MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-1

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017230	TG	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	384206221
2	NC_017230	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	384206221
3	NC_017230	AG	4	8	1508	1515	50 %	0 %	50 %	0 %	384206222
4	NC_017230	TA	3	6	2951	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	384206224
5	NC_017230	CT	3	6	3174	3179	0 %	50 %	0 %	50 %	384206224
6	NC_017230	AT	3	6	4262	4267	50 %	50 %	0 %	0 %	384206226
7	NC_017230	AG	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	384206227
8	NC_017230	AG	3	6	5349	5354	50 %	0 %	50 %	0 %	384206227
9	NC_017230	AT	3	6	5601	5606	50 %	50 %	0 %	0 %	384206228
10	NC_017230	AT	3	6	5904	5909	50 %	50 %	0 %	0 %	384206229
11	NC_017230	TA	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	384206229
12	NC_017230	AT	4	8	6393	6400	50 %	50 %	0 %	0 %	384206230
13	NC_017230	TA	3	6	8630	8635	50 %	50 %	0 %	0 %	384206233
14	NC_017230	AT	3	6	9808	9813	50 %	50 %	0 %	0 %	384206235
15	NC_017230	AT	3	6	10662	10667	50 %	50 %	0 %	0 %	384206236
16	NC_017230	AC	3	6	11748	11753	50 %	0 %	0 %	50 %	384206237
17	NC_017230	CA	3	6	12114	12119	50 %	0 %	0 %	50 %	384206238
18	NC_017230	AT	3	6	12783	12788	50 %	50 %	0 %	0 %	384206239
19	NC_017230	AT	4	8	13175	13182	50 %	50 %	0 %	0 %	384206240
20	NC_017230	AT	3	6	13453	13458	50 %	50 %	0 %	0 %	384206240
21	NC_017230	AT	3	6	13862	13867	50 %	50 %	0 %	0 %	384206241
22	NC_017230	TA	3	6	15080	15085	50 %	50 %	0 %	0 %	384206242
23	NC_017230	AT	3	6	15490	15495	50 %	50 %	0 %	0 %	384206244
24	NC_017230	CA	3	6	15529	15534	50 %	0 %	0 %	50 %	384206244
25	NC_017230	AG	3	6	15755	15760	50 %	0 %	50 %	0 %	384206244
26	NC_017230	AT	3	6	15900	15905	50 %	50 %	0 %	0 %	384206245
27	NC_017230	AT	3	6	16068	16073	50 %	50 %	0 %	0 %	384206245
28	NC_017230	AT	3	6	17397	17402	50 %	50 %	0 %	0 %	384206248
29	NC_017230	AT	3	6	18705	18710	50 %	50 %	0 %	0 %	384206249
30	NC_017230	GT	3	6	19661	19666	0 %	50 %	50 %	0 %	384206250
31	NC_017230	AT	3	6	20268	20273	50 %	50 %	0 %	0 %	384206250
32	NC_017230	TA	3	6	20342	20347	50 %	50 %	0 %	0 %	384206250
33	NC_017230	TA	3	6	21112	21117	50 %	50 %	0 %	0 %	384206252
34	NC_017230	TA	3	6	21602	21607	50 %	50 %	0 %	0 %	384206252
35	NC_017230	AT	3	6	22446	22451	50 %	50 %	0 %	0 %	384206254
36	NC_017230	AT	3	6	22608	22613	50 %	50 %	0 %	0 %	384206254
37	NC_017230	TA	3	6	23805	23810	50 %	50 %	0 %	0 %	384206255
38	NC_017230	GT	3	6	24926	24931	0 %	50 %	50 %	0 %	384206256
39	NC_017230	TA	3	6	25868	25873	50 %	50 %	0 %	0 %	384206257
40	NC_017230	AT	3	6	27844	27849	50 %	50 %	0 %	0 %	384206259
41	NC_017230	TG	3	6	28189	28194	0 %	50 %	50 %	0 %	384206260
42	NC_017230	AT	3	6	28715	28720	50 %	50 %	0 %	0 %	384206261
43	NC_017230	AT	3	6	29055	29060	50 %	50 %	0 %	0 %	384206261
44	NC_017230	GA	3	6	29548	29553	50 %	0 %	50 %	0 %	384206261
45	NC_017230	AC	4	8	29655	29662	50 %	0 %	0 %	50 %	384206261
46	NC_017230	AT	3	6	29715	29720	50 %	50 %	0 %	0 %	384206261
47	NC_017230	AG	3	6	29961	29966	50 %	0 %	50 %	0 %	384206261

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.