MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-5

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017227	GATTC	2	10	2709	2718	20 %	40 %	20 %	20 %	384206110
2	NC_017227	TTAAT	2	10	3262	3271	40 %	60 %	0 %	0 %	384206110
3	NC_017227	GCAAA	2	10	3858	3867	60 %	0 %	20 %	20 %	384206111
4	NC_017227	TAAAT	2	10	4924	4933	60 %	40 %	0 %	0 %	384206113
5	NC_017227	ATACT	2	10	5728	5737	40 %	40 %	0 %	20 %	384206114
6	NC_017227	TAATA	2	10	6287	6296	60 %	40 %	0 %	0 %	384206116
7	NC_017227	GAAAA	2	10	6905	6914	80 %	0 %	20 %	0 %	384206117
8	NC_017227	CTGCA	2	10	7559	7568	20 %	20 %	20 %	40 %	384206117
9	NC_017227	CATAA	2	10	11547	11556	60 %	20 %	0 %	20 %	384206123
10	NC_017227	AATTT	2	10	12267	12276	40 %	60 %	0 %	0 %	384206124
11	NC_017227	TAAAA	2	10	12287	12296	80 %	20 %	0 %	0 %	384206124
12	NC_017227	TACTT	2	10	13284	13293	20 %	60 %	0 %	20 %	384206126
13	NC_017227	ACTCA	2	10	13317	13326	40 %	20 %	0 %	40 %	384206126
14	NC_017227	AAAGT	2	10	13384	13393	60 %	20 %	20 %	0 %	384206126
15	NC_017227	GAAAA	2	10	14151	14160	80 %	0 %	20 %	0 %	384206127
16	NC_017227	ATCTT	2	10	14887	14896	20 %	60 %	0 %	20 %	384206128
17	NC_017227	TTATG	2	10	16227	16236	20 %	60 %	20 %	0 %	384206132
18	NC_017227	TAGCA	2	10	17116	17125	40 %	20 %	20 %	20 %	384206133
19	NC_017227	TATTT	2	10	18806	18815	20 %	80 %	0 %	0 %	384206135
20	NC_017227	ACACT	2	10	19301	19310	40 %	20 %	0 %	40 %	384206136
21	NC_017227	AAAAG	2	10	20155	20164	80 %	0 %	20 %	0 %	384206136
22	NC_017227	AAAAG	2	10	20493	20502	80 %	0 %	20 %	0 %	384206137
23	NC_017227	ACAAA	2	10	21048	21057	80 %	0 %	0 %	20 %	384206138
24	NC_017227	AAAAC	2	10	24891	24900	80 %	0 %	0 %	20 %	384206143
25	NC_017227	ATTTT	2	10	25983	25992	20 %	80 %	0 %	0 %	384206144
26	NC_017227	AATAA	2	10	27269	27278	80 %	20 %	0 %	0 %	384206145
27	NC_017227	GAAAA	2	10	29777	29786	80 %	0 %	20 %	0 %	384206149

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.