MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-5

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017227	ATTA	2	8	943	950	50 %	50 %	0 %	0 %	384206107
2	NC_017227	AGTA	2	8	1109	1116	50 %	25 %	25 %	0 %	384206107
3	NC_017227	AGTA	2	8	1205	1212	50 %	25 %	25 %	0 %	384206107
4	NC_017227	AATT	2	8	1895	1902	50 %	50 %	0 %	0 %	384206108
5	NC_017227	TTAT	2	8	2519	2526	25 %	75 %	0 %	0 %	384206109
6	NC_017227	GTAA	2	8	2566	2573	50 %	25 %	25 %	0 %	384206109
7	NC_017227	GCAG	2	8	2627	2634	25 %	0 %	50 %	25 %	384206110
8	NC_017227	CAAG	2	8	2664	2671	50 %	0 %	25 %	25 %	384206110
9	NC_017227	GAGC	2	8	2826	2833	25 %	0 %	50 %	25 %	384206110
10	NC_017227	ATGT	2	8	3001	3008	25 %	50 %	25 %	0 %	384206110
11	NC_017227	ATAA	2	8	3108	3115	75 %	25 %	0 %	0 %	384206110
12	NC_017227	CAAT	2	8	3190	3197	50 %	25 %	0 %	25 %	384206110
13	NC_017227	AGAT	2	8	3233	3240	50 %	25 %	25 %	0 %	384206110
14	NC_017227	AATG	2	8	3355	3362	50 %	25 %	25 %	0 %	384206111
15	NC_017227	GTAA	2	8	3918	3925	50 %	25 %	25 %	0 %	384206111
16	NC_017227	TCAT	2	8	4832	4839	25 %	50 %	0 %	25 %	384206112
17	NC_017227	AGTG	2	8	5386	5393	25 %	25 %	50 %	0 %	384206113
18	NC_017227	GGAC	2	8	5760	5767	25 %	0 %	50 %	25 %	384206114
19	NC_017227	TTGG	2	8	5792	5799	0 %	50 %	50 %	0 %	384206115
20	NC_017227	GAAT	2	8	5957	5964	50 %	25 %	25 %	0 %	384206115
21	NC_017227	AACT	2	8	6119	6126	50 %	25 %	0 %	25 %	384206115
22	NC_017227	AATC	2	8	6513	6520	50 %	25 %	0 %	25 %	384206116
23	NC_017227	TAAA	2	8	6535	6542	75 %	25 %	0 %	0 %	384206116
24	NC_017227	GAAA	3	12	7203	7214	75 %	0 %	25 %	0 %	384206117
25	NC_017227	CAAG	2	8	7279	7286	50 %	0 %	25 %	25 %	384206117
26	NC_017227	TTAC	2	8	7718	7725	25 %	50 %	0 %	25 %	384206117
27	NC_017227	TGCT	2	8	8085	8092	0 %	50 %	25 %	25 %	384206118
28	NC_017227	ATTT	2	8	8482	8489	25 %	75 %	0 %	0 %	384206119
29	NC_017227	CTTA	2	8	8668	8675	25 %	50 %	0 %	25 %	384206119
30	NC_017227	CTTG	2	8	8775	8782	0 %	50 %	25 %	25 %	384206120
31	NC_017227	AATT	2	8	8921	8928	50 %	50 %	0 %	0 %	384206120
32	NC_017227	GAAA	2	8	9964	9971	75 %	0 %	25 %	0 %	384206121
33	NC_017227	GAAA	2	8	11027	11034	75 %	0 %	25 %	0 %	384206123
34	NC_017227	AACA	2	8	11357	11364	75 %	0 %	0 %	25 %	384206123
35	NC_017227	TCAA	2	8	12173	12180	50 %	25 %	0 %	25 %	384206124
36	NC_017227	GAAA	2	8	12338	12345	75 %	0 %	25 %	0 %	384206124
37	NC_017227	GTTT	2	8	12457	12464	0 %	75 %	25 %	0 %	384206124
38	NC_017227	TTAT	2	8	12587	12594	25 %	75 %	0 %	0 %	384206125
39	NC_017227	TAAT	2	8	12998	13005	50 %	50 %	0 %	0 %	384206126
40	NC_017227	GAGG	2	8	13294	13301	25 %	0 %	75 %	0 %	384206126
41	NC_017227	CAAA	2	8	13621	13628	75 %	0 %	0 %	25 %	384206126
42	NC_017227	ATTT	2	8	14096	14103	25 %	75 %	0 %	0 %	384206127
43	NC_017227	ATTA	2	8	14141	14148	50 %	50 %	0 %	0 %	384206127
44	NC_017227	ATAA	2	8	14274	14281	75 %	25 %	0 %	0 %	384206127
45	NC_017227	CTAT	2	8	15352	15359	25 %	50 %	0 %	25 %	384206129
46	NC_017227	ATCA	2	8	15652	15659	50 %	25 %	0 %	25 %	384206130
47	NC_017227	AGGA	2	8	15725	15732	50 %	0 %	50 %	0 %	384206130
48	NC_017227	CTAT	2	8	15737	15744	25 %	50 %	0 %	25 %	384206130
