MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp17

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017232	ATGC	2	8	135	142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017232	TAAA	3	12	159	170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017232	ATTA	2	8	392	399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017232	GCTT	2	8	848	855	0 %	50 %	25 %	25 %	384206381
5	NC_017232	TCTT	2	8	1701	1708	0 %	75 %	0 %	25 %	384206383
6	NC_017232	TTTA	2	8	1845	1852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017232	AACT	2	8	1870	1877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017232	TTTG	2	8	2419	2426	0 %	75 %	25 %	0 %	384206385
9	NC_017232	AGAT	2	8	2595	2602	50 %	25 %	25 %	0 %	384206386
10	NC_017232	ATTA	2	8	3330	3337	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
11	NC_017232	ATTA	2	8	3351	3358	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
12	NC_017232	ATTA	2	8	3372	3379	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
13	NC_017232	ATTA	2	8	3393	3400	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
14	NC_017232	ATTA	2	8	3414	3421	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
15	NC_017232	TAAT	2	8	3733	3740	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
16	NC_017232	ACAA	2	8	4068	4075	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017232	ATTT	2	8	4277	4284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017232	CTAC	2	8	4394	4401	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017232	TGAA	2	8	4939	4946	50 %	25 %	25 %	0 %	384206388
20	NC_017232	AACT	2	8	5090	5097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017232	ATTA	2	8	5124	5131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017232	TATT	2	8	5613	5620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017232	TTTC	2	8	5655	5662	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017232	CTTT	2	8	5906	5913	0 %	75 %	0 %	25 %	384206389
25	NC_017232	AAAT	2	8	5948	5955	75 %	25 %	0 %	0 %	384206389
26	NC_017232	GATA	2	8	6270	6277	50 %	25 %	25 %	0 %	384206389
27	NC_017232	AATT	2	8	6764	6771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017232	AATA	2	8	6865	6872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017232	TAAA	2	8	7049	7056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017232	ATTA	2	8	7096	7103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017232	ATTT	2	8	7104	7111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017232	ATTA	2	8	7451	7458	50 %	50 %	0 %	0 %	384206390
33	NC_017232	TCTA	2	8	7464	7471	25 %	50 %	0 %	25 %	384206390
34	NC_017232	AATC	2	8	7528	7535	50 %	25 %	0 %	25 %	384206390
35	NC_017232	AATG	2	8	7598	7605	50 %	25 %	25 %	0 %	384206390
36	NC_017232	GATT	2	8	8012	8019	25 %	50 %	25 %	0 %	384206390
37	NC_017232	TCCT	2	8	8116	8123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017232	CATT	2	8	8741	8748	25 %	50 %	0 %	25 %	384206391
39	NC_017232	TATT	2	8	8773	8780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017232	TAAA	2	8	8827	8834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017232	TACT	2	8	9004	9011	25 %	50 %	0 %	25 %	384206392
42	NC_017232	CAAA	2	8	9086	9093	75 %	0 %	0 %	25 %	384206392
43	NC_017232	GATT	2	8	9277	9284	25 %	50 %	25 %	0 %	384206392
44	NC_017232	ACCT	2	8	10020	10027	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017232	AGCA	2	8	10322	10329	50 %	0 %	25 %	25 %	384206393
46	NC_017232	TTGT	2	8	10463	10470	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017232	ATCA	2	8	10856	10863	50 %	25 %	0 %	25 %	384206394
48	NC_017232	GCAA	2	8	11250	11257	50 %	0 %	25 %	25 %	384206394
49	NC_017232	AAAT	2	8	11429	11436	75 %	25 %	0 %	0 %	384206394
50	NC_017232	TAAA	2	8	11527	11534	75 %	25 %	0 %	0 %	384206394
51	NC_017232	AAAG	2	8	11541	11548	75 %	0 %	25 %	0 %	384206394
52	NC_017232	TTAA	2	8	11659	11666	50 %	50 %	0 %	0 %	384206394
