MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-1

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017230	ATTA	2	8	943	950	50 %	50 %	0 %	0 %	384206221
2	NC_017230	AGTA	2	8	1109	1116	50 %	25 %	25 %	0 %	384206221
3	NC_017230	AGTA	2	8	1205	1212	50 %	25 %	25 %	0 %	384206221
4	NC_017230	AATT	2	8	1895	1902	50 %	50 %	0 %	0 %	384206222
5	NC_017230	TTAT	2	8	2519	2526	25 %	75 %	0 %	0 %	384206223
6	NC_017230	GTAA	2	8	2566	2573	50 %	25 %	25 %	0 %	384206223
7	NC_017230	GCAG	2	8	2627	2634	25 %	0 %	50 %	25 %	384206224
8	NC_017230	CAAG	2	8	2664	2671	50 %	0 %	25 %	25 %	384206224
9	NC_017230	GAGC	2	8	2826	2833	25 %	0 %	50 %	25 %	384206224
10	NC_017230	ATGT	2	8	3001	3008	25 %	50 %	25 %	0 %	384206224
11	NC_017230	ATAA	2	8	3108	3115	75 %	25 %	0 %	0 %	384206224
12	NC_017230	CAAT	2	8	3190	3197	50 %	25 %	0 %	25 %	384206224
13	NC_017230	AGAT	2	8	3233	3240	50 %	25 %	25 %	0 %	384206224
14	NC_017230	AATG	2	8	3355	3362	50 %	25 %	25 %	0 %	384206225
15	NC_017230	GTAA	2	8	3918	3925	50 %	25 %	25 %	0 %	384206225
16	NC_017230	TCAT	2	8	4832	4839	25 %	50 %	0 %	25 %	384206226
17	NC_017230	AGTG	2	8	5386	5393	25 %	25 %	50 %	0 %	384206227
18	NC_017230	AGTA	2	8	5528	5535	50 %	25 %	25 %	0 %	384206228
19	NC_017230	GGAC	2	8	5760	5767	25 %	0 %	50 %	25 %	384206228
20	NC_017230	TTGG	2	8	5792	5799	0 %	50 %	50 %	0 %	384206229
21	NC_017230	ATGC	2	8	5959	5966	25 %	25 %	25 %	25 %	384206229
22	NC_017230	AACT	2	8	6119	6126	50 %	25 %	0 %	25 %	384206229
23	NC_017230	AATC	2	8	6513	6520	50 %	25 %	0 %	25 %	384206230
24	NC_017230	TAAA	2	8	6535	6542	75 %	25 %	0 %	0 %	384206230
25	NC_017230	AGAA	2	8	7206	7213	75 %	0 %	25 %	0 %	384206231
26	NC_017230	TTAT	2	8	7220	7227	25 %	75 %	0 %	0 %	384206231
27	NC_017230	CAAG	2	8	7279	7286	50 %	0 %	25 %	25 %	384206231
28	NC_017230	TGCT	2	8	8085	8092	0 %	50 %	25 %	25 %	384206232
29	NC_017230	ATTT	2	8	8482	8489	25 %	75 %	0 %	0 %	384206233
30	NC_017230	CTTA	2	8	8668	8675	25 %	50 %	0 %	25 %	384206233
31	NC_017230	AATT	2	8	8921	8928	50 %	50 %	0 %	0 %	384206234
32	NC_017230	CAAG	2	8	9605	9612	50 %	0 %	25 %	25 %	384206235
33	NC_017230	GTTG	2	8	9877	9884	0 %	50 %	50 %	0 %	384206235
34	NC_017230	TTGG	3	12	10121	10132	0 %	50 %	50 %	0 %	384206235
35	NC_017230	AAAT	2	8	11712	11719	75 %	25 %	0 %	0 %	384206237
36	NC_017230	TCAA	2	8	12176	12183	50 %	25 %	0 %	25 %	384206238
37	NC_017230	GAAA	2	8	12341	12348	75 %	0 %	25 %	0 %	384206238
38	NC_017230	GTTT	2	8	12460	12467	0 %	75 %	25 %	0 %	384206238
39	NC_017230	TTAT	2	8	12590	12597	25 %	75 %	0 %	0 %	384206239
40	NC_017230	TAAT	2	8	13001	13008	50 %	50 %	0 %	0 %	384206240
41	NC_017230	CAAA	2	8	13624	13631	75 %	0 %	0 %	25 %	384206240
42	NC_017230	ATTT	2	8	14099	14106	25 %	75 %	0 %	0 %	384206241
43	NC_017230	ATTA	2	8	14144	14151	50 %	50 %	0 %	0 %	384206241
44	NC_017230	ATAA	2	8	14277	14284	75 %	25 %	0 %	0 %	384206241
45	NC_017230	TGAT	2	8	15484	15491	25 %	50 %	25 %	0 %	384206244
46	NC_017230	ACTC	2	8	15638	15645	25 %	25 %	0 %	50 %	384206244
47	NC_017230	AAAT	2	8	15658	15665	75 %	25 %	0 %	0 %	384206244
