MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-1

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017230	TTGATT	2	12	414	425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384206221
2	NC_017230	CTGATA	2	12	2971	2982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206224
3	NC_017230	GAATTT	2	12	5193	5204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206227
4	NC_017230	TAGTGG	2	12	5255	5266	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384206227
5	NC_017230	AATGGA	2	12	6880	6891	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384206231
6	NC_017230	CTAAAT	2	12	9647	9658	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206235
7	NC_017230	CAAAAA	2	12	10165	10176	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384206235
8	NC_017230	CAAAAA	2	12	12578	12589	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384206239
9	NC_017230	CTTAAT	2	12	13120	13131	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384206240
10	NC_017230	TAATGA	2	12	14909	14920	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206242
11	NC_017230	AATGGT	2	12	15390	15401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206243
12	NC_017230	AAAAGT	2	12	16270	16281	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384206246
13	NC_017230	AATAAA	2	12	21718	21729	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206253
14	NC_017230	TTAAAA	2	12	24579	24590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206255
15	NC_017230	AAAAGA	2	12	26939	26950	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384206258

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.