MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-5

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017227	TG	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	384206107
2	NC_017227	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	384206107
3	NC_017227	AG	4	8	1508	1515	50 %	0 %	50 %	0 %	384206108
4	NC_017227	TA	3	6	2951	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	384206110
5	NC_017227	CT	3	6	3174	3179	0 %	50 %	0 %	50 %	384206110
6	NC_017227	AT	3	6	4262	4267	50 %	50 %	0 %	0 %	384206112
7	NC_017227	AG	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	384206113
8	NC_017227	AG	3	6	5349	5354	50 %	0 %	50 %	0 %	384206113
9	NC_017227	AT	3	6	5601	5606	50 %	50 %	0 %	0 %	384206114
10	NC_017227	AT	3	6	5904	5909	50 %	50 %	0 %	0 %	384206115
11	NC_017227	TA	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	384206115
12	NC_017227	AT	4	8	6393	6400	50 %	50 %	0 %	0 %	384206116
13	NC_017227	TA	3	6	8630	8635	50 %	50 %	0 %	0 %	384206119
14	NC_017227	AT	3	6	11202	11207	50 %	50 %	0 %	0 %	384206123
15	NC_017227	TA	3	6	11720	11725	50 %	50 %	0 %	0 %	384206123
16	NC_017227	TA	3	6	11937	11942	50 %	50 %	0 %	0 %	384206124
17	NC_017227	CA	3	6	12111	12116	50 %	0 %	0 %	50 %	384206124
18	NC_017227	AT	3	6	12780	12785	50 %	50 %	0 %	0 %	384206125
19	NC_017227	AT	4	8	13172	13179	50 %	50 %	0 %	0 %	384206126
20	NC_017227	AT	3	6	13450	13455	50 %	50 %	0 %	0 %	384206126
21	NC_017227	AT	3	6	13859	13864	50 %	50 %	0 %	0 %	384206127
22	NC_017227	TA	3	6	15077	15082	50 %	50 %	0 %	0 %	384206128
23	NC_017227	AT	3	6	15482	15487	50 %	50 %	0 %	0 %	384206130
24	NC_017227	AG	3	6	15747	15752	50 %	0 %	50 %	0 %	384206130
25	NC_017227	AT	3	6	15893	15898	50 %	50 %	0 %	0 %	384206131
26	NC_017227	AT	3	6	16061	16066	50 %	50 %	0 %	0 %	384206131
27	NC_017227	AT	4	8	21080	21087	50 %	50 %	0 %	0 %	384206138
28	NC_017227	TA	3	6	21259	21264	50 %	50 %	0 %	0 %	384206138
29	NC_017227	TA	3	6	21709	21714	50 %	50 %	0 %	0 %	384206139
30	NC_017227	AT	3	6	22442	22447	50 %	50 %	0 %	0 %	384206140
31	NC_017227	TA	3	6	23395	23400	50 %	50 %	0 %	0 %	384206141
32	NC_017227	TA	3	6	23467	23472	50 %	50 %	0 %	0 %	384206141
33	NC_017227	TA	3	6	23850	23855	50 %	50 %	0 %	0 %	384206142
34	NC_017227	GT	3	6	24968	24973	0 %	50 %	50 %	0 %	384206143
35	NC_017227	TA	3	6	25910	25915	50 %	50 %	0 %	0 %	384206144
36	NC_017227	AC	3	6	26702	26707	50 %	0 %	0 %	50 %	384206145
37	NC_017227	GA	3	6	26885	26890	50 %	0 %	50 %	0 %	384206145
38	NC_017227	AT	3	6	27550	27555	50 %	50 %	0 %	0 %	384206146
39	NC_017227	TA	3	6	27593	27598	50 %	50 %	0 %	0 %	384206146
40	NC_017227	AT	3	6	28393	28398	50 %	50 %	0 %	0 %	384206147
41	NC_017227	TG	3	6	29138	29143	0 %	50 %	50 %	0 %	384206148
42	NC_017227	AT	3	6	29664	29669	50 %	50 %	0 %	0 %	384206149
43	NC_017227	AT	3	6	30004	30009	50 %	50 %	0 %	0 %	384206149
44	NC_017227	GA	3	6	30497	30502	50 %	0 %	50 %	0 %	384206149
45	NC_017227	AC	4	8	30604	30611	50 %	0 %	0 %	50 %	384206149
46	NC_017227	AT	3	6	30664	30669	50 %	50 %	0 %	0 %	384206149
47	NC_017227	AG	3	6	30910	30915	50 %	0 %	50 %	0 %	384206149

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.