MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-3

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017226	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	384206064
2	NC_017226	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	384206064
3	NC_017226	AGTA	2	8	1110	1117	50 %	25 %	25 %	0 %	384206064
4	NC_017226	AGTA	2	8	1206	1213	50 %	25 %	25 %	0 %	384206064
5	NC_017226	AATT	2	8	1896	1903	50 %	50 %	0 %	0 %	384206065
6	NC_017226	TTAT	2	8	2520	2527	25 %	75 %	0 %	0 %	384206066
7	NC_017226	GTAA	2	8	2567	2574	50 %	25 %	25 %	0 %	384206066
8	NC_017226	GCAG	2	8	2628	2635	25 %	0 %	50 %	25 %	384206067
9	NC_017226	CAAG	2	8	2665	2672	50 %	0 %	25 %	25 %	384206067
10	NC_017226	ATGT	2	8	3002	3009	25 %	50 %	25 %	0 %	384206067
11	NC_017226	ATAA	2	8	3109	3116	75 %	25 %	0 %	0 %	384206067
12	NC_017226	CAAT	2	8	3191	3198	50 %	25 %	0 %	25 %	384206067
13	NC_017226	AGAT	2	8	3234	3241	50 %	25 %	25 %	0 %	384206067
14	NC_017226	AATG	2	8	3356	3363	50 %	25 %	25 %	0 %	384206068
15	NC_017226	GTAA	2	8	3919	3926	50 %	25 %	25 %	0 %	384206068
16	NC_017226	TCAT	2	8	4833	4840	25 %	50 %	0 %	25 %	384206069
17	NC_017226	AGTG	2	8	5387	5394	25 %	25 %	50 %	0 %	384206070
18	NC_017226	GGAC	2	8	5761	5768	25 %	0 %	50 %	25 %	384206071
19	NC_017226	AACT	2	8	6120	6127	50 %	25 %	0 %	25 %	384206072
20	NC_017226	AATC	2	8	6514	6521	50 %	25 %	0 %	25 %	384206073
21	NC_017226	TAAA	2	8	6536	6543	75 %	25 %	0 %	0 %	384206073
22	NC_017226	GAAA	3	12	7204	7215	75 %	0 %	25 %	0 %	384206074
23	NC_017226	TTAT	2	8	7221	7228	25 %	75 %	0 %	0 %	384206074
24	NC_017226	CAAG	2	8	7280	7287	50 %	0 %	25 %	25 %	384206074
25	NC_017226	TTAC	2	8	7719	7726	25 %	50 %	0 %	25 %	384206074
26	NC_017226	TGCT	2	8	8086	8093	0 %	50 %	25 %	25 %	384206075
27	NC_017226	ATTT	2	8	8483	8490	25 %	75 %	0 %	0 %	384206076
28	NC_017226	CTTA	2	8	8669	8676	25 %	50 %	0 %	25 %	384206076
29	NC_017226	CTTG	2	8	8776	8783	0 %	50 %	25 %	25 %	384206077
30	NC_017226	AATT	2	8	8922	8929	50 %	50 %	0 %	0 %	384206077
31	NC_017226	GTTG	2	8	9878	9885	0 %	50 %	50 %	0 %	384206078
32	NC_017226	TTGG	3	12	10122	10133	0 %	50 %	50 %	0 %	384206078
33	NC_017226	AAAT	2	8	11713	11720	75 %	25 %	0 %	0 %	384206080
34	NC_017226	TCAA	2	8	12177	12184	50 %	25 %	0 %	25 %	384206081
35	NC_017226	GAAA	2	8	12342	12349	75 %	0 %	25 %	0 %	384206081
36	NC_017226	GTTT	2	8	12467	12474	0 %	75 %	25 %	0 %	384206081
37	NC_017226	TTAT	2	8	12597	12604	25 %	75 %	0 %	0 %	384206082
38	NC_017226	TAAT	2	8	13008	13015	50 %	50 %	0 %	0 %	384206083
39	NC_017226	ATTT	2	8	14106	14113	25 %	75 %	0 %	0 %	384206084
40	NC_017226	ATCA	2	8	15661	15668	50 %	25 %	0 %	25 %	384206087
41	NC_017226	AGGA	2	8	15734	15741	50 %	0 %	50 %	0 %	384206087
42	NC_017226	CTAT	2	8	15746	15753	25 %	50 %	0 %	25 %	384206087
