MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp26

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017229	TTA	2	6	774	779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017229	AAT	2	6	816	821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017229	TCC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017229	AAC	2	6	3800	3805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017229	TTA	3	9	3806	3814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017229	ATT	2	6	3821	3826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017229	TAT	2	6	3896	3901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017229	ATT	2	6	3923	3928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017229	ATT	2	6	6454	6459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017229	AAT	2	6	6461	6466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017229	ATT	2	6	6486	6491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017229	TAA	2	6	7609	7614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017229	TAT	2	6	7638	7643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017229	TAA	2	6	9902	9907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017229	TTG	2	6	10615	10620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017229	AAT	2	6	10630	10635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017229	ATT	2	6	10675	10680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017229	ATA	3	9	11310	11318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017229	AAT	2	6	11341	11346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017229	GTT	2	6	11410	11415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017229	ATT	2	6	11586	11591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017229	TAT	2	6	11592	11597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017229	ATT	2	6	11673	11678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017229	TAT	2	6	11724	11729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017229	TAA	2	6	11738	11743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017229	ATA	2	6	11874	11879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017229	TGA	2	6	11891	11896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017229	AGT	2	6	11925	11930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017229	AAT	2	6	11943	11948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017229	TTC	2	6	13833	13838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017229	TTA	2	6	16711	16716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017229	AAT	2	6	16802	16807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017229	ATT	2	6	16831	16836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017229	ATT	2	6	16857	16862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017229	TTG	2	6	16892	16897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017229	AGG	2	6	16916	16921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017229	AAG	2	6	17638	17643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017229	AGT	2	6	17761	17766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017229	ATA	2	6	17855	17860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017229	CTA	2	6	19425	19430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017229	TGA	2	6	19439	19444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017229	AAT	2	6	21357	21362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017229	TAA	2	6	23214	23219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017229	TTA	2	6	24601	24606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017229	TAA	3	9	24661	24669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017229	AAT	2	6	24733	24738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017229	ATT	2	6	24749	24754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017229	TAT	2	6	24809	24814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017229	TAA	2	6	24849	24854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.