MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-9

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017228	TTGATT	2	12	415	426	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384206151
2	NC_017228	CTGATA	2	12	2978	2989	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206154
3	NC_017228	GAATTT	2	12	5200	5211	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206157
4	NC_017228	TAGTGG	2	12	5262	5273	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384206157
5	NC_017228	AATGGA	2	12	6887	6898	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384206161
6	NC_017228	TAAAAA	2	12	10279	10290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206166
7	NC_017228	TAGATA	2	12	10956	10967	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206167
8	NC_017228	CAAAAA	2	12	12432	12443	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384206169
9	NC_017228	CTTAAT	2	12	12974	12985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384206170
10	NC_017228	TATTGA	2	12	13546	13557	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206170
11	NC_017228	AAACTC	2	12	13763	13774	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384206171
12	NC_017228	GGAAAT	2	12	15236	15247	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017228	TAATGA	2	12	15602	15613	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206174
14	NC_017228	GTTCTT	2	12	16489	16500	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384206176
15	NC_017228	AAAATT	2	12	22824	22835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206183
16	NC_017228	AAGTAA	2	12	24317	24328	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017228	CAAAAA	2	12	24363	24374	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017228	TTAAGT	2	12	26065	26076	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206188
19	NC_017228	TTTAAA	2	12	26535	26546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017228	ATTGTT	2	12	26773	26784	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384206189
21	NC_017228	ATTTTC	2	12	27030	27041	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384206189

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.