MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-1

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017230	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017230	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017230	AGA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206221
4	NC_017230	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206221
5	NC_017230	ACT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206221
6	NC_017230	TAA	3	9	448	456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206221
7	NC_017230	ATA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206221
8	NC_017230	CAA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206221
9	NC_017230	CTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206221
10	NC_017230	AGT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206221
11	NC_017230	TAA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206221
12	NC_017230	TTA	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206221
13	NC_017230	ATG	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206221
14	NC_017230	ATT	2	6	1047	1052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206221
15	NC_017230	TAA	2	6	1240	1245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206221
16	NC_017230	GAG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206221
17	NC_017230	ATT	2	6	1273	1278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206221
18	NC_017230	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206222
19	NC_017230	AAG	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206222
20	NC_017230	AGG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206222
21	NC_017230	CAG	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206222
22	NC_017230	AGC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206222
23	NC_017230	TAA	2	6	1601	1606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206222
24	NC_017230	TTC	3	9	1811	1819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206222
25	NC_017230	ATT	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206222
26	NC_017230	AGA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206222
27	NC_017230	AGA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206223
28	NC_017230	CAA	2	6	2087	2092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206223
29	NC_017230	TGG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206223
30	NC_017230	AGC	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206223
31	NC_017230	TGG	3	9	2278	2286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206223
32	NC_017230	TGA	2	6	2287	2292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206223
33	NC_017230	ACT	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206223
34	NC_017230	AGA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206223
35	NC_017230	GTT	2	6	2601	2606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206224
36	NC_017230	GCT	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206224
37	NC_017230	GAT	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206224
38	NC_017230	GTT	2	6	2806	2811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206224
39	NC_017230	TAA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206224
40	NC_017230	TTA	2	6	3124	3129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206224
41	NC_017230	ATT	2	6	3253	3258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206224
42	NC_017230	ATA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206224
43	NC_017230	TGG	2	6	3326	3331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206224
44	NC_017230	AGG	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017230	ATC	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206225
46	NC_017230	TGG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206225
47	NC_017230	AAT	2	6	3717	3722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206225
48	NC_017230	TAG	2	6	3736	3741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206225
49	NC_017230	GCA	2	6	3816	3821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206225
50	NC_017230	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206225
51	NC_017230	TAA	2	6	3930	3935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206225
52	NC_017230	AGG	2	6	3941	3946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017230	ATT	2	6	3959	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
54	NC_017230	TGA	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206226
55	NC_017230	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
56	NC_017230	TAT	2	6	4022	4027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
57	NC_017230	AGA	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206226
58	NC_017230	AGT	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206226
59	NC_017230	TAA	3	9	4277	4285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206226
60	NC_017230	ATT	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
61	NC_017230	TTA	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
62	NC_017230	ACT	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206226
63	NC_017230	AGA	2	6	4451	4456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206226
64	NC_017230	GTG	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206226
65	NC_017230	ATG	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206226
66	NC_017230	CAG	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206226
67	NC_017230	GCA	2	6	4620	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206226
68	NC_017230	TAA	2	6	4676	4681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206226
69	NC_017230	CTA	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206226
70	NC_017230	GAA	3	9	4971	4979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206227
71	NC_017230	GTT	2	6	5184	5189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206227
72	NC_017230	ATT	2	6	5245	5250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206227
73	NC_017230	TGT	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206228
74	NC_017230	GAC	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206228
75	NC_017230	TTA	2	6	5553	5558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206228
76	NC_017230	GGC	2	6	5839	5844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206229
77	NC_017230	CAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206229
78	NC_017230	GTA	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206229
79	NC_017230	TTG	2	6	6092	6097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206229
80	NC_017230	AAT	2	6	6216	6221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206230
81	NC_017230	ATC	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206230
