MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-9

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017228	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017228	TG	3	6	67	72	0 %	50 %	50 %	0 %	384206151
3	NC_017228	TA	3	6	118	123	50 %	50 %	0 %	0 %	384206151
4	NC_017228	CT	3	6	675	680	0 %	50 %	0 %	50 %	384206151
5	NC_017228	AG	4	8	1509	1516	50 %	0 %	50 %	0 %	384206152
6	NC_017228	GC	3	6	2835	2840	0 %	0 %	50 %	50 %	384206154
7	NC_017228	TA	3	6	2918	2923	50 %	50 %	0 %	0 %	384206154
8	NC_017228	TA	3	6	2958	2963	50 %	50 %	0 %	0 %	384206154
9	NC_017228	CT	3	6	3181	3186	0 %	50 %	0 %	50 %	384206154
10	NC_017228	AT	3	6	4269	4274	50 %	50 %	0 %	0 %	384206156
11	NC_017228	AG	3	6	5280	5285	50 %	0 %	50 %	0 %	384206157
12	NC_017228	AG	3	6	5356	5361	50 %	0 %	50 %	0 %	384206157
13	NC_017228	AT	3	6	5608	5613	50 %	50 %	0 %	0 %	384206158
14	NC_017228	AT	3	6	5911	5916	50 %	50 %	0 %	0 %	384206159
15	NC_017228	TA	3	6	5927	5932	50 %	50 %	0 %	0 %	384206159
16	NC_017228	AT	4	8	6400	6407	50 %	50 %	0 %	0 %	384206160
17	NC_017228	TA	3	6	8637	8642	50 %	50 %	0 %	0 %	384206163
18	NC_017228	AT	3	6	11177	11182	50 %	50 %	0 %	0 %	384206167
19	NC_017228	TA	3	6	11695	11700	50 %	50 %	0 %	0 %	384206167
20	NC_017228	TA	3	6	11912	11917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017228	AT	3	6	11966	11971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017228	TA	3	6	12265	12270	50 %	50 %	0 %	0 %	384206168
23	NC_017228	AT	3	6	12637	12642	50 %	50 %	0 %	0 %	384206169
24	NC_017228	AT	4	8	13029	13036	50 %	50 %	0 %	0 %	384206170
25	NC_017228	AT	3	6	13307	13312	50 %	50 %	0 %	0 %	384206170
26	NC_017228	AT	3	6	13716	13721	50 %	50 %	0 %	0 %	384206171
27	NC_017228	TA	3	6	15029	15034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017228	TA	3	6	15038	15043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017228	AT	3	6	15333	15338	50 %	50 %	0 %	0 %	384206174
30	NC_017228	AG	3	6	15717	15722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017228	AT	3	6	15971	15976	50 %	50 %	0 %	0 %	384206175
32	NC_017228	TA	3	6	17055	17060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017228	TA	3	6	17493	17498	50 %	50 %	0 %	0 %	384206177
34	NC_017228	AT	3	6	18420	18425	50 %	50 %	0 %	0 %	384206177
35	NC_017228	AT	3	6	19149	19154	50 %	50 %	0 %	0 %	384206179
36	NC_017228	AT	3	6	19294	19299	50 %	50 %	0 %	0 %	384206179
37	NC_017228	TA	3	6	19442	19447	50 %	50 %	0 %	0 %	384206179
38	NC_017228	TA	3	6	20134	20139	50 %	50 %	0 %	0 %	384206180
39	NC_017228	AT	3	6	20600	20605	50 %	50 %	0 %	0 %	384206181
40	NC_017228	AT	3	6	20654	20659	50 %	50 %	0 %	0 %	384206181
41	NC_017228	AT	3	6	20795	20800	50 %	50 %	0 %	0 %	384206181
42	NC_017228	AT	5	10	21196	21205	50 %	50 %	0 %	0 %	384206182
43	NC_017228	AT	3	6	21383	21388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017228	TA	4	8	21507	21514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017228	AT	3	6	21518	21523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017228	TA	3	6	22048	22053	50 %	50 %	0 %	0 %	384206183
47	NC_017228	GT	3	6	23170	23175	0 %	50 %	50 %	0 %	384206184
48	NC_017228	AT	3	6	24334	24339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017228	AT	3	6	24495	24500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017228	GA	3	6	24570	24575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017228	GA	3	6	25279	25284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017228	AT	3	6	26992	26997	50 %	50 %	0 %	0 %	384206189
53	NC_017228	TA	3	6	27398	27403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017228	TG	3	6	27663	27668	0 %	50 %	50 %	0 %	384206190
55	NC_017228	AT	3	6	28136	28141	50 %	50 %	0 %	0 %	384206191
56	NC_017228	AT	4	8	28476	28483	50 %	50 %	0 %	0 %	384206191
57	NC_017228	GA	3	6	28969	28974	50 %	0 %	50 %	0 %	384206191
58	NC_017228	AC	4	8	29076	29083	50 %	0 %	0 %	50 %	384206191
59	NC_017228	AT	3	6	29136	29141	50 %	50 %	0 %	0 %	384206191
60	NC_017228	AG	3	6	29382	29387	50 %	0 %	50 %	0 %	384206191

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.