MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp26

Total Repeats: 404

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017229	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206193
2	NC_017229	ACA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206193
3	NC_017229	ATA	2	6	122	127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206193
4	NC_017229	TAA	2	6	303	308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206193
5	NC_017229	TAT	2	6	319	324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206193
6	NC_017229	TAT	3	9	394	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206194
7	NC_017229	TAC	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206194
8	NC_017229	CTG	2	6	649	654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206194
9	NC_017229	TTA	2	6	774	779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017229	AAT	2	6	816	821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017229	ATT	2	6	862	867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
12	NC_017229	TCA	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206195
13	NC_017229	TTA	2	6	1049	1054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
14	NC_017229	TAA	2	6	1137	1142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206195
15	NC_017229	ATT	2	6	1143	1148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
16	NC_017229	ATC	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206195
17	NC_017229	TGT	2	6	1200	1205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206195
18	NC_017229	TTC	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206195
19	NC_017229	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
20	NC_017229	TAT	2	6	1367	1372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
21	NC_017229	GAA	2	6	1390	1395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206195
22	NC_017229	AAC	2	6	1488	1493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206195
23	NC_017229	TAA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206195
24	NC_017229	TAT	3	9	1505	1513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
25	NC_017229	CGA	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206195
26	NC_017229	TAA	2	6	1656	1661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206195
27	NC_017229	ATT	2	6	1669	1674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
28	NC_017229	ATT	2	6	1821	1826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
29	NC_017229	TAT	2	6	1928	1933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
30	NC_017229	ATT	2	6	1978	1983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
31	NC_017229	ATT	2	6	2008	2013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
32	NC_017229	ATT	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
33	NC_017229	AAT	2	6	2616	2621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206196
34	NC_017229	ATA	2	6	2722	2727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206196
35	NC_017229	CAT	2	6	2802	2807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206196
36	NC_017229	CAA	2	6	2960	2965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206196
37	NC_017229	ATT	2	6	3079	3084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206196
38	NC_017229	ACA	2	6	3151	3156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206196
39	NC_017229	CAG	2	6	3188	3193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206196
40	NC_017229	ATA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206196
41	NC_017229	ACA	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206196
42	NC_017229	TCC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017229	AAC	2	6	3800	3805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017229	TTA	3	9	3806	3814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017229	ATT	2	6	3821	3826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017229	TAT	2	6	3896	3901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017229	ATT	2	6	3923	3928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017229	AGA	2	6	3984	3989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206197
49	NC_017229	TAG	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206197
50	NC_017229	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206197
51	NC_017229	AGC	2	6	4092	4097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206197
52	NC_017229	ATA	2	6	4156	4161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206197
53	NC_017229	CAA	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206197
54	NC_017229	GAA	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206197
55	NC_017229	ATA	2	6	4285	4290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206197
56	NC_017229	TAC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206198
57	NC_017229	GTT	2	6	4446	4451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206198
58	NC_017229	TGT	2	6	4463	4468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206198
59	NC_017229	CAC	2	6	4477	4482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206198
60	NC_017229	GAA	2	6	4509	4514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206198
61	NC_017229	AAT	2	6	4544	4549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206198
62	NC_017229	ATA	2	6	4615	4620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206198
63	NC_017229	AAG	2	6	4633	4638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206198
64	NC_017229	ATT	2	6	4696	4701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206199
65	NC_017229	TAT	2	6	4830	4835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206199
66	NC_017229	ATT	2	6	4907	4912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206199
67	NC_017229	GAA	2	6	4966	4971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206199
68	NC_017229	AAT	2	6	5046	5051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206199
69	NC_017229	ACA	2	6	5143	5148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206199
70	NC_017229	ATT	2	6	5162	5167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206199
71	NC_017229	TAA	2	6	5196	5201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206199
72	NC_017229	AGA	2	6	5205	5210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206199
