MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-12

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017225	AGA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206021
2	NC_017225	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206021
3	NC_017225	ACT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206021
4	NC_017225	TAA	3	9	448	456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206021
5	NC_017225	ATA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206021
6	NC_017225	CAA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206021
7	NC_017225	CTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206021
8	NC_017225	AGT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206021
9	NC_017225	TAA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206021
10	NC_017225	TTA	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206021
11	NC_017225	ATG	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206021
12	NC_017225	ATT	2	6	1047	1052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206021
13	NC_017225	TAA	2	6	1240	1245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206021
14	NC_017225	GAG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206021
15	NC_017225	ATT	2	6	1273	1278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206021
16	NC_017225	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206022
17	NC_017225	AAG	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206022
18	NC_017225	AGG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206022
19	NC_017225	CAG	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206022
20	NC_017225	AGC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206022
21	NC_017225	TAA	2	6	1601	1606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206022
22	NC_017225	ACT	2	6	1613	1618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206022
23	NC_017225	TTC	3	9	1811	1819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206022
24	NC_017225	ATT	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206022
25	NC_017225	AGA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206022
26	NC_017225	AGA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206023
27	NC_017225	CAA	2	6	2087	2092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206023
28	NC_017225	TGG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206023
29	NC_017225	AGC	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206023
30	NC_017225	TGG	3	9	2278	2286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206023
31	NC_017225	ACT	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206023
32	NC_017225	AGA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206023
33	NC_017225	GTT	2	6	2601	2606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206024
34	NC_017225	AGA	2	6	2693	2698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206024
35	NC_017225	GAT	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206024
36	NC_017225	GTT	2	6	2806	2811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206024
37	NC_017225	TAA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206024
38	NC_017225	TTA	2	6	3124	3129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206024
39	NC_017225	ATT	2	6	3253	3258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206024
40	NC_017225	ATA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206024
41	NC_017225	TGG	2	6	3326	3331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206024
42	NC_017225	ATC	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206025
43	NC_017225	TGG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206025
44	NC_017225	CCA	2	6	3697	3702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206025
45	NC_017225	AAT	2	6	3717	3722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206025
46	NC_017225	TAG	2	6	3736	3741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206025
47	NC_017225	GCA	2	6	3816	3821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206025
48	NC_017225	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206025
49	NC_017225	TAA	2	6	3930	3935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206025
50	NC_017225	ATT	2	6	3959	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206026
51	NC_017225	TGA	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206026
52	NC_017225	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206026
53	NC_017225	TAT	2	6	4022	4027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206026
54	NC_017225	AGA	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206026
55	NC_017225	AGT	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206026
56	NC_017225	TAA	3	9	4277	4285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206026
57	NC_017225	ATT	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206026
58	NC_017225	TTA	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206026
59	NC_017225	ACT	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206026
60	NC_017225	AGA	2	6	4451	4456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206026
61	NC_017225	GTG	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206026
62	NC_017225	ATG	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206026
63	NC_017225	CAG	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206026
64	NC_017225	GCA	2	6	4620	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206026
65	NC_017225	TAA	2	6	4676	4681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206026
66	NC_017225	CTA	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206026
67	NC_017225	GAA	3	9	4971	4979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206027
68	NC_017225	GTT	2	6	5184	5189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206027
69	NC_017225	ATT	2	6	5245	5250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206027
70	NC_017225	TGT	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206028
71	NC_017225	GAC	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206028
72	NC_017225	ATT	2	6	5555	5560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206028
73	NC_017225	GGT	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206029
74	NC_017225	GGC	2	6	5839	5844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206029
75	NC_017225	CAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206029
76	NC_017225	GTA	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206029