48	NC_017230	GGAA	2	8	15734	15741	50 %	0 %	50 %	0 %	384206244
49	NC_017230	TTAC	2	8	16121	16128	25 %	50 %	0 %	25 %	384206246
50	NC_017230	TCAA	2	8	16352	16359	50 %	25 %	0 %	25 %	384206246
51	NC_017230	CTAA	2	8	16509	16516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017230	ATAG	2	8	16797	16804	50 %	25 %	25 %	0 %	384206247
53	NC_017230	GAAT	2	8	16877	16884	50 %	25 %	25 %	0 %	384206247
54	NC_017230	AATT	2	8	17077	17084	50 %	50 %	0 %	0 %	384206247
55	NC_017230	ATTT	2	8	18133	18140	25 %	75 %	0 %	0 %	384206249
56	NC_017230	TTTA	2	8	18742	18749	25 %	75 %	0 %	0 %	384206249
57	NC_017230	AGGT	2	8	19036	19043	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017230	ATTT	2	8	19106	19113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017230	TAAT	2	8	19138	19145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017230	AAAT	2	8	19996	20003	75 %	25 %	0 %	0 %	384206250
61	NC_017230	AATC	2	8	20101	20108	50 %	25 %	0 %	25 %	384206250
62	NC_017230	ATTT	2	8	20423	20430	25 %	75 %	0 %	0 %	384206251
63	NC_017230	GAAT	2	8	20803	20810	50 %	25 %	25 %	0 %	384206251
64	NC_017230	TAGA	2	8	21591	21598	50 %	25 %	25 %	0 %	384206252
65	NC_017230	AAAG	2	8	22139	22146	75 %	0 %	25 %	0 %	384206253
66	NC_017230	ATAG	2	8	22535	22542	50 %	25 %	25 %	0 %	384206254
67	NC_017230	ATAG	2	8	22556	22563	50 %	25 %	25 %	0 %	384206254
68	NC_017230	TTTA	2	8	22735	22742	25 %	75 %	0 %	0 %	384206254
69	NC_017230	AAAT	2	8	23893	23900	75 %	25 %	0 %	0 %	384206255
70	NC_017230	GATG	2	8	23975	23982	25 %	25 %	50 %	0 %	384206255
71	NC_017230	TAAA	2	8	24525	24532	75 %	25 %	0 %	0 %	384206255
72	NC_017230	AGAT	2	8	24688	24695	50 %	25 %	25 %	0 %	384206255
73	NC_017230	AGAA	2	8	25169	25176	75 %	0 %	25 %	0 %	384206256
74	NC_017230	ATAG	2	8	25250	25257	50 %	25 %	25 %	0 %	384206256
75	NC_017230	AAAT	3	12	25411	25422	75 %	25 %	0 %	0 %	384206257
76	NC_017230	ATTT	2	8	25441	25448	25 %	75 %	0 %	0 %	384206257
77	NC_017230	TTTG	2	8	25709	25716	0 %	75 %	25 %	0 %	384206257
78	NC_017230	CCAG	2	8	25796	25803	25 %	0 %	25 %	50 %	384206257
79	NC_017230	TTTA	2	8	26006	26013	25 %	75 %	0 %	0 %	384206257
80	NC_017230	AAGA	2	8	26227	26234	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017230	AGAA	2	8	26608	26615	75 %	0 %	25 %	0 %	384206258
82	NC_017230	TATT	2	8	27241	27248	25 %	75 %	0 %	0 %	384206258
83	NC_017230	TAAA	2	8	27527	27534	75 %	25 %	0 %	0 %	384206258
84	NC_017230	ATTT	2	8	27600	27607	25 %	75 %	0 %	0 %	384206259
85	NC_017230	CAAT	2	8	27639	27646	50 %	25 %	0 %	25 %	384206259
86	NC_017230	ATAA	2	8	27921	27928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017230	CAAA	2	8	28660	28667	75 %	0 %	0 %	25 %	384206261
88	NC_017230	TAGC	2	8	28856	28863	25 %	25 %	25 %	25 %	384206261
89	NC_017230	ACAA	2	8	29044	29051	75 %	0 %	0 %	25 %	384206261
90	NC_017230	AGCA	2	8	29424	29431	50 %	0 %	25 %	25 %	384206261
91	NC_017230	TTTA	2	8	29663	29670	25 %	75 %	0 %	0 %	384206261

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.