MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp26

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017229	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017229	AT	3	6	762	767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017229	AT	3	6	1966	1971	50 %	50 %	0 %	0 %	384206195
4	NC_017229	TA	3	6	2126	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	384206195
5	NC_017229	TA	3	6	2262	2267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017229	AT	3	6	2845	2850	50 %	50 %	0 %	0 %	384206196
7	NC_017229	AC	3	6	3068	3073	50 %	0 %	0 %	50 %	384206196
8	NC_017229	AT	3	6	3846	3851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017229	AT	3	6	3876	3881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017229	AT	3	6	3905	3910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017229	TA	3	6	3956	3961	50 %	50 %	0 %	0 %	384206197
12	NC_017229	AT	3	6	3973	3978	50 %	50 %	0 %	0 %	384206197
13	NC_017229	TA	3	6	4665	4670	50 %	50 %	0 %	0 %	384206199
14	NC_017229	CA	3	6	5255	5260	50 %	0 %	0 %	50 %	384206199
15	NC_017229	CT	3	6	5821	5826	0 %	50 %	0 %	50 %	384206200
16	NC_017229	AT	3	6	5857	5862	50 %	50 %	0 %	0 %	384206200
17	NC_017229	TA	3	6	6508	6513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017229	TA	3	6	6704	6709	50 %	50 %	0 %	0 %	384206201
19	NC_017229	AT	3	6	7049	7054	50 %	50 %	0 %	0 %	384206201
20	NC_017229	AT	3	6	7489	7494	50 %	50 %	0 %	0 %	384206201
21	NC_017229	AT	3	6	8991	8996	50 %	50 %	0 %	0 %	384206203
22	NC_017229	AT	3	6	9329	9334	50 %	50 %	0 %	0 %	384206204
23	NC_017229	AG	3	6	9652	9657	50 %	0 %	50 %	0 %	384206204
24	NC_017229	GA	3	6	9694	9699	50 %	0 %	50 %	0 %	384206204
25	NC_017229	AT	3	6	10211	10216	50 %	50 %	0 %	0 %	384206205
26	NC_017229	TA	3	6	10574	10579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017229	TA	3	6	10586	10591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017229	TA	3	6	11078	11083	50 %	50 %	0 %	0 %	384206206
29	NC_017229	TA	3	6	11699	11704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017229	AT	3	6	11970	11975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017229	AG	3	6	12987	12992	50 %	0 %	50 %	0 %	384206207
32	NC_017229	AT	3	6	13266	13271	50 %	50 %	0 %	0 %	384206207
33	NC_017229	TA	3	6	13879	13884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017229	TA	3	6	15523	15528	50 %	50 %	0 %	0 %	384206210
35	NC_017229	GA	3	6	18059	18064	50 %	0 %	50 %	0 %	384206212
36	NC_017229	AT	3	6	18255	18260	50 %	50 %	0 %	0 %	384206212
37	NC_017229	AT	3	6	18723	18728	50 %	50 %	0 %	0 %	384206212
38	NC_017229	AT	3	6	19719	19724	50 %	50 %	0 %	0 %	384206213
39	NC_017229	CT	3	6	20448	20453	0 %	50 %	0 %	50 %	384206213
40	NC_017229	AT	3	6	20716	20721	50 %	50 %	0 %	0 %	384206213
41	NC_017229	AT	3	6	21075	21080	50 %	50 %	0 %	0 %	384206214
42	NC_017229	AT	3	6	21237	21242	50 %	50 %	0 %	0 %	384206214
43	NC_017229	AT	3	6	21361	21366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017229	AT	3	6	21628	21633	50 %	50 %	0 %	0 %	384206215
45	NC_017229	TA	3	6	21988	21993	50 %	50 %	0 %	0 %	384206216
46	NC_017229	AT	3	6	22107	22112	50 %	50 %	0 %	0 %	384206216
47	NC_017229	TA	4	8	22133	22140	50 %	50 %	0 %	0 %	384206216
48	NC_017229	AT	3	6	22289	22294	50 %	50 %	0 %	0 %	384206216
49	NC_017229	GA	3	6	22594	22599	50 %	0 %	50 %	0 %	384206216
50	NC_017229	TA	3	6	22660	22665	50 %	50 %	0 %	0 %	384206217
51	NC_017229	AT	3	6	23241	23246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017229	AT	3	6	23625	23630	50 %	50 %	0 %	0 %	384206218
53	NC_017229	TA	3	6	23984	23989	50 %	50 %	0 %	0 %	384206218
54	NC_017229	TA	4	8	25223	25230	50 %	50 %	0 %	0 %	384206219
55	NC_017229	TC	3	6	25340	25345	0 %	50 %	0 %	50 %	384206219
56	NC_017229	AT	3	6	25637	25642	50 %	50 %	0 %	0 %	384206219
57	NC_017229	AT	3	6	25718	25723	50 %	50 %	0 %	0 %	384206219
58	NC_017229	TA	3	6	25980	25985	50 %	50 %	0 %	0 %	384206219
59	NC_017229	AC	3	6	26017	26022	50 %	0 %	0 %	50 %	384206219

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.