MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-3

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017226	TTGATT	2	12	415	426	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384206064
2	NC_017226	CTGATA	2	12	2972	2983	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206067
3	NC_017226	GAATTT	2	12	5194	5205	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206070
4	NC_017226	TAGTGG	2	12	5256	5267	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384206070
5	NC_017226	AATGGA	2	12	6881	6892	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384206074
6	NC_017226	CTAAAT	2	12	9648	9659	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206078
7	NC_017226	CAAAAA	2	12	10166	10177	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384206078
8	NC_017226	CAAAAA	2	12	12585	12596	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384206082
9	NC_017226	CTTAAT	2	12	13127	13138	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384206083
10	NC_017226	AAACTC	2	12	13916	13927	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384206084
11	NC_017226	TAATGA	2	12	14916	14927	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206085
12	NC_017226	AAAAGT	2	12	16272	16283	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384206089
13	NC_017226	GTTCTT	2	12	18809	18820	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384206093
14	NC_017226	ATACTT	2	12	19209	19220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384206093
15	NC_017226	TTAAAA	2	12	25121	25132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206099
16	NC_017226	AAAAGA	2	12	27552	27563	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384206102
17	NC_017226	AGAATC	2	12	27638	27649	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384206102

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.