53	NC_017232	TAAA	2	8	11699	11706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017232	TAAA	2	8	11837	11844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017232	TAAA	2	8	11977	11984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017232	CTTT	2	8	12347	12354	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017232	ATAA	2	8	12427	12434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017232	AGAT	2	8	12441	12448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017232	AGAA	2	8	13040	13047	75 %	0 %	25 %	0 %	384206396
60	NC_017232	AGTG	2	8	13690	13697	25 %	25 %	50 %	0 %	384206396
61	NC_017232	TAAA	2	8	13972	13979	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017232	ATTA	2	8	14043	14050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017232	GATT	2	8	14171	14178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017232	TTAT	2	8	14265	14272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017232	TTAA	2	8	14601	14608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017232	TATT	2	8	14786	14793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017232	TAAT	2	8	15194	15201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017232	TTTA	2	8	15462	15469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017232	ATAC	2	8	15529	15536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017232	TGTA	2	8	15616	15623	25 %	50 %	25 %	0 %	384206398
71	NC_017232	GTTT	2	8	15777	15784	0 %	75 %	25 %	0 %	384206398
72	NC_017232	CTTA	2	8	16358	16365	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017232	ATTT	2	8	17178	17185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017232	TAAA	2	8	17241	17248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017232	CTTT	2	8	17260	17267	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017232	ATCT	2	8	17344	17351	25 %	50 %	0 %	25 %	384206399
77	NC_017232	TTGA	2	8	17692	17699	25 %	50 %	25 %	0 %	384206399
78	NC_017232	ATTA	2	8	17704	17711	50 %	50 %	0 %	0 %	384206399
79	NC_017232	GTTT	2	8	18080	18087	0 %	75 %	25 %	0 %	384206399
80	NC_017232	TTTA	2	8	18828	18835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017232	ACAT	2	8	18926	18933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017232	TAAA	2	8	19273	19280	75 %	25 %	0 %	0 %	384206401
83	NC_017232	ATTT	2	8	19609	19616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017232	AATA	2	8	19625	19632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017232	ACTT	2	8	19746	19753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017232	ACAA	2	8	19897	19904	75 %	0 %	0 %	25 %	384206402
87	NC_017232	TGAT	2	8	20113	20120	25 %	50 %	25 %	0 %	384206402
88	NC_017232	ATGT	2	8	20237	20244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017232	AATA	2	8	20589	20596	75 %	25 %	0 %	0 %	384206403
90	NC_017232	TATT	2	8	20808	20815	25 %	75 %	0 %	0 %	384206403
91	NC_017232	TATT	2	8	20913	20920	25 %	75 %	0 %	0 %	384206403
92	NC_017232	CTAA	2	8	20984	20991	50 %	25 %	0 %	25 %	384206403
93	NC_017232	ATTT	2	8	21301	21308	25 %	75 %	0 %	0 %	384206404
94	NC_017232	AAGA	2	8	21957	21964	75 %	0 %	25 %	0 %	384206405
95	NC_017232	AGTA	2	8	22436	22443	50 %	25 %	25 %	0 %	384206405
96	NC_017232	ATCA	2	8	22458	22465	50 %	25 %	0 %	25 %	384206405
97	NC_017232	GATA	2	8	22794	22801	50 %	25 %	25 %	0 %	384206405
98	NC_017232	CAAG	2	8	22810	22817	50 %	0 %	25 %	25 %	384206405
99	NC_017232	TAAA	2	8	23164	23171	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017232	TTGT	2	8	23173	23180	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017232	TAAT	2	8	23229	23236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017232	CAAA	2	8	23295	23302	75 %	0 %	0 %	25 %	384206406
103	NC_017232	TGAA	2	8	23587	23594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017232	TATG	2	8	23884	23891	25 %	50 %	25 %	0 %	384206407
105	NC_017232	CTGT	2	8	23918	23925	0 %	50 %	25 %	25 %	384206407
106	NC_017232	TTTG	2	8	24272	24279	0 %	75 %	25 %	0 %	384206407
107	NC_017232	AAAT	2	8	24562	24569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.