43	NC_017226	TAAC	2	8	15817	15824	50 %	25 %	0 %	25 %	384206088
44	NC_017226	TTAC	2	8	16123	16130	25 %	50 %	0 %	25 %	384206089
45	NC_017226	TCAA	2	8	16354	16361	50 %	25 %	0 %	25 %	384206089
46	NC_017226	ATAG	2	8	16799	16806	50 %	25 %	25 %	0 %	384206090
47	NC_017226	GAAT	2	8	16879	16886	50 %	25 %	25 %	0 %	384206090
48	NC_017226	AATT	2	8	17079	17086	50 %	50 %	0 %	0 %	384206090
49	NC_017226	AAAG	2	8	17688	17695	75 %	0 %	25 %	0 %	384206091
50	NC_017226	CAAG	2	8	17794	17801	50 %	0 %	25 %	25 %	384206091
51	NC_017226	TTTC	2	8	20384	20391	0 %	75 %	0 %	25 %	384206094
52	NC_017226	ATTT	2	8	20919	20926	25 %	75 %	0 %	0 %	384206095
53	NC_017226	GAAT	2	8	21299	21306	50 %	25 %	25 %	0 %	384206095
54	NC_017226	ATTT	2	8	21898	21905	25 %	75 %	0 %	0 %	384206096
55	NC_017226	ATTT	2	8	21928	21935	25 %	75 %	0 %	0 %	384206096
56	NC_017226	TAAA	2	8	22087	22094	75 %	25 %	0 %	0 %	384206096
57	NC_017226	TAAA	2	8	22201	22208	75 %	25 %	0 %	0 %	384206097
58	NC_017226	GAAA	2	8	22274	22281	75 %	0 %	25 %	0 %	384206097
59	NC_017226	CAAA	2	8	22562	22569	75 %	0 %	0 %	25 %	384206097
60	NC_017226	TAAA	2	8	22799	22806	75 %	25 %	0 %	0 %	384206098
61	NC_017226	AGAA	2	8	22875	22882	75 %	0 %	25 %	0 %	384206098
62	NC_017226	TAAT	2	8	22904	22911	50 %	50 %	0 %	0 %	384206098
63	NC_017226	ATAG	2	8	23044	23051	50 %	25 %	25 %	0 %	384206098
64	NC_017226	AGAT	2	8	23063	23070	50 %	25 %	25 %	0 %	384206098
65	NC_017226	AAAT	2	8	24435	24442	75 %	25 %	0 %	0 %	384206099
66	NC_017226	GATG	2	8	24517	24524	25 %	25 %	50 %	0 %	384206099
67	NC_017226	TAAA	2	8	25067	25074	75 %	25 %	0 %	0 %	384206099
68	NC_017226	AGAT	2	8	25230	25237	50 %	25 %	25 %	0 %	384206099
69	NC_017226	AGAA	2	8	25713	25720	75 %	0 %	25 %	0 %	384206100
70	NC_017226	ATAG	2	8	25794	25801	50 %	25 %	25 %	0 %	384206100
71	NC_017226	AAAT	3	12	25955	25966	75 %	25 %	0 %	0 %	384206101
72	NC_017226	ATTT	2	8	25985	25992	25 %	75 %	0 %	0 %	384206101
73	NC_017226	CCAG	2	8	26340	26347	25 %	0 %	25 %	50 %	384206101
74	NC_017226	GTTT	2	8	26359	26366	0 %	75 %	25 %	0 %	384206101
75	NC_017226	AGAA	2	8	27101	27108	75 %	0 %	25 %	0 %	384206102
76	NC_017226	AGAA	2	8	27599	27606	75 %	0 %	25 %	0 %	384206102
77	NC_017226	TATT	2	8	27854	27861	25 %	75 %	0 %	0 %	384206102
78	NC_017226	TAAA	2	8	28143	28150	75 %	25 %	0 %	0 %	384206102
79	NC_017226	CAAC	2	8	28536	28543	50 %	0 %	0 %	50 %	384206103
80	NC_017226	TAAA	2	8	29573	29580	75 %	25 %	0 %	0 %	384206104
81	NC_017226	CAAA	2	8	29778	29785	75 %	0 %	0 %	25 %	384206105
82	NC_017226	TAGC	2	8	29974	29981	25 %	25 %	25 %	25 %	384206105
83	NC_017226	ACAA	2	8	30162	30169	75 %	0 %	0 %	25 %	384206105
84	NC_017226	AGCA	2	8	30542	30549	50 %	0 %	25 %	25 %	384206105

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.