MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp26

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017229	CTTT	2	8	182	189	0 %	75 %	0 %	25 %	384206193
2	NC_017229	AAAT	2	8	627	634	75 %	25 %	0 %	0 %	384206194
3	NC_017229	AGTA	2	8	1085	1092	50 %	25 %	25 %	0 %	384206195
4	NC_017229	AATA	2	8	1295	1302	75 %	25 %	0 %	0 %	384206195
5	NC_017229	TGTA	2	8	1376	1383	25 %	50 %	25 %	0 %	384206195
6	NC_017229	AATT	2	8	1451	1458	50 %	50 %	0 %	0 %	384206195
7	NC_017229	AATT	2	8	1691	1698	50 %	50 %	0 %	0 %	384206195
8	NC_017229	ACAA	2	8	1783	1790	75 %	0 %	0 %	25 %	384206195
9	NC_017229	TAAT	2	8	2507	2514	50 %	50 %	0 %	0 %	384206196
10	NC_017229	CCAA	2	8	3031	3038	50 %	0 %	0 %	50 %	384206196
11	NC_017229	ATTT	2	8	3692	3699	25 %	75 %	0 %	0 %	384206196
12	NC_017229	TTAA	2	8	4267	4274	50 %	50 %	0 %	0 %	384206197
13	NC_017229	AATG	2	8	4571	4578	50 %	25 %	25 %	0 %	384206198
14	NC_017229	GAAA	2	8	4647	4654	75 %	0 %	25 %	0 %	384206199
15	NC_017229	ATAA	2	8	5026	5033	75 %	25 %	0 %	0 %	384206199
16	NC_017229	CTTT	2	8	5129	5136	0 %	75 %	0 %	25 %	384206199
17	NC_017229	CATT	2	8	5183	5190	25 %	50 %	0 %	25 %	384206199
18	NC_017229	ATAA	2	8	5735	5742	75 %	25 %	0 %	0 %	384206199
19	NC_017229	TTTA	2	8	5759	5766	25 %	75 %	0 %	0 %	384206200
20	NC_017229	AAAT	2	8	6770	6777	75 %	25 %	0 %	0 %	384206201
21	NC_017229	ATTA	2	8	7922	7929	50 %	50 %	0 %	0 %	384206202
22	NC_017229	TACT	2	8	7970	7977	25 %	50 %	0 %	25 %	384206202
23	NC_017229	AATA	2	8	7982	7989	75 %	25 %	0 %	0 %	384206202
24	NC_017229	ATAA	2	8	8723	8730	75 %	25 %	0 %	0 %	384206203
25	NC_017229	ATTT	2	8	8811	8818	25 %	75 %	0 %	0 %	384206203
26	NC_017229	AGAA	2	8	9049	9056	75 %	0 %	25 %	0 %	384206203
27	NC_017229	CAAG	2	8	9262	9269	50 %	0 %	25 %	25 %	384206204
28	NC_017229	ATAA	2	8	9382	9389	75 %	25 %	0 %	0 %	384206204
29	NC_017229	TTCA	2	8	9484	9491	25 %	50 %	0 %	25 %	384206204
30	NC_017229	TAAA	2	8	9961	9968	75 %	25 %	0 %	0 %	384206205
31	NC_017229	AATT	2	8	10258	10265	50 %	50 %	0 %	0 %	384206205
32	NC_017229	TTAC	2	8	10452	10459	25 %	50 %	0 %	25 %	384206205
33	NC_017229	AAAT	2	8	10469	10476	75 %	25 %	0 %	0 %	384206205
34	NC_017229	AATT	2	8	10771	10778	50 %	50 %	0 %	0 %	384206206
35	NC_017229	GATT	2	8	10797	10804	25 %	50 %	25 %	0 %	384206206
36	NC_017229	TAAT	2	8	10954	10961	50 %	50 %	0 %	0 %	384206206
37	NC_017229	TTAT	2	8	12079	12086	25 %	75 %	0 %	0 %	384206207
38	NC_017229	TTTA	2	8	12308	12315	25 %	75 %	0 %	0 %	384206207
39	NC_017229	TATT	2	8	13514	13521	25 %	75 %	0 %	0 %	384206207