77	NC_017225	TTG	2	6	6092	6097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206029
78	NC_017225	AAT	2	6	6216	6221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206030
79	NC_017225	ATC	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206030
80	NC_017225	ACT	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206030
81	NC_017225	ATA	2	6	6484	6489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206030
82	NC_017225	TTA	2	6	6589	6594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206030
83	NC_017225	AAT	2	6	6659	6664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206030
84	NC_017225	AGG	2	6	6676	6681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206030
85	NC_017225	ATT	2	6	6752	6757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206031
86	NC_017225	TGC	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206031
87	NC_017225	TAA	2	6	6840	6845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206031
88	NC_017225	GAG	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206031
89	NC_017225	TGT	2	6	7047	7052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206031
90	NC_017225	TTA	2	6	7055	7060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206031
91	NC_017225	GAT	2	6	7081	7086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206031
92	NC_017225	GAC	2	6	7105	7110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206031
93	NC_017225	AAT	2	6	7231	7236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206031
94	NC_017225	CTA	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206031
95	NC_017225	CAC	2	6	7331	7336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206031
96	NC_017225	TGA	2	6	7341	7346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206031
97	NC_017225	TGC	2	6	7347	7352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206031
98	NC_017225	CTT	2	6	7393	7398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206031
99	NC_017225	TTG	2	6	7505	7510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206031
100	NC_017225	GTG	2	6	7574	7579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206031
101	NC_017225	ACT	2	6	7641	7646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206031
102	NC_017225	ATG	2	6	7739	7744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206031
103	NC_017225	TAC	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206031
104	NC_017225	GGT	2	6	7856	7861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206032
105	NC_017225	ACA	2	6	7904	7909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206032
106	NC_017225	GTT	2	6	7916	7921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206032
107	NC_017225	TAA	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206032
108	NC_017225	ATT	2	6	8123	8128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206032
109	NC_017225	GAA	2	6	8150	8155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206032
110	NC_017225	AAG	2	6	8161	8166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206032
111	NC_017225	CAG	2	6	8172	8177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206032
112	NC_017225	TTA	2	6	8256	8261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206033
113	NC_017225	TAT	2	6	8492	8497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206033
114	NC_017225	TTG	2	6	8508	8513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206033
115	NC_017225	TAT	2	6	8515	8520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206033
116	NC_017225	AAT	2	6	8600	8605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206033
117	NC_017225	GAT	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206033
118	NC_017225	GAT	2	6	8839	8844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206034
119	NC_017225	ATG	2	6	8861	8866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206034
120	NC_017225	AAG	2	6	9228	9233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206035
121	NC_017225	TTG	2	6	9348	9353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206035
122	NC_017225	AGC	2	6	9409	9414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206035
123	NC_017225	AGG	2	6	9415	9420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206035
124	NC_017225	AGA	2	6	9571	9576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206035
125	NC_017225	GCG	2	6	9696	9701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206035
126	NC_017225	CTA	2	6	9761	9766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206035
127	NC_017225	AGA	2	6	9796	9801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206035
128	NC_017225	AGA	2	6	9919	9924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206035
129	NC_017225	ACC	2	6	9971	9976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206035
130	NC_017225	CCT	2	6	10136	10141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206035
131	NC_017225	ATT	2	6	10283	10288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206036
132	NC_017225	AAT	2	6	10289	10294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206036
133	NC_017225	ATA	2	6	10347	10352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206036
134	NC_017225	TAA	2	6	10407	10412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206036
135	NC_017225	GTT	2	6	10563	10568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206036
136	NC_017225	TTA	2	6	10581	10586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206036
137	NC_017225	TAT	2	6	10589	10594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206036
138	NC_017225	GTG	2	6	10656	10661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206036
139	NC_017225	ACT	2	6	10706	10711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206036
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152	NC_017225	AAG	2	6	11971	11976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206038
153	NC_017225	AGC	2	6	12040	12045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206038
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157	NC_017225	AAC	2	6	12311	12316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206038
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161	NC_017225	TAA	2	6	12523	12528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206039
162	NC_017225	TTG	2	6	12540	12545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206039
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.