MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-11

Total Repeats: 428

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017224	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017224	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017224	AGA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206410
4	NC_017224	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206410
5	NC_017224	ACT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206410
6	NC_017224	TAA	3	9	448	456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206410
7	NC_017224	ATA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206410
8	NC_017224	CAA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206410
9	NC_017224	CTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206410
10	NC_017224	AGT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206410
11	NC_017224	TAA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206410
12	NC_017224	TTA	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206410
13	NC_017224	ATG	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206410
14	NC_017224	ATT	2	6	1047	1052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206410
15	NC_017224	TAA	2	6	1240	1245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206410
16	NC_017224	GAG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206410
17	NC_017224	ATT	2	6	1273	1278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206410
18	NC_017224	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206411
19	NC_017224	AAG	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206411
20	NC_017224	AGG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206411
21	NC_017224	CAG	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206411
22	NC_017224	AGC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206411
23	NC_017224	TAA	2	6	1601	1606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206411
24	NC_017224	TTC	3	9	1811	1819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206411
25	NC_017224	ATT	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206411
26	NC_017224	AGA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206411
27	NC_017224	AGA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206412
28	NC_017224	CAA	2	6	2087	2092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206412
29	NC_017224	TGG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206412
30	NC_017224	AGC	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206412
31	NC_017224	TGG	3	9	2278	2286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206412
32	NC_017224	TGA	2	6	2287	2292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206412
33	NC_017224	ACT	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206412
34	NC_017224	AGA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206412
35	NC_017224	GTT	2	6	2601	2606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206413
36	NC_017224	AGA	2	6	2693	2698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206413
37	NC_017224	GAT	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206413
38	NC_017224	GTT	2	6	2806	2811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206413
39	NC_017224	TAA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206413
40	NC_017224	TTA	2	6	3124	3129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206413
41	NC_017224	ATT	2	6	3253	3258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206413
42	NC_017224	ATA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206413
43	NC_017224	TGG	2	6	3326	3331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206413
44	NC_017224	AGG	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017224	ATC	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206414
46	NC_017224	TGG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206414
47	NC_017224	AAT	2	6	3717	3722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206414
48	NC_017224	TAG	2	6	3736	3741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206414
49	NC_017224	GCA	2	6	3816	3821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206414
50	NC_017224	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206414
51	NC_017224	TAA	2	6	3930	3935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206414
52	NC_017224	AGG	2	6	3941	3946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017224	ATT	2	6	3959	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206415
54	NC_017224	TGA	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206415
55	NC_017224	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206415
56	NC_017224	TAT	2	6	4022	4027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206415
57	NC_017224	AGA	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206415
58	NC_017224	AGT	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206415
59	NC_017224	TAA	3	9	4277	4285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206415
60	NC_017224	ATT	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206415
61	NC_017224	TTA	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206415
62	NC_017224	TAC	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206415
63	NC_017224	ACT	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206415
64	NC_017224	AGA	2	6	4451	4456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206415
65	NC_017224	GTG	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206415
66	NC_017224	ATG	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206415
67	NC_017224	CAG	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206415
68	NC_017224	GCA	2	6	4620	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206415
69	NC_017224	TAA	2	6	4676	4681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206415
70	NC_017224	CTA	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206415
71	NC_017224	GAA	3	9	4971	4979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206416
72	NC_017224	GTT	2	6	5184	5189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206416
73	NC_017224	ATT	2	6	5245	5250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206416
74	NC_017224	TGT	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206417
75	NC_017224	GAC	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206417
76	NC_017224	ATT	2	6	5555	5560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206417
77	NC_017224	GGT	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206418
78	NC_017224	CAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206418
79	NC_017224	ATG	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206418
80	NC_017224	AGC	2	6	6073	6078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206418
81	NC_017224	TTG	2	6	6095	6100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206418
82	NC_017224	AAT	2	6	6219	6224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206419
83	NC_017224	ATC	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206419
84	NC_017224	ATA	2	6	6294	6299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206419
85	NC_017224	TAA	2	6	6592	6597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206419
86	NC_017224	AGG	2	6	6679	6684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206419
87	NC_017224	ATT	2	6	6755	6760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206420
88	NC_017224	CTA	2	6	6812	6817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206420
89	NC_017224	CTG	2	6	6922	6927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206420
90	NC_017224	GAG	2	6	7009	7014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206420
91	NC_017224	TGT	2	6	7050	7055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206420
92	NC_017224	TTA	2	6	7058	7063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206420
93	NC_017224	GAT	2	6	7084	7089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206420
94	NC_017224	AAT	2	6	7234	7239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206420
95	NC_017224	GCT	2	6	7327	7332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206420
96	NC_017224	CTT	2	6	7339	7344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206420
97	NC_017224	TGC	2	6	7350	7355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206420
98	NC_017224	CTT	2	6	7396	7401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206420
99	NC_017224	TTG	2	6	7508	7513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206420
100	NC_017224	GTG	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206420
101	NC_017224	ACT	2	6	7644	7649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206420
102	NC_017224	ATG	2	6	7742	7747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206420
103	NC_017224	TAC	2	6	7761	7766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206420
104	NC_017224	GGT	2	6	7859	7864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206421
