12	8857	8868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017232	AAGTTT	2	12	13246	13257	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206396
8	NC_017232	CAAAAT	2	12	15143	15154	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384206397
9	NC_017232	TAAAAA	2	12	16303	16314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206398
10	NC_017232	TTTAAA	2	12	17279	17290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017232	TAATAT	2	12	18238	18249	50 %	50 %	0 %	0 %	384206399
12	NC_017232	TAAAAT	2	12	18493	18504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206400
13	NC_017232	ATTAAT	2	12	18614	18625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017232	GAGGGG	2	12	19036	19047	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	384206401
15	NC_017232	AAATTA	2	12	19558	19569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017232	AAAGAA	2	12	20413	20424	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384206403
17	NC_017232	ATTATG	2	12	20489	20500	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206403
18	NC_017232	AAATTA	2	12	23501	23512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017232	AGTTTT	2	12	24594	24605	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.