MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-3

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017226	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206064
2	NC_017226	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206064
3	NC_017226	ACT	2	6	329	334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206064
4	NC_017226	TAA	3	9	449	457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206064
5	NC_017226	ATA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206064
6	NC_017226	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206064
7	NC_017226	AGT	3	9	714	722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206064
8	NC_017226	TAA	2	6	854	859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206064
9	NC_017226	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206064
10	NC_017226	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206064
11	NC_017226	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206064
12	NC_017226	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206064
13	NC_017226	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206064
14	NC_017226	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206064
15	NC_017226	GAA	2	6	1318	1323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206065
16	NC_017226	AAG	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206065
17	NC_017226	AGG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206065
18	NC_017226	CAG	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206065
19	NC_017226	ATT	2	6	1533	1538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206065
20	NC_017226	AGC	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206065
21	NC_017226	TAA	2	6	1602	1607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206065
22	NC_017226	TTC	3	9	1812	1820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206065
23	NC_017226	ATT	2	6	1843	1848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206065
24	NC_017226	AGA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206065
25	NC_017226	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206066
26	NC_017226	CAA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206066
27	NC_017226	GGT	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206066
28	NC_017226	AGC	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206066
29	NC_017226	TGG	3	9	2279	2287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206066
30	NC_017226	TGA	2	6	2288	2293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206066
31	NC_017226	ACT	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206066
32	NC_017226	AGA	2	6	2513	2518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206066
33	NC_017226	GTT	2	6	2602	2607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206067
34	NC_017226	AGA	2	6	2694	2699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206067
35	NC_017226	GAT	2	6	2728	2733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206067
36	NC_017226	GTT	2	6	2807	2812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206067
37	NC_017226	AGA	2	6	2877	2882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206067
38	NC_017226	TAA	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206067
39	NC_017226	TTA	2	6	3125	3130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206067
40	NC_017226	ATT	2	6	3254	3259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206067
41	NC_017226	ATA	2	6	3310	3315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206067
42	NC_017226	TGG	2	6	3327	3332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206067
43	NC_017226	ATC	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206068
44	NC_017226	TGG	2	6	3639	3644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206068
45	NC_017226	CCA	2	6	3698	3703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206068
46	NC_017226	AAT	2	6	3718	3723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206068
47	NC_017226	TAG	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206068
48	NC_017226	GCA	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206068
49	NC_017226	ATG	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206068
50	NC_017226	TAA	2	6	3931	3936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206068
51	NC_017226	ATT	2	6	3960	3965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206069
52	NC_017226	TGA	2	6	3966	3971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206069
53	NC_017226	ATT	2	6	3974	3979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206069
54	NC_017226	TAT	2	6	4023	4028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206069
55	NC_017226	AGA	2	6	4056	4061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206069
56	NC_017226	AGT	2	6	4179	4184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206069
57	NC_017226	TAA	3	9	4278	4286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206069
58	NC_017226	ATT	2	6	4330	4335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206069
59	NC_017226	TTA	2	6	4340	4345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206069
60	NC_017226	TAC	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206069
61	NC_017226	ACT	2	6	4425	4430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206069
62	NC_017226	AGA	2	6	4452	4457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206069
63	NC_017226	GTG	2	6	4466	4471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206069
64	NC_017226	ATG	2	6	4555	4560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206069
65	NC_017226	CAG	2	6	4607	4612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206069
66	NC_017226	GCA	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206069
67	NC_017226	TAA	2	6	4677	4682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206069
68	NC_017226	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206069
69	NC_017226	GAA	3	9	4972	4980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206070
70	NC_017226	GTT	2	6	5185	5190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206070
71	NC_017226	ATT	2	6	5246	5251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206070
72	NC_017226	TGT	2	6	5480	5485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206071
73	NC_017226	GAC	2	6	5499	5504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206071
74	NC_017226	ATT	2	6	5556	5561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206071
75	NC_017226	GGT	2	6	5796	5801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206072
76	NC_017226	GGC	2	6	5840	5845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206072
77	NC_017226	CAA	2	6	5911	5916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206072
78	NC_017226	GTA	2	6	6069	6074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206072
79	NC_017226	TTG	2	6	6093	6098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206072
80	NC_017226	AAT	2	6	6217	6222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206073
81	NC_017226	ATC	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206073
82	NC_017226	ACT	2	6	6277	6282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206073
83	NC_017226	ATA	2	6	6485	6490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206073
84	NC_017226	TTA	2	6	6590	6595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206073
85	NC_017226	AAT	2	6	6660	6665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206073
86	NC_017226	AGG	2	6	6677	6682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206073
87	NC_017226	ATT	2	6	6753	6758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206074
88	NC_017226	TGC	2	6	6808	6813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206074
89	NC_017226	TAA	2	6	6841	6846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206074
90	NC_017226	CTG	2	6	6920	6925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206074
91	NC_017226	TTA	2	6	7056	7061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206074
92	NC_017226	AAT	2	6	7232	7237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206074
93	NC_017226	CAC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206074
94	NC_017226	TGC	2	6	7348	7353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206074
95	NC_017226	CTT	2	6	7394	7399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206074
96	NC_017226	TTG	2	6	7506	7511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206074
97	NC_017226	GTG	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206074
98	NC_017226	ACT	2	6	7642	7647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206074
99	NC_017226	ATG	2	6	7740	7745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206074
100	NC_017226	TAC	2	6	7759	7764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206074
101	NC_017226	GGT	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206075
102	NC_017226	ACA	2	6	7905	7910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206075
103	NC_017226	GTT	2	6	7917	7922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206075
104	NC_017226	TAA	2	6	7948	7953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206075
105	NC_017226	ATT	2	6	8124	8129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206075
106	NC_017226	GAA	2	6	8151	8156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206075
107	NC_017226	AAG	2	6	8162	8167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206075
108	NC_017226	CAG	2	6	8173	8178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206075
109	NC_017226	TTA	2	6	8257	8262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206076
110	NC_017226	TAT	2	6	8493	8498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206076
111	NC_017226	TTG	2	6	8509	8514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206076
112	NC_017226	TAT	2	6	8516	8521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206076
113	NC_017226	AAT	2	6	8601	8606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206076
114	NC_017226	GAT	2	6	8637	8642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206076
115	NC_017226	GAT	2	6	8840	8845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206077
116	NC_017226	ATG	2	6	8862	8867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206077
117	NC_017226	TTG	2	6	9349	9354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206078
118	NC_017226	AGA	2	6	9590	9595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206078
119	NC_017226	GCG	2	6	9715	9720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206078
120	NC_017226	CTA	2	6	9780	9785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206078
121	NC_017226	AGA	2	6	9815	9820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206078
122	NC_017226	AGA	2	6	9938	9943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206078
123	NC_017226	ACC	2	6	9990	9995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206078
124	NC_017226	CCT	2	6	10155	10160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206078
125	NC_017226	ATT	2	6	10302	10307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206079
126	NC_017226	AAT	2	6	10308	10313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206079
127	NC_017226	ATA	2	6	10366	10371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206079
128	NC_017226	TAA	2	6	10426	10431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206079
129	NC_017226	GTT	2	6	10582	10587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206079
130	NC_017226	TTA	2	6	10600	10605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206079
131	NC_017226	TAT	2	6	10608	10613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206079
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382	NC_017226	TAG	2	6	30905	30910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206105
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.