MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-3

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017226	GATTC	2	10	2710	2719	20 %	40 %	20 %	20 %	384206067
2	NC_017226	TTAAT	2	10	3263	3272	40 %	60 %	0 %	0 %	384206067
3	NC_017226	GCAAA	2	10	3859	3868	60 %	0 %	20 %	20 %	384206068
4	NC_017226	TAAAT	2	10	4925	4934	60 %	40 %	0 %	0 %	384206070
5	NC_017226	TAATA	2	10	6288	6297	60 %	40 %	0 %	0 %	384206073
6	NC_017226	GAAAA	2	10	6906	6915	80 %	0 %	20 %	0 %	384206074
7	NC_017226	CTGCA	2	10	7560	7569	20 %	20 %	20 %	40 %	384206074
8	NC_017226	AAAAC	2	10	8296	8305	80 %	0 %	0 %	20 %	384206076
9	NC_017226	ATATT	2	10	11599	11608	40 %	60 %	0 %	0 %	384206080
10	NC_017226	AATTT	2	10	12271	12280	40 %	60 %	0 %	0 %	384206081
11	NC_017226	TAAAA	2	10	12291	12300	80 %	20 %	0 %	0 %	384206081
12	NC_017226	ACTCA	2	10	13327	13336	40 %	20 %	0 %	40 %	384206083
13	NC_017226	AAAGT	2	10	13394	13403	60 %	20 %	20 %	0 %	384206083
14	NC_017226	AGAAA	2	10	14160	14169	80 %	0 %	20 %	0 %	384206084
15	NC_017226	TCAAA	2	10	14385	14394	60 %	20 %	0 %	20 %	384206085
16	NC_017226	ATCTT	2	10	14897	14906	20 %	60 %	0 %	20 %	384206085
17	NC_017226	TTATG	2	10	16236	16245	20 %	60 %	20 %	0 %	384206089
18	NC_017226	AAAAT	2	10	17662	17671	80 %	20 %	0 %	0 %	384206091
19	NC_017226	CACTT	2	10	18897	18906	20 %	40 %	0 %	40 %	384206093
20	NC_017226	AATTT	2	10	19285	19294	40 %	60 %	0 %	0 %	384206093
21	NC_017226	TTACA	2	10	19500	19509	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017226	AAAAG	2	10	20682	20691	80 %	0 %	20 %	0 %	384206094
23	NC_017226	AAAAG	2	10	21020	21029	80 %	0 %	20 %	0 %	384206095
24	NC_017226	ATTTT	2	10	22829	22838	20 %	80 %	0 %	0 %	384206098
25	NC_017226	ATTTT	2	10	23311	23320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017226	TAATA	2	10	23628	23637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017226	AAAAC	2	10	25393	25402	80 %	0 %	0 %	20 %	384206100
28	NC_017226	ATTTT	2	10	26485	26494	20 %	80 %	0 %	0 %	384206101
29	NC_017226	ATACT	2	10	26778	26787	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017226	ATTTG	2	10	26816	26825	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017226	TAAAA	2	10	27947	27956	80 %	20 %	0 %	0 %	384206102
32	NC_017226	GAAAA	2	10	29946	29955	80 %	0 %	20 %	0 %	384206105
33	NC_017226	CAAGG	2	10	30512	30521	40 %	0 %	40 %	20 %	384206105

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.