49	NC_017227	TAAC	2	8	15808	15815	50 %	25 %	0 %	25 %	384206131
50	NC_017227	TTAC	2	8	16114	16121	25 %	50 %	0 %	25 %	384206132
51	NC_017227	TCAA	2	8	16345	16352	50 %	25 %	0 %	25 %	384206132
52	NC_017227	GATT	2	8	16735	16742	25 %	50 %	25 %	0 %	384206133
53	NC_017227	ATAG	2	8	16802	16809	50 %	25 %	25 %	0 %	384206133
54	NC_017227	AGAT	2	8	16854	16861	50 %	25 %	25 %	0 %	384206133
55	NC_017227	TAAT	2	8	17142	17149	50 %	50 %	0 %	0 %	384206133
56	NC_017227	CTAA	2	8	17598	17605	50 %	25 %	0 %	25 %	384206134
57	NC_017227	GTTG	2	8	18624	18631	0 %	50 %	50 %	0 %	384206135
58	NC_017227	ATTC	2	8	18758	18765	25 %	50 %	0 %	25 %	384206135
59	NC_017227	CCAA	2	8	19235	19242	50 %	0 %	0 %	50 %	384206136
60	NC_017227	AAAC	2	8	20121	20128	75 %	0 %	0 %	25 %	384206136
61	NC_017227	ATTT	2	8	20392	20399	25 %	75 %	0 %	0 %	384206137
62	NC_017227	GAAT	2	8	20772	20779	50 %	25 %	25 %	0 %	384206137
63	NC_017227	AGTA	2	8	21312	21319	50 %	25 %	25 %	0 %	384206138
64	NC_017227	TTTA	2	8	21386	21393	25 %	75 %	0 %	0 %	384206138
65	NC_017227	ATGG	2	8	21638	21645	25 %	25 %	50 %	0 %	384206138
66	NC_017227	TAAA	2	8	21727	21734	75 %	25 %	0 %	0 %	384206139
67	NC_017227	AAAG	2	8	22044	22051	75 %	0 %	25 %	0 %	384206139
68	NC_017227	CAAA	2	8	22070	22077	75 %	0 %	0 %	25 %	384206139
69	NC_017227	TAAA	2	8	22307	22314	75 %	25 %	0 %	0 %	384206140
70	NC_017227	ATAG	2	8	22465	22472	50 %	25 %	25 %	0 %	384206140
71	NC_017227	ATAG	2	8	22498	22505	50 %	25 %	25 %	0 %	384206140
72	NC_017227	ATAG	2	8	22552	22559	50 %	25 %	25 %	0 %	384206140
73	NC_017227	ATAG	2	8	22639	22646	50 %	25 %	25 %	0 %	384206140
74	NC_017227	ATAG	2	8	22660	22667	50 %	25 %	25 %	0 %	384206140
75	NC_017227	TTTA	2	8	22785	22792	25 %	75 %	0 %	0 %	384206140
76	NC_017227	TTTA	2	8	23473	23480	25 %	75 %	0 %	0 %	384206141
77	NC_017227	AAAT	2	8	23938	23945	75 %	25 %	0 %	0 %	384206142
78	NC_017227	GATG	2	8	24020	24027	25 %	25 %	50 %	0 %	384206142
79	NC_017227	TAAA	2	8	24570	24577	75 %	25 %	0 %	0 %	384206142
80	NC_017227	AGAT	2	8	24733	24740	50 %	25 %	25 %	0 %	384206142
81	NC_017227	AGAA	2	8	25211	25218	75 %	0 %	25 %	0 %	384206143
82	NC_017227	ATAG	2	8	25292	25299	50 %	25 %	25 %	0 %	384206143
83	NC_017227	AAAT	3	12	25453	25464	75 %	25 %	0 %	0 %	384206144
84	NC_017227	ATTT	2	8	25483	25490	25 %	75 %	0 %	0 %	384206144
85	NC_017227	TTTG	2	8	25751	25758	0 %	75 %	25 %	0 %	384206144
86	NC_017227	CCAG	2	8	25838	25845	25 %	0 %	25 %	50 %	384206144
87	NC_017227	TTTA	2	8	26048	26055	25 %	75 %	0 %	0 %	384206144
88	NC_017227	AGAA	2	8	26942	26949	75 %	0 %	25 %	0 %	384206145
89	NC_017227	GAAA	2	8	27004	27011	75 %	0 %	25 %	0 %	384206145
90	NC_017227	GTTT	2	8	27873	27880	0 %	75 %	25 %	0 %	384206146
91	NC_017227	CAAC	2	8	28366	28373	50 %	0 %	0 %	50 %	384206147
92	NC_017227	CAAA	2	8	29609	29616	75 %	0 %	0 %	25 %	384206149
93	NC_017227	TAGC	2	8	29805	29812	25 %	25 %	25 %	25 %	384206149
94	NC_017227	ACAA	2	8	29993	30000	75 %	0 %	0 %	25 %	384206149
95	NC_017227	AGCA	2	8	30373	30380	50 %	0 %	25 %	25 %	384206149
96	NC_017227	TTTA	2	8	30612	30619	25 %	75 %	0 %	0 %	384206149

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.