MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-11

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017224	GATTC	2	10	2709	2718	20 %	40 %	20 %	20 %	384206413
2	NC_017224	TTAAT	2	10	3262	3271	40 %	60 %	0 %	0 %	384206413
3	NC_017224	GCAAA	2	10	3858	3867	60 %	0 %	20 %	20 %	384206414
4	NC_017224	TAAAT	2	10	4924	4933	60 %	40 %	0 %	0 %	384206416
5	NC_017224	GAAAA	2	10	6908	6917	80 %	0 %	20 %	0 %	384206420
6	NC_017224	ATATT	2	10	11604	11613	40 %	60 %	0 %	0 %	384206426
7	NC_017224	AATTT	2	10	12276	12285	40 %	60 %	0 %	0 %	384206427
8	NC_017224	TAAAA	2	10	12296	12305	80 %	20 %	0 %	0 %	384206427
9	NC_017224	TACAA	2	10	12766	12775	60 %	20 %	0 %	20 %	384206428
10	NC_017224	ACTCA	2	10	13326	13335	40 %	20 %	0 %	40 %	384206429
11	NC_017224	AGAAA	2	10	14160	14169	80 %	0 %	20 %	0 %	384206430
12	NC_017224	TCAAA	2	10	14385	14394	60 %	20 %	0 %	20 %	384206431
13	NC_017224	AAGTC	2	10	15114	15123	40 %	20 %	20 %	20 %	384206431
14	NC_017224	TTATG	2	10	16216	16225	20 %	60 %	20 %	0 %	384206435
15	NC_017224	TAGCA	2	10	17072	17081	40 %	20 %	20 %	20 %	384206436
16	NC_017224	AATTT	2	10	18972	18981	40 %	60 %	0 %	0 %	384206438
17	NC_017224	AGTTA	2	10	19582	19591	40 %	40 %	20 %	0 %	384206439
18	NC_017224	TTTTA	2	10	19948	19957	20 %	80 %	0 %	0 %	384206439
19	NC_017224	AATTG	2	10	20260	20269	40 %	40 %	20 %	0 %	384206439
20	NC_017224	AAAAG	2	10	20341	20350	80 %	0 %	20 %	0 %	384206439
21	NC_017224	ATTAT	2	10	21001	21010	40 %	60 %	0 %	0 %	384206440
22	NC_017224	ATTTT	2	10	22365	22374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017224	GAGTT	2	10	23909	23918	20 %	40 %	40 %	0 %	384206443
24	NC_017224	AAAAC	2	10	24369	24378	80 %	0 %	0 %	20 %	384206444
25	NC_017224	TGTTT	2	10	25050	25059	0 %	80 %	20 %	0 %	384206445
26	NC_017224	ATTTT	2	10	25461	25470	20 %	80 %	0 %	0 %	384206445
27	NC_017224	TTTTA	2	10	25628	25637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017224	ATTTG	2	10	25792	25801	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017224	AGAAA	2	10	26671	26680	80 %	0 %	20 %	0 %	384206446
30	NC_017224	AAGAC	2	10	26718	26727	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017224	GTCTT	2	10	26737	26746	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017224	TAATT	2	10	26920	26929	40 %	60 %	0 %	0 %	384206447
33	NC_017224	TAATT	2	10	27382	27391	40 %	60 %	0 %	0 %	384206447
34	NC_017224	GAAAA	2	10	29546	29555	80 %	0 %	20 %	0 %	384206450

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.