MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp26

Total Repeats: 355

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017229	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206193
2	NC_017229	ACA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206193
3	NC_017229	ATA	2	6	122	127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206193
4	NC_017229	TAA	2	6	303	308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206193
5	NC_017229	TAT	2	6	319	324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206193
6	NC_017229	TAT	3	9	394	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206194
7	NC_017229	TAC	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206194
8	NC_017229	CTG	2	6	649	654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206194
9	NC_017229	ATT	2	6	862	867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
10	NC_017229	TCA	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206195
11	NC_017229	TTA	2	6	1049	1054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
12	NC_017229	TAA	2	6	1137	1142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206195
13	NC_017229	ATT	2	6	1143	1148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
14	NC_017229	ATC	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206195
15	NC_017229	TGT	2	6	1200	1205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206195
16	NC_017229	TTC	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206195
17	NC_017229	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
18	NC_017229	TAT	2	6	1367	1372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
19	NC_017229	GAA	2	6	1390	1395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206195
20	NC_017229	AAC	2	6	1488	1493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206195
21	NC_017229	TAA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206195
22	NC_017229	TAT	3	9	1505	1513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
23	NC_017229	CGA	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206195
24	NC_017229	TAA	2	6	1656	1661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206195
25	NC_017229	ATT	2	6	1669	1674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
26	NC_017229	ATT	2	6	1821	1826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
27	NC_017229	TAT	2	6	1928	1933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
28	NC_017229	ATT	2	6	1978	1983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
29	NC_017229	ATT	2	6	2008	2013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
30	NC_017229	ATT	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206195
31	NC_017229	AAT	2	6	2616	2621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206196
32	NC_017229	ATA	2	6	2722	2727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206196
33	NC_017229	CAT	2	6	2802	2807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206196
34	NC_017229	CAA	2	6	2960	2965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206196
35	NC_017229	ATT	2	6	3079	3084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206196
36	NC_017229	ACA	2	6	3151	3156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206196
37	NC_017229	CAG	2	6	3188	3193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206196
38	NC_017229	ATA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206196
39	NC_017229	ACA	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206196
40	NC_017229	AGA	2	6	3984	3989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206197
41	NC_017229	TAG	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206197
42	NC_017229	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206197
43	NC_017229	AGC	2	6	4092	4097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206197
44	NC_017229	ATA	2	6	4156	4161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206197
45	NC_017229	CAA	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206197
46	NC_017229	GAA	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206197
47	NC_017229	ATA	2	6	4285	4290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206197
48	NC_017229	TAC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206198
49	NC_017229	GTT	2	6	4446	4451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206198
50	NC_017229	TGT	2	6	4463	4468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206198
51	NC_017229	CAC	2	6	4477	4482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206198
52	NC_017229	GAA	2	6	4509	4514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206198
53	NC_017229	AAT	2	6	4544	4549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206198
54	NC_017229	ATA	2	6	4615	4620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206198
55	NC_017229	AAG	2	6	4633	4638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206198
56	NC_017229	ATT	2	6	4696	4701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206199
57	NC_017229	TAT	2	6	4830	4835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206199
58	NC_017229	ATT	2	6	4907	4912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206199
59	NC_017229	GAA	2	6	4966	4971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206199
60	NC_017229	AAT	2	6	5046	5051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206199
61	NC_017229	ACA	2	6	5143	5148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206199
62	NC_017229	ATT	2	6	5162	5167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206199
63	NC_017229	TAA	2	6	5196	5201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206199
64	NC_017229	AGA	2	6	5205	5210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206199
65	NC_017229	AAG	2	6	5300	5305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206199
66	NC_017229	ATA	2	6	5437	5442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206199
67	NC_017229	TAC	2	6	5512	5517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206199
68	NC_017229	AAT	2	6	5518	5523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206199
