MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-1

Total Repeats: 377

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017230	AGA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206221
2	NC_017230	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206221
3	NC_017230	ACT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206221
4	NC_017230	TAA	3	9	448	456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206221
5	NC_017230	ATA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206221
6	NC_017230	CAA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206221
7	NC_017230	CTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206221
8	NC_017230	AGT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206221
9	NC_017230	TAA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206221
10	NC_017230	TTA	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206221
11	NC_017230	ATG	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206221
12	NC_017230	ATT	2	6	1047	1052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206221
13	NC_017230	TAA	2	6	1240	1245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206221
14	NC_017230	GAG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206221
15	NC_017230	ATT	2	6	1273	1278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206221
16	NC_017230	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206222
17	NC_017230	AAG	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206222
18	NC_017230	AGG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206222
19	NC_017230	CAG	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206222
20	NC_017230	AGC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206222
21	NC_017230	TAA	2	6	1601	1606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206222
22	NC_017230	TTC	3	9	1811	1819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206222
23	NC_017230	ATT	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206222
24	NC_017230	AGA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206222
25	NC_017230	AGA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206223
26	NC_017230	CAA	2	6	2087	2092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206223
27	NC_017230	TGG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206223
28	NC_017230	AGC	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206223
29	NC_017230	TGG	3	9	2278	2286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206223
30	NC_017230	TGA	2	6	2287	2292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206223
31	NC_017230	ACT	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206223
32	NC_017230	AGA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206223
33	NC_017230	GTT	2	6	2601	2606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206224
34	NC_017230	GCT	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206224
35	NC_017230	GAT	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206224
36	NC_017230	GTT	2	6	2806	2811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206224
37	NC_017230	TAA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206224
38	NC_017230	TTA	2	6	3124	3129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206224
39	NC_017230	ATT	2	6	3253	3258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206224
40	NC_017230	ATA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206224
41	NC_017230	TGG	2	6	3326	3331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206224
42	NC_017230	ATC	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206225
43	NC_017230	TGG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206225
44	NC_017230	AAT	2	6	3717	3722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206225
45	NC_017230	TAG	2	6	3736	3741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206225
46	NC_017230	GCA	2	6	3816	3821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206225
47	NC_017230	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206225
48	NC_017230	TAA	2	6	3930	3935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206225
49	NC_017230	ATT	2	6	3959	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
50	NC_017230	TGA	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206226
51	NC_017230	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
52	NC_017230	TAT	2	6	4022	4027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
53	NC_017230	AGA	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206226
54	NC_017230	AGT	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206226
55	NC_017230	TAA	3	9	4277	4285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206226
56	NC_017230	ATT	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
57	NC_017230	TTA	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
58	NC_017230	ACT	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206226
59	NC_017230	AGA	2	6	4451	4456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206226
60	NC_017230	GTG	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206226
61	NC_017230	ATG	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206226
62	NC_017230	CAG	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206226
63	NC_017230	GCA	2	6	4620	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206226
64	NC_017230	TAA	2	6	4676	4681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206226
65	NC_017230	CTA	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206226
66	NC_017230	GAA	3	9	4971	4979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206227
67	NC_017230	GTT	2	6	5184	5189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206227
68	NC_017230	ATT	2	6	5245	5250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206227
69	NC_017230	TGT	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206228
70	NC_017230	GAC	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206228
71	NC_017230	TTA	2	6	5553	5558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206228
72	NC_017230	GGC	2	6	5839	5844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206229
73	NC_017230	CAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206229
74	NC_017230	GTA	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206229
75	NC_017230	TTG	2	6	6092	6097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206229
76	NC_017230	AAT	2	6	6216	6221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206230
77	NC_017230	ATC	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206230
78	NC_017230	ACT	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206230
79	NC_017230	ATA	2	6	6484	6489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206230
80	NC_017230	TAA	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206230
81	NC_017230	AAT	2	6	6659	6664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206230
82	NC_017230	AGG	2	6	6676	6681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206230
83	NC_017230	ATT	2	6	6752	6757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206231
84	NC_017230	TGC	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206231
85	NC_017230	TAA	2	6	6840	6845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206231
86	NC_017230	GAG	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206231
87	NC_017230	TGT	2	6	7047	7052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206231
88	NC_017230	TTA	2	6	7055	7060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206231
89	NC_017230	GAT	2	6	7081	7086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206231
90	NC_017230	GAC	2	6	7105	7110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206231
91	NC_017230	AAT	2	6	7231	7236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206231
92	NC_017230	CTA	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206231
93	NC_017230	CAC	2	6	7331	7336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206231
94	NC_017230	TGA	2	6	7341	7346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206231
95	NC_017230	TGC	2	6	7347	7352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206231
96	NC_017230	CTT	2	6	7393	7398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206231
97	NC_017230	TTG	2	6	7505	7510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206231
98	NC_017230	GTG	2	6	7574	7579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206231
99	NC_017230	ACT	2	6	7641	7646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206231
100	NC_017230	ATG	2	6	7739	7744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206231
101	NC_017230	TAC	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206231
102	NC_017230	GGT	2	6	7856	7861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206232
103	NC_017230	ACA	2	6	7904	7909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206232
104	NC_017230	GTT	2	6	7916	7921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206232
105	NC_017230	TAA	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206232
106	NC_017230	ATT	2	6	8123	8128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206232
107	NC_017230	GAA	2	6	8150	8155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206232
108	NC_017230	AAG	2	6	8161	8166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206232
109	NC_017230	CAG	2	6	8172	8177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206232
110	NC_017230	TTA	2	6	8256	8261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206233
111	NC_017230	TAT	2	6	8492	8497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206233
112	NC_017230	TTG	2	6	8508	8513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206233
113	NC_017230	TAT	2	6	8515	8520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206233
114	NC_017230	AAT	2	6	8600	8605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206233
115	NC_017230	GAT	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206233
116	NC_017230	GAT	2	6	8839	8844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206234
117	NC_017230	ATG	2	6	8861	8866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206234
118	NC_017230	TTG	2	6	9348	9353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206235
119	NC_017230	AGA	2	6	9589	9594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206235
120	NC_017230	GCG	2	6	9714	9719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206235
121	NC_017230	CTA	2	6	9779	9784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206235
122	NC_017230	AGA	2	6	9814	9819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206235
123	NC_017230	AGA	2	6	9937	9942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206235
124	NC_017230	ACC	2	6	9989	9994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206235
125	NC_017230	CCT	2	6	10154	10159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206235
126	NC_017230	ATT	2	6	10301	10306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206236
127	NC_017230	AAT	2	6	10307	10312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206236
128	NC_017230	ATA	2	6	10365	10370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206236
129	NC_017230	TAA	2	6	10425	10430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206236
130	NC_017230	GTT	2	6	10581	10586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206236
131	NC_017230	TTA	2	6	10599	10604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206236
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261	NC_017230	ATA	2	6	19743	19748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206250
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268	NC_017230	TAT	3	9	20280	20288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206250
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287	NC_017230	TAA	2	6	22225	22230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206253
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.