MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp17

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017232	AT	3	6	1787	1792	50 %	50 %	0 %	0 %	384206383
2	NC_017232	AT	3	6	1983	1988	50 %	50 %	0 %	0 %	384206384
3	NC_017232	TA	3	6	2312	2317	50 %	50 %	0 %	0 %	384206385
4	NC_017232	CA	3	6	2877	2882	50 %	0 %	0 %	50 %	384206386
5	NC_017232	CA	3	6	3043	3048	50 %	0 %	0 %	50 %	384206386
6	NC_017232	AT	3	6	3431	3436	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
7	NC_017232	AT	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
8	NC_017232	AT	3	6	3473	3478	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
9	NC_017232	AT	3	6	3494	3499	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
10	NC_017232	AT	3	6	3515	3520	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
11	NC_017232	AT	3	6	3536	3541	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
12	NC_017232	AT	3	6	3557	3562	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
13	NC_017232	AT	3	6	3578	3583	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
14	NC_017232	AT	3	6	3599	3604	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
15	NC_017232	AT	3	6	3620	3625	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
16	NC_017232	AT	3	6	3641	3646	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
17	NC_017232	AT	3	6	3662	3667	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
18	NC_017232	AT	3	6	3683	3688	50 %	50 %	0 %	0 %	384206387
19	NC_017232	AT	3	6	5003	5008	50 %	50 %	0 %	0 %	384206388
20	NC_017232	AT	3	6	7385	7390	50 %	50 %	0 %	0 %	384206390
21	NC_017232	AT	3	6	7669	7674	50 %	50 %	0 %	0 %	384206390
22	NC_017232	TC	3	6	7774	7779	0 %	50 %	0 %	50 %	384206390
23	NC_017232	AT	3	6	10127	10132	50 %	50 %	0 %	0 %	384206393
24	NC_017232	AT	3	6	10394	10399	50 %	50 %	0 %	0 %	384206393
25	NC_017232	AT	3	6	10809	10814	50 %	50 %	0 %	0 %	384206394
26	NC_017232	AT	3	6	10879	10884	50 %	50 %	0 %	0 %	384206394
27	NC_017232	TA	3	6	10959	10964	50 %	50 %	0 %	0 %	384206394
28	NC_017232	AT	3	6	11243	11248	50 %	50 %	0 %	0 %	384206394
29	NC_017232	TA	3	6	11562	11567	50 %	50 %	0 %	0 %	384206394
30	NC_017232	GT	3	6	11608	11613	0 %	50 %	50 %	0 %	384206394
31	NC_017232	AT	3	6	12623	12628	50 %	50 %	0 %	0 %	384206395
32	NC_017232	TG	3	6	12728	12733	0 %	50 %	50 %	0 %	384206395
33	NC_017232	TG	3	6	12954	12959	0 %	50 %	50 %	0 %	384206396
34	NC_017232	AT	3	6	13535	13540	50 %	50 %	0 %	0 %	384206396
35	NC_017232	AT	3	6	13733	13738	50 %	50 %	0 %	0 %	384206396
36	NC_017232	CT	3	6	17676	17681	0 %	50 %	0 %	50 %	384206399
37	NC_017232	AT	3	6	19260	19265	50 %	50 %	0 %	0 %	384206401
38	NC_017232	AG	3	6	20508	20513	50 %	0 %	50 %	0 %	384206403
39	NC_017232	TA	3	6	20932	20937	50 %	50 %	0 %	0 %	384206403
40	NC_017232	AT	3	6	21207	21212	50 %	50 %	0 %	0 %	384206404
41	NC_017232	TA	3	6	21397	21402	50 %	50 %	0 %	0 %	384206404
42	NC_017232	AT	3	6	21873	21878	50 %	50 %	0 %	0 %	384206405
43	NC_017232	TA	3	6	22221	22226	50 %	50 %	0 %	0 %	384206405
44	NC_017232	TA	4	8	24467	24474	50 %	50 %	0 %	0 %	384206408

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.