MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-7

Total Repeats: 319

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017231	AGA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206263
2	NC_017231	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206263
3	NC_017231	ACT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206263
4	NC_017231	TAA	2	6	448	453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206263
5	NC_017231	ATA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206263
6	NC_017231	CAA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206263
7	NC_017231	CTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206263
8	NC_017231	AGT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206263
9	NC_017231	TAA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206263
10	NC_017231	TTA	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206263
11	NC_017231	ATG	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206263
12	NC_017231	ATT	2	6	1047	1052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206263
13	NC_017231	TAA	2	6	1240	1245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206263
14	NC_017231	GAG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206263
15	NC_017231	ATT	2	6	1273	1278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206263
16	NC_017231	TTA	2	6	1482	1487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206264
17	NC_017231	AGG	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206264
18	NC_017231	ATT	2	6	1645	1650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206265
19	NC_017231	TGC	2	6	1700	1705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206265
20	NC_017231	TAA	2	6	1733	1738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206265
21	NC_017231	GAG	2	6	1899	1904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206265
22	NC_017231	TGT	2	6	1940	1945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206265
23	NC_017231	TTA	2	6	1948	1953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206265
24	NC_017231	GAT	2	6	1974	1979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206265
25	NC_017231	GAC	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206265
26	NC_017231	GTC	2	6	2021	2026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206265
27	NC_017231	TAA	2	6	2123	2128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206265
28	NC_017231	CTA	2	6	2218	2223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206265
29	NC_017231	CAC	2	6	2224	2229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206265
30	NC_017231	TGA	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206265
31	NC_017231	TGC	2	6	2240	2245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206265
32	NC_017231	CTT	2	6	2286	2291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206265
33	NC_017231	TTG	2	6	2398	2403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206265
34	NC_017231	GTG	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206265
35	NC_017231	CTA	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206265
36	NC_017231	ACT	2	6	2534	2539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206265
37	NC_017231	TAC	2	6	2651	2656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206265
38	NC_017231	TGG	2	6	2748	2753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206266
39	NC_017231	ACA	2	6	2797	2802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206266
40	NC_017231	GTT	2	6	2809	2814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206266
41	NC_017231	TAA	2	6	2840	2845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206266
42	NC_017231	ATT	2	6	3016	3021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206266
43	NC_017231	GAA	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206266
44	NC_017231	AAG	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206266
45	NC_017231	CAG	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206266
46	NC_017231	TTA	2	6	3149	3154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206267
47	NC_017231	TAT	2	6	3385	3390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206267
48	NC_017231	TTG	2	6	3401	3406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206267
49	NC_017231	TAT	2	6	3408	3413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206267
50	NC_017231	AAT	2	6	3493	3498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206267
51	NC_017231	GAT	2	6	3529	3534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206267
52	NC_017231	GAT	2	6	3732	3737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206268
53	NC_017231	ATG	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206268
54	NC_017231	GCA	2	6	3886	3891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206269
55	NC_017231	AAG	2	6	4121	4126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206269
56	NC_017231	TTG	2	6	4241	4246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206269
57	NC_017231	AGC	2	6	4302	4307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206269
58	NC_017231	AGG	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206269
59	NC_017231	AGA	2	6	4464	4469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206269
60	NC_017231	GCG	2	6	4589	4594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206269
61	NC_017231	CTA	2	6	4654	4659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206269
62	NC_017231	AGA	2	6	4689	4694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206269
63	NC_017231	AGA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206269
64	NC_017231	ACC	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206269
65	NC_017231	CCT	2	6	5029	5034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206269
66	NC_017231	ATT	2	6	5175	5180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206270
67	NC_017231	AAT	2	6	5181	5186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206270
68	NC_017231	ATA	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206270
69	NC_017231	TAA	2	6	5299	5304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206270
70	NC_017231	GTT	2	6	5455	5460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206270
71	NC_017231	TTA	2	6	5473	5478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206270
72	NC_017231	TAT	2	6	5481	5486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206270
73	NC_017231	GTG	2	6	5548	5553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206270
74	NC_017231	ACT	2	6	5598	5603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206270
75	NC_017231	AAC	2	6	5650	5655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206270
76	NC_017231	TGA	2	6	5765	5770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206270
77	NC_017231	AGT	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206270
78	NC_017231	ATG	2	6	5899	5904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206271
79	NC_017231	AGA	2	6	5918	5923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206271
80	NC_017231	ACA	2	6	5948	5953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206271
81	NC_017231	TTA	2	6	6210	6215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206271
82	NC_017231	CTT	2	6	6227	6232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206271
83	NC_017231	AGA	2	6	6527	6532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206271
84	NC_017231	CAA	2	6	6555	6560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206271
85	NC_017231	ACC	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206271
86	NC_017231	AGA	2	6	6807	6812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206272
87	NC_017231	AAG	2	6	6863	6868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206272
88	NC_017231	AGC	2	6	6932	6937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206272
89	NC_017231	TAC	2	6	7043	7048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206272
90	NC_017231	CAT	2	6	7102	7107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206272
91	NC_017231	TAG	2	6	7179	7184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206272
92	NC_017231	AAC	2	6	7203	7208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206272
93	NC_017231	TAT	2	6	7233	7238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206272
94	NC_017231	AAT	2	6	7281	7286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206272
95	NC_017231	AAT	2	6	7401	7406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206273
96	NC_017231	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206273
97	NC_017231	TTG	2	6	7438	7443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206273
98	NC_017231	ACT	2	6	7531	7536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206273
99	NC_017231	TGA	2	6	7816	7821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206274
100	NC_017231	ACA	2	6	7839	7844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206274
101	NC_017231	TCT	2	6	7853	7858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206274
102	NC_017231	GAA	3	9	7871	7879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206274
103	NC_017231	GGT	2	6	7922	7927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206274
104	NC_017231	GCT	2	6	7937	7942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206274
105	NC_017231	GAA	2	6	7946	7951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206274
106	NC_017231	TCT	2	6	7958	7963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206274
107	NC_017231	AGA	2	6	8074	8079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206274
108	NC_017231	TAA	2	6	8092	8097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206274
109	NC_017231	AAC	2	6	8108	8113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206274
110	NC_017231	AAC	2	6	8152	8157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206274
111	NC_017231	ATT	2	6	8345	8350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206274
112	NC_017231	ATG	2	6	8529	8534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206274
113	NC_017231	ACT	2	6	8566	8571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206274
114	NC_017231	TGA	2	6	8859	8864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206275
115	NC_017231	TAC	2	6	8913	8918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206275
116	NC_017231	TAC	2	6	8973	8978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206275
117	NC_017231	ATT	2	6	9130	9135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206275
118	NC_017231	GAA	3	9	9220	9228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206276
119	NC_017231	TGA	2	6	9240	9245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206276
120	NC_017231	AGA	2	6	9246	9251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206276
121	NC_017231	AAC	2	6	9282	9287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206276
122	NC_017231	AAC	2	6	9292	9297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206276
123	NC_017231	TGA	2	6	9315	9320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206276
124	NC_017231	AGT	2	6	9331	9336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206276
125	NC_017231	GAA	2	6	9439	9444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206276
126	NC_017231	TGA	2	6	9453	9458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206276
127	NC_017231	TAA	2	6	9507	9512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206276
128	NC_017231	ATC	2	6	9570	9575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206276
129	NC_017231	TCT	2	6	9613	9618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206276
130	NC_017231	GAT	2	6	9844	9849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206276
131	NC_017231	AGT	2	6	9939	9944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206276
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.