MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-9

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017228	ATTCA	2	10	2717	2726	40 %	40 %	0 %	20 %	384206154
2	NC_017228	TTAAT	2	10	3269	3278	40 %	60 %	0 %	0 %	384206154
3	NC_017228	GCAAA	2	10	3865	3874	60 %	0 %	20 %	20 %	384206155
4	NC_017228	TAAAT	2	10	4931	4940	60 %	40 %	0 %	0 %	384206157
5	NC_017228	ATACT	2	10	5735	5744	40 %	40 %	0 %	20 %	384206158
6	NC_017228	TAATA	2	10	6294	6303	60 %	40 %	0 %	0 %	384206160
7	NC_017228	GAAAA	2	10	6912	6921	80 %	0 %	20 %	0 %	384206161
8	NC_017228	CTGCA	2	10	7566	7575	20 %	20 %	20 %	40 %	384206161
9	NC_017228	AAAAC	2	10	8302	8311	80 %	0 %	0 %	20 %	384206163
10	NC_017228	CAACT	2	10	10365	10374	40 %	20 %	0 %	40 %	384206166
11	NC_017228	CATAA	2	10	11522	11531	60 %	20 %	0 %	20 %	384206167
12	NC_017228	AATTT	2	10	12112	12121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017228	TACAA	2	10	12614	12623	60 %	20 %	0 %	20 %	384206169
14	NC_017228	ACTCA	2	10	13174	13183	40 %	20 %	0 %	40 %	384206170
15	NC_017228	AAAGT	2	10	13241	13250	60 %	20 %	20 %	0 %	384206170
16	NC_017228	AGAAA	2	10	14007	14016	80 %	0 %	20 %	0 %	384206171
17	NC_017228	ATCTT	2	10	14750	14759	20 %	60 %	0 %	20 %	384206172
18	NC_017228	TAAAA	2	10	15815	15824	80 %	20 %	0 %	0 %	384206175
19	NC_017228	CACTT	2	10	16577	16586	20 %	40 %	0 %	40 %	384206176
20	NC_017228	ATTAA	2	10	17285	17294	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017228	AATTG	2	10	18257	18266	40 %	40 %	20 %	0 %	384206177
22	NC_017228	AAAAG	2	10	18338	18347	80 %	0 %	20 %	0 %	384206177
23	NC_017228	AAAAG	2	10	18676	18685	80 %	0 %	20 %	0 %	384206178
24	NC_017228	AAAAT	2	10	19808	19817	80 %	20 %	0 %	0 %	384206179
25	NC_017228	ATATA	2	10	20454	20463	60 %	40 %	0 %	0 %	384206181
26	NC_017228	ATTTT	2	10	21026	21035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017228	GAGTT	2	10	22639	22648	20 %	40 %	40 %	0 %	384206183
28	NC_017228	AAAAC	2	10	23093	23102	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017228	ATTTT	2	10	24185	24194	20 %	80 %	0 %	0 %	384206185
30	NC_017228	ATTTG	2	10	24516	24525	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017228	GCATT	2	10	24679	24688	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017228	AAGAA	2	10	24936	24945	80 %	0 %	20 %	0 %	384206186
33	NC_017228	TAAAA	2	10	25256	25265	80 %	20 %	0 %	0 %	384206186
34	NC_017228	GGATG	2	10	25753	25762	20 %	20 %	60 %	0 %	384206187
35	NC_017228	GATTT	2	10	26365	26374	20 %	60 %	20 %	0 %	384206188
36	NC_017228	AAAAT	2	10	26594	26603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017228	TTTTA	2	10	26660	26669	20 %	80 %	0 %	0 %	384206189
38	NC_017228	AATTT	2	10	26971	26980	40 %	60 %	0 %	0 %	384206189
39	NC_017228	GAAAA	2	10	28249	28258	80 %	0 %	20 %	0 %	384206191

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.