82	NC_017230	ACT	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206230
83	NC_017230	ATA	2	6	6484	6489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206230
84	NC_017230	TAA	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206230
85	NC_017230	AAT	2	6	6659	6664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206230
86	NC_017230	AGG	2	6	6676	6681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206230
87	NC_017230	ATT	2	6	6752	6757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206231
88	NC_017230	TGC	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206231
89	NC_017230	TAA	2	6	6840	6845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206231
90	NC_017230	GAG	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206231
91	NC_017230	TGT	2	6	7047	7052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206231
92	NC_017230	TTA	2	6	7055	7060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206231
93	NC_017230	GAT	2	6	7081	7086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206231
94	NC_017230	GAC	2	6	7105	7110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206231
95	NC_017230	AAT	2	6	7231	7236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206231
96	NC_017230	CTA	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206231
97	NC_017230	CAC	2	6	7331	7336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206231
98	NC_017230	TGA	2	6	7341	7346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206231
99	NC_017230	TGC	2	6	7347	7352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206231
100	NC_017230	CTT	2	6	7393	7398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206231
101	NC_017230	TTG	2	6	7505	7510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206231
102	NC_017230	GTG	2	6	7574	7579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206231
103	NC_017230	ACT	2	6	7641	7646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206231
104	NC_017230	ATG	2	6	7739	7744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206231
105	NC_017230	TAC	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206231
106	NC_017230	GGT	2	6	7856	7861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206232
107	NC_017230	ACA	2	6	7904	7909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206232
108	NC_017230	GTT	2	6	7916	7921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206232
109	NC_017230	TAA	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206232
110	NC_017230	ATT	2	6	8123	8128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206232
111	NC_017230	GAA	2	6	8150	8155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206232
112	NC_017230	AAG	2	6	8161	8166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206232
113	NC_017230	CAG	2	6	8172	8177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206232
114	NC_017230	TTA	2	6	8256	8261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206233
115	NC_017230	TAT	2	6	8492	8497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206233
116	NC_017230	TTG	2	6	8508	8513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206233
117	NC_017230	TAT	2	6	8515	8520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206233
118	NC_017230	AAT	2	6	8600	8605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206233
119	NC_017230	GAT	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206233
120	NC_017230	GAT	2	6	8839	8844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206234
121	NC_017230	ATG	2	6	8861	8866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206234
122	NC_017230	TTG	2	6	9348	9353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206235
123	NC_017230	AGA	2	6	9589	9594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206235
124	NC_017230	GCG	2	6	9714	9719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206235
125	NC_017230	CTA	2	6	9779	9784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206235
126	NC_017230	AGA	2	6	9814	9819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206235
127	NC_017230	AGA	2	6	9937	9942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206235
128	NC_017230	ACC	2	6	9989	9994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206235
129	NC_017230	CCT	2	6	10154	10159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206235
130	NC_017230	ATT	2	6	10301	10306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206236
131	NC_017230	AAT	2	6	10307	10312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206236
132	NC_017230	ATA	2	6	10365	10370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206236
133	NC_017230	TAA	2	6	10425	10430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206236
134	NC_017230	GTT	2	6	10581	10586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206236
135	NC_017230	TTA	2	6	10599	10604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206236
136	NC_017230	TAT	2	6	10607	10612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206236
137	NC_017230	GTG	2	6	10674	10679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206236
138	NC_017230	ACT	2	6	10724	10729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206236
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140	NC_017230	TGA	2	6	10891	10896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206236
141	NC_017230	AGT	2	6	10921	10926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206236
142	NC_017230	ATG	2	6	11025	11030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206237
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144	NC_017230	ACA	2	6	11074	11079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206237
145	NC_017230	TTA	2	6	11336	11341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206237
146	NC_017230	CTT	2	6	11353	11358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206237
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148	NC_017230	CAA	2	6	11681	11686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206237
149	NC_017230	ACC	2	6	11813	11818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206237
150	NC_017230	AGA	2	6	11933	11938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206238
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152	NC_017230	AGC	2	6	12058	12063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206238
153	NC_017230	TAC	2	6	12169	12174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206238
154	NC_017230	CAT	2	6	12228	12233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206238
155	NC_017230	TAG	2	6	12305	12310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206238
156	NC_017230	AAC	2	6	12329	12334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206238
