MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-11

Total Repeats: 392

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017224	AGA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206410
2	NC_017224	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206410
3	NC_017224	ACT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206410
4	NC_017224	TAA	3	9	448	456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206410
5	NC_017224	ATA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206410
6	NC_017224	CAA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206410
7	NC_017224	CTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206410
8	NC_017224	AGT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206410
9	NC_017224	TAA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206410
10	NC_017224	TTA	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206410
11	NC_017224	ATG	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206410
12	NC_017224	ATT	2	6	1047	1052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206410
13	NC_017224	TAA	2	6	1240	1245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206410
14	NC_017224	GAG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206410
15	NC_017224	ATT	2	6	1273	1278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206410
16	NC_017224	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206411
17	NC_017224	AAG	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206411
18	NC_017224	AGG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206411
19	NC_017224	CAG	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206411
20	NC_017224	AGC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206411
21	NC_017224	TAA	2	6	1601	1606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206411
22	NC_017224	TTC	3	9	1811	1819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206411
23	NC_017224	ATT	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206411
24	NC_017224	AGA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206411
25	NC_017224	AGA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206412
26	NC_017224	CAA	2	6	2087	2092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206412
27	NC_017224	TGG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206412
28	NC_017224	AGC	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206412
29	NC_017224	TGG	3	9	2278	2286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206412
30	NC_017224	TGA	2	6	2287	2292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206412
31	NC_017224	ACT	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206412
32	NC_017224	AGA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206412
33	NC_017224	GTT	2	6	2601	2606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206413
34	NC_017224	AGA	2	6	2693	2698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206413
35	NC_017224	GAT	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206413
36	NC_017224	GTT	2	6	2806	2811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206413
37	NC_017224	TAA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206413
38	NC_017224	TTA	2	6	3124	3129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206413
39	NC_017224	ATT	2	6	3253	3258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206413
40	NC_017224	ATA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206413
41	NC_017224	TGG	2	6	3326	3331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206413
42	NC_017224	ATC	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206414
43	NC_017224	TGG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206414
44	NC_017224	AAT	2	6	3717	3722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206414
45	NC_017224	TAG	2	6	3736	3741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206414
46	NC_017224	GCA	2	6	3816	3821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206414
47	NC_017224	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206414
48	NC_017224	TAA	2	6	3930	3935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206414
49	NC_017224	ATT	2	6	3959	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206415
50	NC_017224	TGA	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206415
51	NC_017224	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206415
52	NC_017224	TAT	2	6	4022	4027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206415
53	NC_017224	AGA	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206415
54	NC_017224	AGT	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206415
55	NC_017224	TAA	3	9	4277	4285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206415
56	NC_017224	ATT	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206415
57	NC_017224	TTA	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206415
58	NC_017224	TAC	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206415
59	NC_017224	ACT	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206415
60	NC_017224	AGA	2	6	4451	4456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206415
61	NC_017224	GTG	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206415
62	NC_017224	ATG	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206415
63	NC_017224	CAG	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206415
64	NC_017224	GCA	2	6	4620	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206415
65	NC_017224	TAA	2	6	4676	4681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206415
66	NC_017224	CTA	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206415
67	NC_017224	GAA	3	9	4971	4979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206416
68	NC_017224	GTT	2	6	5184	5189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206416
69	NC_017224	ATT	2	6	5245	5250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206416
70	NC_017224	TGT	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206417
71	NC_017224	GAC	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206417
72	NC_017224	ATT	2	6	5555	5560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206417
73	NC_017224	GGT	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206418
74	NC_017224	CAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206418
75	NC_017224	ATG	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206418
76	NC_017224	AGC	2	6	6073	6078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206418
77	NC_017224	TTG	2	6	6095	6100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206418
78	NC_017224	AAT	2	6	6219	6224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206419
79	NC_017224	ATC	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206419
80	NC_017224	ATA	2	6	6294	6299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206419
81	NC_017224	TAA	2	6	6592	6597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206419
82	NC_017224	AGG	2	6	6679	6684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206419
83	NC_017224	ATT	2	6	6755	6760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206420
84	NC_017224	CTA	2	6	6812	6817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206420
85	NC_017224	CTG	2	6	6922	6927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206420
86	NC_017224	GAG	2	6	7009	7014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206420
87	NC_017224	TGT	2	6	7050	7055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206420
88	NC_017224	TTA	2	6	7058	7063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206420
89	NC_017224	GAT	2	6	7084	7089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206420
90	NC_017224	AAT	2	6	7234	7239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206420
91	NC_017224	GCT	2	6	7327	7332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206420
92	NC_017224	CTT	2	6	7339	7344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206420
93	NC_017224	TGC	2	6	7350	7355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206420
94	NC_017224	CTT	2	6	7396	7401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206420
95	NC_017224	TTG	2	6	7508	7513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206420
96	NC_017224	GTG	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206420
97	NC_017224	ACT	2	6	7644	7649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206420
98	NC_017224	ATG	2	6	7742	7747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206420
99	NC_017224	TAC	2	6	7761	7766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206420
100	NC_017224	GGT	2	6	7859	7864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206421
101	NC_017224	ACA	2	6	7907	7912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206421
102	NC_017224	GTT	2	6	7919	7924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206421
103	NC_017224	TAA	2	6	7950	7955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206421
104	NC_017224	ATT	2	6	8126	8131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206421
105	NC_017224	GAA	2	6	8153	8158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206421
106	NC_017224	AAG	2	6	8164	8169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206421
107	NC_017224	CAG	2	6	8175	8180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206421
108	NC_017224	TTA	2	6	8259	8264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206422
109	NC_017224	TTA	2	6	8494	8499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206422
110	NC_017224	TTG	2	6	8511	8516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206422
111	NC_017224	TAT	2	6	8518	8523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206422
112	NC_017224	AAT	2	6	8603	8608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206422
113	NC_017224	GAT	2	6	8639	8644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206422
114	NC_017224	CTT	2	6	8667	8672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206422
115	NC_017224	GAT	2	6	8842	8847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206423
116	NC_017224	GCA	2	6	8996	9001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206424
117	NC_017224	GTA	2	6	9072	9077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206424
118	NC_017224	TTG	2	6	9351	9356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206424
119	NC_017224	AGA	2	6	9592	9597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206424
120	NC_017224	GCG	2	6	9717	9722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206424
121	NC_017224	AGA	2	6	9820	9825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206424
122	NC_017224	AGA	2	6	9943	9948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206424
123	NC_017224	ACC	2	6	9995	10000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206424
124	NC_017224	CCT	2	6	10160	10165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206424
125	NC_017224	ATT	2	6	10307	10312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206425
126	NC_017224	AAT	2	6	10313	10318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206425
127	NC_017224	ATA	2	6	10371	10376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206425
128	NC_017224	TAA	2	6	10431	10436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206425
129	NC_017224	GTT	2	6	10587	10592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206425
130	NC_017224	TTA	2	6	10605	10610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206425
131	NC_017224	TAT	2	6	10613	10618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206425
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383	NC_017224	TAT	2	6	30331	30336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206450
384	NC_017224	ATA	2	6	30399	30404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206450
385	NC_017224	ATA	2	6	30450	30455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206450
386	NC_017224	TAA	2	6	30496	30501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206450
387	NC_017224	TAG	2	6	30505	30510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206450
388	NC_017224	AGT	2	6	30566	30571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206450
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390	NC_017224	GAT	2	6	30623	30628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206450
391	NC_017224	GCA	2	6	30647	30652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206450
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.