MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-7

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017231	ATTT	3	12	572	583	25 %	75 %	0 %	0 %	384206263
2	NC_017231	TTAA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	384206263
3	NC_017231	AGTA	2	8	1109	1116	50 %	25 %	25 %	0 %	384206263
4	NC_017231	AGTA	2	8	1205	1212	50 %	25 %	25 %	0 %	384206263
5	NC_017231	AATC	2	8	1406	1413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017231	TAAA	2	8	1428	1435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017231	GAAA	3	12	2096	2107	75 %	0 %	25 %	0 %	384206265
8	NC_017231	TTAT	2	8	2113	2120	25 %	75 %	0 %	0 %	384206265
9	NC_017231	CAAG	2	8	2172	2179	50 %	0 %	25 %	25 %	384206265
10	NC_017231	TTAC	2	8	2611	2618	25 %	50 %	0 %	25 %	384206265
11	NC_017231	TGCT	2	8	2978	2985	0 %	50 %	25 %	25 %	384206266
12	NC_017231	ATTT	2	8	3375	3382	25 %	75 %	0 %	0 %	384206267
13	NC_017231	CTTA	2	8	3561	3568	25 %	50 %	0 %	25 %	384206267
14	NC_017231	AAAT	2	8	3604	3611	75 %	25 %	0 %	0 %	384206268
15	NC_017231	CTTG	2	8	3668	3675	0 %	50 %	25 %	25 %	384206268
16	NC_017231	AATT	2	8	3814	3821	50 %	50 %	0 %	0 %	384206268
17	NC_017231	AAAC	2	8	4014	4021	75 %	0 %	0 %	25 %	384206269
18	NC_017231	CAAG	2	8	4480	4487	50 %	0 %	25 %	25 %	384206269
19	NC_017231	TTGG	3	12	4996	5007	0 %	50 %	50 %	0 %	384206269
20	NC_017231	AAAT	2	8	6586	6593	75 %	25 %	0 %	0 %	384206271
21	NC_017231	TCAA	2	8	7050	7057	50 %	25 %	0 %	25 %	384206272
22	NC_017231	GAAA	2	8	7215	7222	75 %	0 %	25 %	0 %	384206272
23	NC_017231	GTTT	2	8	7340	7347	0 %	75 %	25 %	0 %	384206272
24	NC_017231	TTAT	2	8	7470	7477	25 %	75 %	0 %	0 %	384206273
25	NC_017231	TAAT	2	8	7881	7888	50 %	50 %	0 %	0 %	384206274
26	NC_017231	GAGG	2	8	8177	8184	25 %	0 %	75 %	0 %	384206274
27	NC_017231	CAAA	2	8	8504	8511	75 %	0 %	0 %	25 %	384206274
28	NC_017231	ATTT	2	8	8979	8986	25 %	75 %	0 %	0 %	384206275
29	NC_017231	ATTA	2	8	9024	9031	50 %	50 %	0 %	0 %	384206275
30	NC_017231	ATAA	2	8	9157	9164	75 %	25 %	0 %	0 %	384206275
31	NC_017231	CTAT	2	8	10235	10242	25 %	50 %	0 %	25 %	384206277
32	NC_017231	ATCA	2	8	10535	10542	50 %	25 %	0 %	25 %	384206278
33	NC_017231	AGGA	2	8	10608	10615	50 %	0 %	50 %	0 %	384206278
34	NC_017231	CTAT	2	8	10620	10627	25 %	50 %	0 %	25 %	384206278
35	NC_017231	TTAC	2	8	10997	11004	25 %	50 %	0 %	25 %	384206280
36	NC_017231	TCAA	2	8	11228	11235	50 %	25 %	0 %	25 %	384206280
37	NC_017231	CTAA	2	8	11385	11392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017231	TTAT	2	8	11608	11615	25 %	75 %	0 %	0 %	384206281
39	NC_017231	AAAC	2	8	11784	11791	75 %	0 %	0 %	25 %	384206281
40	NC_017231	AAAG	2	8	12389	12396	75 %	0 %	25 %	0 %	384206282