157	NC_017230	TAT	2	6	12359	12364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206238
158	NC_017230	AAT	2	6	12401	12406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206238
159	NC_017230	AAT	2	6	12521	12526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206239
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161	NC_017230	TTG	2	6	12558	12563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206239
162	NC_017230	ACT	2	6	12651	12656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206239
163	NC_017230	TGA	2	6	12936	12941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206240
164	NC_017230	ACA	2	6	12959	12964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206240
165	NC_017230	TCT	2	6	12973	12978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206240
166	NC_017230	GAA	3	9	12991	12999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206240
167	NC_017230	GGT	2	6	13042	13047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206240
168	NC_017230	GCT	2	6	13057	13062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206240
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170	NC_017230	TCT	2	6	13078	13083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206240
171	NC_017230	AGA	2	6	13194	13199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206240
172	NC_017230	TAA	2	6	13212	13217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206240
173	NC_017230	AAC	2	6	13228	13233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206240
174	NC_017230	AAC	2	6	13272	13277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206240
175	NC_017230	ATT	2	6	13465	13470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206240
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183	NC_017230	TGA	2	6	14360	14365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206242
184	NC_017230	AGA	2	6	14366	14371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206242
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186	NC_017230	AAC	2	6	14412	14417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206242
187	NC_017230	TGA	2	6	14435	14440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206242
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191	NC_017230	AAT	2	6	14628	14633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206242
192	NC_017230	ATC	2	6	14690	14695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206242
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196	NC_017230	GGT	2	6	15091	15096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206242
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199	NC_017230	TTC	2	6	15325	15330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206243
200	NC_017230	GCT	2	6	15338	15343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206243
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202	NC_017230	CAA	2	6	15622	15627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206244
203	NC_017230	TGA	2	6	15689	15694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206244
204	NC_017230	CAA	2	6	15938	15943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206245
205	NC_017230	AGA	2	6	15951	15956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206245
206	NC_017230	ATA	2	6	15988	15993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206245
207	NC_017230	TAA	3	9	16005	16013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206245
208	NC_017230	TAA	2	6	16017	16022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206245
209	NC_017230	ACT	2	6	16113	16118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206246
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211	NC_017230	ACC	2	6	16177	16182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206246
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214	NC_017230	GTT	2	6	16463	16468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
215	NC_017230	ATA	2	6	16525	16530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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220	NC_017230	AAT	2	6	17144	17149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206247
221	NC_017230	TAG	3	9	17164	17172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206247
222	NC_017230	CAT	2	6	17189	17194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206247
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224	NC_017230	AAC	2	6	17289	17294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
225	NC_017230	AAT	2	6	17447	17452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206248
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241	NC_017230	TCA	2	6	17960	17965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206249
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245	NC_017230	CAT	2	6	18096	18101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206249
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248	NC_017230	TAT	2	6	18159	18164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206249
249	NC_017230	CTT	2	6	18210	18215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206249
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253	NC_017230	TTA	2	6	18353	18358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206249
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255	NC_017230	TAA	2	6	18603	18608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206249
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257	NC_017230	TCT	2	6	18799	18804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206249
258	NC_017230	TAT	2	6	18825	18830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206249
259	NC_017230	ATG	2	6	18869	18874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206249
260	NC_017230	TAA	2	6	19151	19156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017230	TAA	2	6	19214	19219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017230	TTA	3	9	19220	19228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_017230	CAA	2	6	19295	19300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206250
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291	NC_017230	ATA	2	6	21533	21538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206252
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308	NC_017230	ATA	2	6	23121	23126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_017230	TGG	2	6	23166	23171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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369	NC_017230	TTA	2	6	28054	28059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_017230	TAA	2	6	28938	28943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206261
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.