40	NC_017229	ATTT	2	8	13979	13986	25 %	75 %	0 %	0 %	384206209
41	NC_017229	TTTC	2	8	14207	14214	0 %	75 %	0 %	25 %	384206209
42	NC_017229	TTGT	2	8	15108	15115	0 %	75 %	25 %	0 %	384206209
43	NC_017229	ATTA	2	8	15215	15222	50 %	50 %	0 %	0 %	384206210
44	NC_017229	TTCA	2	8	15587	15594	25 %	50 %	0 %	25 %	384206210
45	NC_017229	TTTG	2	8	16304	16311	0 %	75 %	25 %	0 %	384206210
46	NC_017229	AATT	2	8	16415	16422	50 %	50 %	0 %	0 %	384206210
47	NC_017229	CATT	2	8	16672	16679	25 %	50 %	0 %	25 %	384206210
48	NC_017229	ATTT	2	8	17460	17467	25 %	75 %	0 %	0 %	384206211
49	NC_017229	ACTA	2	8	17506	17513	50 %	25 %	0 %	25 %	384206211
50	NC_017229	ATAA	2	8	18012	18019	75 %	25 %	0 %	0 %	384206212
51	NC_017229	AATA	2	8	18294	18301	75 %	25 %	0 %	0 %	384206212
52	NC_017229	AAAT	2	8	18549	18556	75 %	25 %	0 %	0 %	384206212
53	NC_017229	CTCA	2	8	18603	18610	25 %	25 %	0 %	50 %	384206212
54	NC_017229	TAAA	2	8	18824	18831	75 %	25 %	0 %	0 %	384206212
55	NC_017229	ATTC	2	8	19065	19072	25 %	50 %	0 %	25 %	384206212
56	NC_017229	GATT	2	8	19348	19355	25 %	50 %	25 %	0 %	384206212
57	NC_017229	ATAA	2	8	19476	19483	75 %	25 %	0 %	0 %	384206213
58	NC_017229	AAGT	2	8	19814	19821	50 %	25 %	25 %	0 %	384206213
59	NC_017229	AAAT	2	8	20013	20020	75 %	25 %	0 %	0 %	384206213
60	NC_017229	TAAA	2	8	20288	20295	75 %	25 %	0 %	0 %	384206213
61	NC_017229	ATTC	2	8	20529	20536	25 %	50 %	0 %	25 %	384206213
62	NC_017229	TAAT	2	8	20767	20774	50 %	50 %	0 %	0 %	384206213
63	NC_017229	AATT	2	8	21227	21234	50 %	50 %	0 %	0 %	384206214
64	NC_017229	TAAA	2	8	21311	21318	75 %	25 %	0 %	0 %	384206214
65	NC_017229	TAAA	2	8	21497	21504	75 %	25 %	0 %	0 %	384206215
66	NC_017229	AATT	2	8	21645	21652	50 %	50 %	0 %	0 %	384206215
67	NC_017229	ATGA	2	8	21934	21941	50 %	25 %	25 %	0 %	384206216
68	NC_017229	AAAC	2	8	22083	22090	75 %	0 %	0 %	25 %	384206216
69	NC_017229	ATCT	2	8	22226	22233	25 %	50 %	0 %	25 %	384206216
70	NC_017229	ATTT	2	8	22411	22418	25 %	75 %	0 %	0 %	384206216
71	NC_017229	ATTT	2	8	22783	22790	25 %	75 %	0 %	0 %	384206217
72	NC_017229	TAAA	2	8	22907	22914	75 %	25 %	0 %	0 %	384206217
73	NC_017229	ATTT	2	8	23098	23105	25 %	75 %	0 %	0 %	384206217
74	NC_017229	CAAA	2	8	23694	23701	75 %	0 %	0 %	25 %	384206218
75	NC_017229	ATTT	2	8	25512	25519	25 %	75 %	0 %	0 %	384206219
76	NC_017229	TTCA	2	8	25525	25532	25 %	50 %	0 %	25 %	384206219
77	NC_017229	TTAC	2	8	25644	25651	25 %	50 %	0 %	25 %	384206219
78	NC_017229	AAAT	2	8	25685	25692	75 %	25 %	0 %	0 %	384206219

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.