41	NC_017231	CAAG	2	8	12495	12502	50 %	0 %	25 %	25 %	384206282
42	NC_017231	TGTT	2	8	12567	12574	0 %	75 %	25 %	0 %	384206283
43	NC_017231	ATAA	2	8	12936	12943	75 %	25 %	0 %	0 %	384206283
44	NC_017231	TTGT	2	8	14043	14050	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017231	AATA	2	8	14085	14092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017231	TAAT	2	8	14330	14337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017231	TTTC	2	8	15082	15089	0 %	75 %	0 %	25 %	384206285
48	NC_017231	ATTT	2	8	15617	15624	25 %	75 %	0 %	0 %	384206286
49	NC_017231	GAAT	2	8	15997	16004	50 %	25 %	25 %	0 %	384206286
50	NC_017231	TAAA	2	8	16749	16756	75 %	25 %	0 %	0 %	384206287
51	NC_017231	ATTT	2	8	16773	16780	25 %	75 %	0 %	0 %	384206287
52	NC_017231	TAAA	2	8	16875	16882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017231	TGAA	2	8	16932	16939	50 %	25 %	25 %	0 %	384206288
54	NC_017231	ATAG	2	8	17654	17661	50 %	25 %	25 %	0 %	384206289
55	NC_017231	ATAG	2	8	17675	17682	50 %	25 %	25 %	0 %	384206289
56	NC_017231	AGAT	2	8	17694	17701	50 %	25 %	25 %	0 %	384206289
57	NC_017231	ATTT	3	12	17727	17738	25 %	75 %	0 %	0 %	384206289
58	NC_017231	TTTA	2	8	17920	17927	25 %	75 %	0 %	0 %	384206289
59	NC_017231	TTTA	2	8	18600	18607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017231	ACAA	2	8	18640	18647	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017231	AAAT	2	8	19089	19096	75 %	25 %	0 %	0 %	384206290
62	NC_017231	GATG	2	8	19171	19178	25 %	25 %	50 %	0 %	384206290
63	NC_017231	TAAA	2	8	19721	19728	75 %	25 %	0 %	0 %	384206290
64	NC_017231	AGAT	2	8	19884	19891	50 %	25 %	25 %	0 %	384206290
65	NC_017231	AGAA	2	8	20366	20373	75 %	0 %	25 %	0 %	384206291
66	NC_017231	ATAG	2	8	20447	20454	50 %	25 %	25 %	0 %	384206291
67	NC_017231	AAAT	3	12	20608	20619	75 %	25 %	0 %	0 %	384206292
68	NC_017231	ATTT	2	8	20638	20645	25 %	75 %	0 %	0 %	384206292
69	NC_017231	CCAG	2	8	20993	21000	25 %	0 %	25 %	50 %	384206292
70	NC_017231	AAGA	2	8	21424	21431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017231	TGTT	2	8	21684	21691	0 %	75 %	25 %	0 %	384206293
72	NC_017231	AATA	2	8	22811	22818	75 %	25 %	0 %	0 %	384206294
73	NC_017231	TATT	2	8	23030	23037	25 %	75 %	0 %	0 %	384206294
74	NC_017231	TATT	2	8	23138	23145	25 %	75 %	0 %	0 %	384206294
75	NC_017231	CTAA	2	8	23209	23216	50 %	25 %	0 %	25 %	384206294
76	NC_017231	CAAA	2	8	23922	23929	75 %	0 %	0 %	25 %	384206296
77	NC_017231	TAGC	2	8	24118	24125	25 %	25 %	25 %	25 %	384206296
78	NC_017231	ACAA	2	8	24306	24313	75 %	0 %	0 %	25 %	384206296
79	NC_017231	AGCA	2	8	24686	24693	50 %	0 %	25 %	25 %	384206296

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.