105	NC_017224	ACA	2	6	7907	7912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206421
106	NC_017224	GTT	2	6	7919	7924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206421
107	NC_017224	TAA	2	6	7950	7955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206421
108	NC_017224	ATT	2	6	8126	8131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206421
109	NC_017224	GAA	2	6	8153	8158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206421
110	NC_017224	AAG	2	6	8164	8169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206421
111	NC_017224	CAG	2	6	8175	8180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206421
112	NC_017224	TTA	2	6	8259	8264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206422
113	NC_017224	TTA	2	6	8494	8499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206422
114	NC_017224	TTG	2	6	8511	8516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206422
115	NC_017224	TAT	2	6	8518	8523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206422
116	NC_017224	AAT	2	6	8603	8608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206422
117	NC_017224	GAT	2	6	8639	8644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206422
118	NC_017224	CTT	2	6	8667	8672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206422
119	NC_017224	GAT	2	6	8842	8847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206423
120	NC_017224	GCA	2	6	8996	9001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206424
121	NC_017224	GTA	2	6	9072	9077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206424
122	NC_017224	TTG	2	6	9351	9356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206424
123	NC_017224	AGA	2	6	9592	9597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206424
124	NC_017224	GCG	2	6	9717	9722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206424
125	NC_017224	AGA	2	6	9820	9825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206424
126	NC_017224	AGA	2	6	9943	9948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206424
127	NC_017224	ACC	2	6	9995	10000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206424
128	NC_017224	CCT	2	6	10160	10165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206424
129	NC_017224	ATT	2	6	10307	10312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206425
130	NC_017224	AAT	2	6	10313	10318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206425
131	NC_017224	ATA	2	6	10371	10376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206425
132	NC_017224	TAA	2	6	10431	10436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206425
133	NC_017224	GTT	2	6	10587	10592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206425
134	NC_017224	TTA	2	6	10605	10610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206425
135	NC_017224	TAT	2	6	10613	10618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206425
136	NC_017224	GTG	2	6	10680	10685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206425
137	NC_017224	ACT	2	6	10730	10735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206425
138	NC_017224	AAC	2	6	10782	10787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206425
139	NC_017224	TGA	2	6	10897	10902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206425
140	NC_017224	AGT	2	6	10927	10932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206425
141	NC_017224	ATG	2	6	11031	11036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206426
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143	NC_017224	ACA	2	6	11080	11085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206426
144	NC_017224	TTA	2	6	11342	11347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206426
145	NC_017224	CTT	2	6	11359	11364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206426
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147	NC_017224	CAA	2	6	11687	11692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206426
148	NC_017224	ACC	2	6	11819	11824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206426
149	NC_017224	AGA	2	6	11939	11944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206427
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151	NC_017224	AGC	2	6	12064	12069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206427
152	NC_017224	TAC	2	6	12175	12180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206427
153	NC_017224	CAT	2	6	12234	12239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206427
154	NC_017224	TAG	2	6	12311	12316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206427
155	NC_017224	AAC	2	6	12335	12340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206427
156	NC_017224	TAT	2	6	12365	12370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206427
157	NC_017224	AAT	2	6	12407	12412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206427
158	NC_017224	AAT	2	6	12527	12532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206428
159	NC_017224	TAA	2	6	12547	12552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206428
160	NC_017224	TTG	2	6	12564	12569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206428
161	NC_017224	ACT	2	6	12657	12662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206428
162	NC_017224	TGA	2	6	12942	12947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206429
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164	NC_017224	TCT	2	6	12979	12984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206429
165	NC_017224	GAA	3	9	12997	13005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206429
166	NC_017224	GGT	2	6	13048	13053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206429
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171	NC_017224	TAA	2	6	13218	13223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206429
172	NC_017224	AAC	2	6	13234	13239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206429
173	NC_017224	AAC	2	6	13278	13283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206429
174	NC_017224	ATT	2	6	13471	13476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206429
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176	NC_017224	ACT	2	6	13693	13698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_017224	TGA	2	6	13986	13991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206430
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192	NC_017224	TAA	2	6	14643	14648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206431
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256	NC_017224	TAA	2	6	18853	18858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206438
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258	NC_017224	ATT	3	9	19010	19018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206438
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387	NC_017224	ACC	2	6	28129	28134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206448
388	NC_017224	TTA	2	6	28259	28264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206448
389	NC_017224	GAA	2	6	28354	28359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206448
390	NC_017224	AGA	2	6	28365	28370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206448
391	NC_017224	ATA	2	6	28436	28441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206448
392	NC_017224	ATT	2	6	28500	28505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206448
393	NC_017224	ACT	2	6	28517	28522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206448
394	NC_017224	TAA	2	6	28545	28550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206448
395	NC_017224	TAA	2	6	28609	28614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206448
396	NC_017224	AGC	2	6	28655	28660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
397	NC_017224	TTA	2	6	28718	28723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_017224	TTA	2	6	28772	28777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_017224	TGC	3	9	29309	29317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206449
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416	NC_017224	ATA	2	6	30243	30248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206450
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419	NC_017224	TAT	2	6	30331	30336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206450
420	NC_017224	ATA	2	6	30399	30404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206450
421	NC_017224	ATA	2	6	30450	30455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206450
422	NC_017224	TAA	2	6	30496	30501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206450
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428	NC_017224	TGT	2	6	30660	30665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206450

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.