MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp17

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017232	GCTT	2	8	848	855	0 %	50 %	25 %	25 %	384206381
2	NC_017232	TCTT	2	8	1701	1708	0 %	75 %	0 %	25 %	384206383
3	NC_017232	TTTG	2	8	2419	2426	0 %	75 %	25 %	0 %	384206385
4	NC_017232	AGAT	2	8	2595	2602	50 %	25 %	25 %	0 %	384206386
5	NC_017232	ATTA	2	8	3330	3337	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
6	NC_017232	ATTA	2	8	3351	3358	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
7	NC_017232	ATTA	2	8	3372	3379	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
8	NC_017232	ATTA	2	8	3393	3400	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
9	NC_017232	ATTA	2	8	3414	3421	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
10	NC_017232	TAAT	2	8	3733	3740	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
11	NC_017232	TGAA	2	8	4939	4946	50 %	25 %	25 %	0 %	384206388
12	NC_017232	CTTT	2	8	5906	5913	0 %	75 %	0 %	25 %	384206389
13	NC_017232	AAAT	2	8	5948	5955	75 %	25 %	0 %	0 %	384206389
14	NC_017232	GATA	2	8	6270	6277	50 %	25 %	25 %	0 %	384206389
15	NC_017232	ATTA	2	8	7451	7458	50 %	50 %	0 %	0 %	384206390
16	NC_017232	TCTA	2	8	7464	7471	25 %	50 %	0 %	25 %	384206390
17	NC_017232	AATC	2	8	7528	7535	50 %	25 %	0 %	25 %	384206390
18	NC_017232	AATG	2	8	7598	7605	50 %	25 %	25 %	0 %	384206390
19	NC_017232	GATT	2	8	8012	8019	25 %	50 %	25 %	0 %	384206390
20	NC_017232	CATT	2	8	8741	8748	25 %	50 %	0 %	25 %	384206391
21	NC_017232	TACT	2	8	9004	9011	25 %	50 %	0 %	25 %	384206392
22	NC_017232	CAAA	2	8	9086	9093	75 %	0 %	0 %	25 %	384206392
23	NC_017232	GATT	2	8	9277	9284	25 %	50 %	25 %	0 %	384206392
24	NC_017232	AGCA	2	8	10322	10329	50 %	0 %	25 %	25 %	384206393
25	NC_017232	ATCA	2	8	10856	10863	50 %	25 %	0 %	25 %	384206394
26	NC_017232	GCAA	2	8	11250	11257	50 %	0 %	25 %	25 %	384206394
27	NC_017232	AAAT	2	8	11429	11436	75 %	25 %	0 %	0 %	384206394
28	NC_017232	TAAA	2	8	11527	11534	75 %	25 %	0 %	0 %	384206394
29	NC_017232	AAAG	2	8	11541	11548	75 %	0 %	25 %	0 %	384206394
30	NC_017232	TTAA	2	8	11659	11666	50 %	50 %	0 %	0 %	384206394
31	NC_017232	AGAA	2	8	13040	13047	75 %	0 %	25 %	0 %	384206396
32	NC_017232	AGTG	2	8	13690	13697	25 %	25 %	50 %	0 %	384206396
33	NC_017232	TGTA	2	8	15616	15623	25 %	50 %	25 %	0 %	384206398
34	NC_017232	GTTT	2	8	15777	15784	0 %	75 %	25 %	0 %	384206398
35	NC_017232	ATCT	2	8	17344	17351	25 %	50 %	0 %	25 %	384206399
36	NC_017232	TTGA	2	8	17692	17699	25 %	50 %	25 %	0 %	384206399
37	NC_017232	ATTA	2	8	17704	17711	50 %	50 %	0 %	0 %	384206399
38	NC_017232	GTTT	2	8	18080	18087	0 %	75 %	25 %	0 %	384206399
39	NC_017232	TAAA	2	8	19273	19280	75 %	25 %	0 %	0 %	384206401
40	NC_017232	ACAA	2	8	19897	19904	75 %	0 %	0 %	25 %	384206402
41	NC_017232	TGAT	2	8	20113	20120	25 %	50 %	25 %	0 %	384206402
42	NC_017232	AATA	2	8	20589	20596	75 %	25 %	0 %	0 %	384206403
43	NC_017232	TATT	2	8	20808	20815	25 %	75 %	0 %	0 %	384206403
44	NC_017232	TATT	2	8	20913	20920	25 %	75 %	0 %	0 %	384206403
45	NC_017232	CTAA	2	8	20984	20991	50 %	25 %	0 %	25 %	384206403
46	NC_017232	ATTT	2	8	21301	21308	25 %	75 %	0 %	0 %	384206404
47	NC_017232	AAGA	2	8	21957	21964	75 %	0 %	25 %	0 %	384206405
48	NC_017232	AGTA	2	8	22436	22443	50 %	25 %	25 %	0 %	384206405
49	NC_017232	ATCA	2	8	22458	22465	50 %	25 %	0 %	25 %	384206405
50	NC_017232	GATA	2	8	22794	22801	50 %	25 %	25 %	0 %	384206405
51	NC_017232	CAAG	2	8	22810	22817	50 %	0 %	25 %	25 %	384206405
52	NC_017232	CAAA	2	8	23295	23302	75 %	0 %	0 %	25 %	384206406
53	NC_017232	TATG	2	8	23884	23891	25 %	50 %	25 %	0 %	384206407
54	NC_017232	CTGT	2	8	23918	23925	0 %	50 %	25 %	25 %	384206407
55	NC_017232	TTTG	2	8	24272	24279	0 %	75 %	25 %	0 %	384206407

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.