MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-1

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017230	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017230	TG	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	384206221
3	NC_017230	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	384206221
4	NC_017230	AG	4	8	1508	1515	50 %	0 %	50 %	0 %	384206222
5	NC_017230	TA	3	6	2951	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	384206224
6	NC_017230	CT	3	6	3174	3179	0 %	50 %	0 %	50 %	384206224
7	NC_017230	AT	3	6	4262	4267	50 %	50 %	0 %	0 %	384206226
8	NC_017230	AG	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	384206227
9	NC_017230	AG	3	6	5349	5354	50 %	0 %	50 %	0 %	384206227
10	NC_017230	AT	3	6	5601	5606	50 %	50 %	0 %	0 %	384206228
11	NC_017230	AT	3	6	5904	5909	50 %	50 %	0 %	0 %	384206229
12	NC_017230	TA	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	384206229
13	NC_017230	AT	4	8	6393	6400	50 %	50 %	0 %	0 %	384206230
14	NC_017230	TA	3	6	8630	8635	50 %	50 %	0 %	0 %	384206233
15	NC_017230	AT	3	6	9808	9813	50 %	50 %	0 %	0 %	384206235
16	NC_017230	AT	3	6	10662	10667	50 %	50 %	0 %	0 %	384206236
17	NC_017230	AC	3	6	11748	11753	50 %	0 %	0 %	50 %	384206237
18	NC_017230	CA	3	6	12114	12119	50 %	0 %	0 %	50 %	384206238
19	NC_017230	AT	3	6	12783	12788	50 %	50 %	0 %	0 %	384206239
20	NC_017230	AT	4	8	13175	13182	50 %	50 %	0 %	0 %	384206240
21	NC_017230	AT	3	6	13453	13458	50 %	50 %	0 %	0 %	384206240
22	NC_017230	AT	3	6	13862	13867	50 %	50 %	0 %	0 %	384206241
23	NC_017230	TA	3	6	15080	15085	50 %	50 %	0 %	0 %	384206242
24	NC_017230	TA	3	6	15184	15189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017230	TA	3	6	15193	15198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017230	AT	3	6	15490	15495	50 %	50 %	0 %	0 %	384206244
27	NC_017230	CA	3	6	15529	15534	50 %	0 %	0 %	50 %	384206244
28	NC_017230	AG	3	6	15755	15760	50 %	0 %	50 %	0 %	384206244
29	NC_017230	AT	3	6	15900	15905	50 %	50 %	0 %	0 %	384206245
30	NC_017230	AT	3	6	16068	16073	50 %	50 %	0 %	0 %	384206245
31	NC_017230	AT	3	6	17397	17402	50 %	50 %	0 %	0 %	384206248
32	NC_017230	AT	3	6	18705	18710	50 %	50 %	0 %	0 %	384206249
33	NC_017230	AT	3	6	18903	18908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017230	GT	3	6	19661	19666	0 %	50 %	50 %	0 %	384206250
35	NC_017230	AT	3	6	20268	20273	50 %	50 %	0 %	0 %	384206250
36	NC_017230	TA	3	6	20342	20347	50 %	50 %	0 %	0 %	384206250
37	NC_017230	TA	3	6	21112	21117	50 %	50 %	0 %	0 %	384206252
38	NC_017230	TA	3	6	21602	21607	50 %	50 %	0 %	0 %	384206252
39	NC_017230	AT	3	6	22446	22451	50 %	50 %	0 %	0 %	384206254
40	NC_017230	AT	3	6	22608	22613	50 %	50 %	0 %	0 %	384206254
41	NC_017230	AT	3	6	23142	23147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017230	TA	4	8	23266	23273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017230	AT	3	6	23277	23282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017230	TA	3	6	23344	23349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017230	TA	3	6	23417	23422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017230	TA	3	6	23805	23810	50 %	50 %	0 %	0 %	384206255
47	NC_017230	GT	3	6	24926	24931	0 %	50 %	50 %	0 %	384206256
48	NC_017230	TA	3	6	25868	25873	50 %	50 %	0 %	0 %	384206257
49	NC_017230	AT	3	6	26090	26095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017230	AT	3	6	26251	26256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017230	GA	3	6	26326	26331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017230	TA	3	6	26423	26428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017230	AT	3	6	27844	27849	50 %	50 %	0 %	0 %	384206259
54	NC_017230	TG	3	6	28189	28194	0 %	50 %	50 %	0 %	384206260
55	NC_017230	AT	3	6	28715	28720	50 %	50 %	0 %	0 %	384206261
56	NC_017230	AT	3	6	29055	29060	50 %	50 %	0 %	0 %	384206261
57	NC_017230	GA	3	6	29548	29553	50 %	0 %	50 %	0 %	384206261
58	NC_017230	AC	4	8	29655	29662	50 %	0 %	0 %	50 %	384206261
59	NC_017230	AT	3	6	29715	29720	50 %	50 %	0 %	0 %	384206261
60	NC_017230	AG	3	6	29961	29966	50 %	0 %	50 %	0 %	384206261

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.