MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-5

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017227	TTGATT	2	12	414	425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384206107
2	NC_017227	CTGATA	2	12	2971	2982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206110
3	NC_017227	GAATTT	2	12	5193	5204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206113
4	NC_017227	TAGTGG	2	12	5255	5266	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384206113
5	NC_017227	AATGGA	2	12	6880	6891	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384206117
6	NC_017227	TAAAAA	2	12	10304	10315	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206122
7	NC_017227	CAAAAA	2	12	12575	12586	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384206125
8	NC_017227	CTTAAT	2	12	13117	13128	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384206126
9	NC_017227	TAATGA	2	12	14906	14917	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206128
10	NC_017227	GGAAAT	2	12	15385	15396	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017227	AAAAGT	2	12	16263	16274	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384206132
12	NC_017227	TAATGA	2	12	17414	17425	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206134
13	NC_017227	ATAGAT	2	12	20998	21009	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206138
14	NC_017227	TAATGA	2	12	21746	21757	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206139
15	NC_017227	TTAAAA	2	12	24624	24635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206142
16	NC_017227	AAGTAA	2	12	26115	26126	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017227	CAAAAA	2	12	26161	26172	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017227	GCACAA	2	12	26722	26733	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384206145
19	NC_017227	GAAAAA	2	12	26988	26999	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384206145
20	NC_017227	TAAAAC	2	12	27637	27648	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384206146
21	NC_017227	TAAAAG	2	12	27936	27947	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384206146

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.