69	NC_017229	AAT	2	6	5638	5643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206199
70	NC_017229	GAA	2	6	5677	5682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206199
71	NC_017229	ATA	2	6	5725	5730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206199
72	NC_017229	ATA	3	9	5797	5805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206200
73	NC_017229	TAG	3	9	5871	5879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206200
74	NC_017229	ATC	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206200
75	NC_017229	ATC	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206200
76	NC_017229	ATA	2	6	5951	5956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206200
77	NC_017229	ATT	2	6	5986	5991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206200
78	NC_017229	TAA	2	6	6021	6026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206200
79	NC_017229	TAA	2	6	6109	6114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206200
80	NC_017229	ATT	2	6	6154	6159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206200
81	NC_017229	AAT	2	6	6189	6194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206200
82	NC_017229	TAA	2	6	6312	6317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206200
83	NC_017229	GAA	2	6	6323	6328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206200
84	NC_017229	ATT	2	6	6558	6563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206201
85	NC_017229	TTA	2	6	6565	6570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206201
86	NC_017229	AAG	2	6	6650	6655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206201
87	NC_017229	AAT	2	6	6660	6665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206201
88	NC_017229	TAA	2	6	6791	6796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206201
89	NC_017229	GAA	2	6	6799	6804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206201
90	NC_017229	TAA	2	6	6855	6860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206201
91	NC_017229	ATT	2	6	6865	6870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206201
92	NC_017229	TAA	2	6	6987	6992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206201
93	NC_017229	ATA	2	6	7070	7075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206201
94	NC_017229	AGA	2	6	7125	7130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206201
95	NC_017229	TTA	2	6	7131	7136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206201
96	NC_017229	ATT	2	6	7161	7166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206201
97	NC_017229	ATT	2	6	7217	7222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206201
98	NC_017229	ATG	2	6	7301	7306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206201
99	NC_017229	CTT	2	6	7501	7506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206201
100	NC_017229	AAG	2	6	7520	7525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206201
101	NC_017229	TAA	2	6	7712	7717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
102	NC_017229	TAA	2	6	7727	7732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
103	NC_017229	AGT	2	6	7733	7738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206202
104	NC_017229	ACT	2	6	7786	7791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206202
105	NC_017229	TGT	2	6	7823	7828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206202
106	NC_017229	TAA	2	6	8039	8044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
107	NC_017229	ATA	2	6	8094	8099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
108	NC_017229	GAA	2	6	8100	8105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206202
109	NC_017229	CTT	2	6	8225	8230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206202
110	NC_017229	TAA	2	6	8260	8265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
111	NC_017229	AGA	2	6	8270	8275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206202
112	NC_017229	GAA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206202
113	NC_017229	TAA	2	6	8464	8469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
114	NC_017229	AGA	2	6	8490	8495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206202
115	NC_017229	GAA	2	6	8500	8505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206202
116	NC_017229	ATA	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
117	NC_017229	TGT	2	6	8558	8563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206202
118	NC_017229	TAA	2	6	8578	8583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206202
119	NC_017229	ATT	2	6	8693	8698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206203
120	NC_017229	TAT	2	6	8884	8889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206203
121	NC_017229	ATA	2	6	9148	9153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206203
122	NC_017229	GGT	2	6	9172	9177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206204
123	NC_017229	ACA	2	6	9190	9195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206204
124	NC_017229	ATT	2	6	9240	9245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206204
125	NC_017229	AAT	2	6	9372	9377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206204
126	NC_017229	TAA	2	6	9546	9551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206204
127	NC_017229	TAA	2	6	9557	9562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206204
128	NC_017229	TAA	2	6	9623	9628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206204
129	NC_017229	CAG	2	6	9630	9635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206204
130	NC_017229	TAA	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206204
131	NC_017229	AGA	2	6	9807	9812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206204
132	NC_017229	ATT	2	6	9830	9835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206204
133	NC_017229	TAA	2	6	10066	10071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206205
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.