73	NC_017229	AAG	2	6	5300	5305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206199
74	NC_017229	ATA	2	6	5437	5442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206199
75	NC_017229	TAC	2	6	5512	5517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206199
76	NC_017229	AAT	2	6	5518	5523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206199
77	NC_017229	AAT	2	6	5638	5643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206199
78	NC_017229	GAA	2	6	5677	5682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206199
79	NC_017229	ATA	2	6	5725	5730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206199
80	NC_017229	ATA	3	9	5797	5805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206200
81	NC_017229	TAG	3	9	5871	5879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206200
82	NC_017229	ATC	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206200
83	NC_017229	ATC	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206200
84	NC_017229	ATA	2	6	5951	5956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206200
85	NC_017229	ATT	2	6	5986	5991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206200
86	NC_017229	TAA	2	6	6021	6026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206200
87	NC_017229	TAA	2	6	6109	6114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206200
88	NC_017229	ATT	2	6	6154	6159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206200
89	NC_017229	AAT	2	6	6189	6194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206200
90	NC_017229	TAA	2	6	6312	6317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206200
91	NC_017229	GAA	2	6	6323	6328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206200
92	NC_017229	ATT	2	6	6454	6459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017229	AAT	2	6	6461	6466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017229	ATT	2	6	6486	6491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017229	ATT	2	6	6558	6563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206201
96	NC_017229	TTA	2	6	6565	6570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206201
97	NC_017229	AAG	2	6	6650	6655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206201
98	NC_017229	AAT	2	6	6660	6665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206201
99	NC_017229	TAA	2	6	6791	6796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206201
100	NC_017229	GAA	2	6	6799	6804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206201
101	NC_017229	TAA	2	6	6855	6860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206201
102	NC_017229	ATT	2	6	6865	6870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206201
103	NC_017229	TAA	2	6	6987	6992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206201
104	NC_017229	ATA	2	6	7070	7075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206201
105	NC_017229	AGA	2	6	7125	7130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206201
106	NC_017229	TTA	2	6	7131	7136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206201
107	NC_017229	ATT	2	6	7161	7166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206201
108	NC_017229	ATT	2	6	7217	7222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206201
109	NC_017229	ATG	2	6	7301	7306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206201
110	NC_017229	CTT	2	6	7501	7506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206201
111	NC_017229	AAG	2	6	7520	7525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206201
112	NC_017229	TAA	2	6	7609	7614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017229	TAT	2	6	7638	7643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017229	TAA	2	6	7712	7717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
115	NC_017229	TAA	2	6	7727	7732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
116	NC_017229	AGT	2	6	7733	7738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206202
117	NC_017229	ACT	2	6	7786	7791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206202
118	NC_017229	TGT	2	6	7823	7828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206202
119	NC_017229	TAA	2	6	8039	8044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
120	NC_017229	ATA	2	6	8094	8099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
121	NC_017229	GAA	2	6	8100	8105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206202
122	NC_017229	CTT	2	6	8225	8230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206202
123	NC_017229	TAA	2	6	8260	8265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
124	NC_017229	AGA	2	6	8270	8275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206202
125	NC_017229	GAA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206202
126	NC_017229	TAA	2	6	8464	8469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
127	NC_017229	AGA	2	6	8490	8495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206202
128	NC_017229	GAA	2	6	8500	8505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206202
129	NC_017229	ATA	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
130	NC_017229	TGT	2	6	8558	8563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206202
131	NC_017229	TAA	2	6	8578	8583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
132	NC_017229	ATT	2	6	8693	8698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206203
133	NC_017229	TAT	2	6	8884	8889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206203
134	NC_017229	ATA	2	6	9148	9153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206203
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248	NC_017229	ATT	2	6	16831	16836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_017229	ATT	2	6	16857	16862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_017229	AAT	2	6	17204	17209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206211
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260	NC_017229	TAA	2	6	17253	17258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206211
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262	NC_017229	GAA	2	6	17330	17335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206211
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.