MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-5

Total Repeats: 397

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017227	AGA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206107
2	NC_017227	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206107
3	NC_017227	ACT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206107
4	NC_017227	TAA	3	9	448	456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206107
5	NC_017227	ATA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206107
6	NC_017227	CAA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206107
7	NC_017227	CTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206107
8	NC_017227	AGT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206107
9	NC_017227	TAA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206107
10	NC_017227	TTA	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206107
11	NC_017227	ATG	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206107
12	NC_017227	ATT	2	6	1047	1052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206107
13	NC_017227	TAA	2	6	1240	1245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206107
14	NC_017227	GAG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206107
15	NC_017227	ATT	2	6	1273	1278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206107
16	NC_017227	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206108
17	NC_017227	AAG	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206108
18	NC_017227	AGG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206108
19	NC_017227	CAG	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206108
20	NC_017227	AGC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206108
21	NC_017227	TAA	2	6	1601	1606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206108
22	NC_017227	TTC	3	9	1811	1819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206108
23	NC_017227	ATT	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206108
24	NC_017227	AGA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206108
25	NC_017227	AGA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206109
26	NC_017227	CAA	2	6	2087	2092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206109
27	NC_017227	TGG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206109
28	NC_017227	AGC	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206109
29	NC_017227	TGG	3	9	2278	2286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206109
30	NC_017227	TGA	2	6	2287	2292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206109
31	NC_017227	ACT	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206109
32	NC_017227	AGA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206109
33	NC_017227	GTT	2	6	2601	2606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206110
34	NC_017227	AGA	2	6	2693	2698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206110
35	NC_017227	GAT	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206110
36	NC_017227	GTT	2	6	2806	2811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206110
37	NC_017227	AGA	2	6	2876	2881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206110
38	NC_017227	TAA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206110
39	NC_017227	TTA	2	6	3124	3129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206110
40	NC_017227	ATT	2	6	3253	3258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206110
41	NC_017227	ATA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206110
42	NC_017227	TGG	2	6	3326	3331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206110
43	NC_017227	ATC	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206111
44	NC_017227	TGG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206111
45	NC_017227	CCA	2	6	3697	3702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206111
46	NC_017227	AAT	2	6	3717	3722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206111
47	NC_017227	TAG	2	6	3736	3741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206111
48	NC_017227	GCA	2	6	3816	3821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206111
49	NC_017227	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206111
50	NC_017227	TAA	2	6	3930	3935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206111
51	NC_017227	ATT	2	6	3959	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206112
52	NC_017227	TGA	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206112
53	NC_017227	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206112
54	NC_017227	TAT	2	6	4022	4027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206112
55	NC_017227	AGA	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206112
56	NC_017227	AGT	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206112
57	NC_017227	TAA	3	9	4277	4285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206112
58	NC_017227	ATT	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206112
59	NC_017227	TTA	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206112
60	NC_017227	ACT	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206112
61	NC_017227	AGA	2	6	4451	4456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206112
62	NC_017227	GTG	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206112
63	NC_017227	ATG	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206112
64	NC_017227	CAG	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206112
65	NC_017227	GCA	2	6	4620	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206112
66	NC_017227	TAA	2	6	4676	4681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206112
67	NC_017227	CTA	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206112
68	NC_017227	GAA	3	9	4971	4979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206113
69	NC_017227	GTT	2	6	5184	5189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206113
70	NC_017227	ATT	2	6	5245	5250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206113
71	NC_017227	TGT	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206114
72	NC_017227	GAC	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206114
73	NC_017227	ATT	2	6	5555	5560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206114
74	NC_017227	GGC	2	6	5839	5844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206115
75	NC_017227	CAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206115
76	NC_017227	GTA	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206115
77	NC_017227	TTG	2	6	6092	6097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206115
78	NC_017227	AAT	2	6	6216	6221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206116
79	NC_017227	ATC	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206116
80	NC_017227	ACT	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206116
81	NC_017227	ATA	2	6	6484	6489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206116
82	NC_017227	TAA	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206116
83	NC_017227	AGG	2	6	6676	6681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206116
84	NC_017227	TGC	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206117
85	NC_017227	TAA	2	6	6840	6845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206117
86	NC_017227	CTG	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206117
87	NC_017227	TTA	2	6	7055	7060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206117
88	NC_017227	AAT	2	6	7231	7236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206117
89	NC_017227	GCT	2	6	7324	7329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206117
90	NC_017227	CTT	2	6	7336	7341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206117
91	NC_017227	GAC	2	6	7342	7347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206117
92	NC_017227	CTT	2	6	7393	7398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206117
93	NC_017227	TTG	2	6	7505	7510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206117
94	NC_017227	GTG	2	6	7574	7579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206117
95	NC_017227	ACT	2	6	7641	7646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206117
96	NC_017227	ATG	2	6	7739	7744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206117
97	NC_017227	TAC	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206117
98	NC_017227	GGT	2	6	7856	7861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206118
99	NC_017227	ACA	2	6	7904	7909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206118
100	NC_017227	GTT	2	6	7916	7921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206118
101	NC_017227	TAA	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206118
102	NC_017227	ATT	2	6	8123	8128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206118
103	NC_017227	GAA	2	6	8150	8155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206118
104	NC_017227	AAG	2	6	8161	8166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206118
105	NC_017227	CAG	2	6	8172	8177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206118
106	NC_017227	TTA	2	6	8256	8261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206119
107	NC_017227	TTA	2	6	8491	8496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206119
108	NC_017227	TTG	2	6	8508	8513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206119
109	NC_017227	TAT	2	6	8515	8520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206119
110	NC_017227	AAT	2	6	8600	8605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206119
111	NC_017227	GAT	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206119
112	NC_017227	GAT	2	6	8839	8844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206120
113	NC_017227	ATG	2	6	8861	8866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206120
114	NC_017227	GCA	2	6	8993	8998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206121
115	NC_017227	TTG	2	6	9348	9353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206121
116	NC_017227	GAA	2	6	9461	9466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206121
117	NC_017227	AAC	2	6	9519	9524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206121
118	NC_017227	ATT	2	6	9529	9534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206121
119	NC_017227	AAG	2	6	9552	9557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206121
120	NC_017227	GGA	2	6	9569	9574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206121
121	NC_017227	TAA	2	6	9580	9585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206121
122	NC_017227	AGA	2	6	9616	9621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206121
123	NC_017227	TTA	2	6	9642	9647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206121
124	NC_017227	GCA	2	6	9755	9760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206121
125	NC_017227	TGA	2	6	9766	9771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206121
126	NC_017227	GGA	2	6	9788	9793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206121
127	NC_017227	GAT	2	6	9805	9810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206121
128	NC_017227	TGA	2	6	9958	9963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206121
129	NC_017227	AAT	2	6	10060	10065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206121
130	NC_017227	TAA	2	6	10083	10088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206121
131	NC_017227	ATA	2	6	10095	10100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206121
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.