MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-12

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017225	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017225	TG	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	384206021
3	NC_017225	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	384206021
4	NC_017225	AG	4	8	1508	1515	50 %	0 %	50 %	0 %	384206022
5	NC_017225	TA	3	6	2951	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	384206024
6	NC_017225	CT	3	6	3174	3179	0 %	50 %	0 %	50 %	384206024
7	NC_017225	AT	3	6	4262	4267	50 %	50 %	0 %	0 %	384206026
8	NC_017225	AG	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	384206027
9	NC_017225	AG	3	6	5349	5354	50 %	0 %	50 %	0 %	384206027
10	NC_017225	AT	3	6	5601	5606	50 %	50 %	0 %	0 %	384206028
11	NC_017225	AT	3	6	5904	5909	50 %	50 %	0 %	0 %	384206029
12	NC_017225	TA	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	384206029
13	NC_017225	AT	4	8	6393	6400	50 %	50 %	0 %	0 %	384206030
14	NC_017225	TA	3	6	8630	8635	50 %	50 %	0 %	0 %	384206033
15	NC_017225	AT	3	6	9790	9795	50 %	50 %	0 %	0 %	384206035
16	NC_017225	AT	3	6	10644	10649	50 %	50 %	0 %	0 %	384206036
17	NC_017225	AC	3	6	11730	11735	50 %	0 %	0 %	50 %	384206037
18	NC_017225	CA	3	6	12096	12101	50 %	0 %	0 %	50 %	384206038
19	NC_017225	AT	3	6	12765	12770	50 %	50 %	0 %	0 %	384206039
20	NC_017225	AT	4	8	13157	13164	50 %	50 %	0 %	0 %	384206040
21	NC_017225	AT	3	6	13435	13440	50 %	50 %	0 %	0 %	384206040
22	NC_017225	AT	3	6	13844	13849	50 %	50 %	0 %	0 %	384206041
23	NC_017225	TA	3	6	15062	15067	50 %	50 %	0 %	0 %	384206042
24	NC_017225	TA	3	6	15166	15171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017225	TA	3	6	15175	15180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017225	AT	3	6	15466	15471	50 %	50 %	0 %	0 %	384206044
27	NC_017225	AG	3	6	15731	15736	50 %	0 %	50 %	0 %	384206044
28	NC_017225	AT	3	6	15877	15882	50 %	50 %	0 %	0 %	384206045
29	NC_017225	AT	3	6	15942	15947	50 %	50 %	0 %	0 %	384206045
30	NC_017225	AT	3	6	17201	17206	50 %	50 %	0 %	0 %	384206048
31	NC_017225	TA	3	6	18700	18705	50 %	50 %	0 %	0 %	384206050
32	NC_017225	CT	3	6	18771	18776	0 %	50 %	0 %	50 %	384206050
33	NC_017225	TA	3	6	20575	20580	50 %	50 %	0 %	0 %	384206052
34	NC_017225	AT	3	6	20943	20948	50 %	50 %	0 %	0 %	384206052
35	NC_017225	TA	3	6	21318	21323	50 %	50 %	0 %	0 %	384206053
36	NC_017225	AT	3	6	21742	21747	50 %	50 %	0 %	0 %	384206054
37	NC_017225	AT	3	6	21970	21975	50 %	50 %	0 %	0 %	384206054
38	NC_017225	AT	3	6	22501	22506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017225	AT	3	6	22633	22638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017225	TA	3	6	22700	22705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017225	TA	3	6	22773	22778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017225	TA	3	6	23162	23167	50 %	50 %	0 %	0 %	384206055
43	NC_017225	GT	3	6	24283	24288	0 %	50 %	50 %	0 %	384206056
44	NC_017225	AT	3	6	25447	25452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017225	CA	3	6	25579	25584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017225	TG	3	6	25602	25607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017225	AT	3	6	25608	25613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017225	GA	3	6	25683	25688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017225	TA	3	6	26137	26142	50 %	50 %	0 %	0 %	384206058
50	NC_017225	AT	3	6	26298	26303	50 %	50 %	0 %	0 %	384206058
51	NC_017225	GA	3	6	27052	27057	50 %	0 %	50 %	0 %	384206059
52	NC_017225	AT	3	6	27908	27913	50 %	50 %	0 %	0 %	384206060
53	NC_017225	TG	3	6	28254	28259	0 %	50 %	50 %	0 %	384206061
54	NC_017225	AT	3	6	28780	28785	50 %	50 %	0 %	0 %	384206062
55	NC_017225	AT	3	6	29120	29125	50 %	50 %	0 %	0 %	384206062
56	NC_017225	GA	3	6	29613	29618	50 %	0 %	50 %	0 %	384206062
57	NC_017225	AC	4	8	29720	29727	50 %	0 %	0 %	50 %	384206062
58	NC_017225	AT	3	6	29780	29785	50 %	50 %	0 %	0 %	384206062
59	NC_017225	AG	3	6	30026	30031	50 %	0 %	50 %	0 %	384206062

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.