MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-11

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017224	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017224	TG	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	384206410
3	NC_017224	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	384206410
4	NC_017224	AG	4	8	1508	1515	50 %	0 %	50 %	0 %	384206411
5	NC_017224	TA	3	6	2951	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	384206413
6	NC_017224	CT	3	6	3174	3179	0 %	50 %	0 %	50 %	384206413
7	NC_017224	AT	3	6	4262	4267	50 %	50 %	0 %	0 %	384206415
8	NC_017224	AG	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	384206416
9	NC_017224	AG	3	6	5349	5354	50 %	0 %	50 %	0 %	384206416
10	NC_017224	AT	3	6	5601	5606	50 %	50 %	0 %	0 %	384206417
11	NC_017224	AT	3	6	5904	5909	50 %	50 %	0 %	0 %	384206418
12	NC_017224	TA	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	384206418
13	NC_017224	AT	4	8	6396	6403	50 %	50 %	0 %	0 %	384206419
14	NC_017224	TA	3	6	6484	6489	50 %	50 %	0 %	0 %	384206419
15	NC_017224	TA	3	6	6534	6539	50 %	50 %	0 %	0 %	384206419
16	NC_017224	TA	3	6	9657	9662	50 %	50 %	0 %	0 %	384206424
17	NC_017224	AT	3	6	10668	10673	50 %	50 %	0 %	0 %	384206425
18	NC_017224	AC	3	6	11754	11759	50 %	0 %	0 %	50 %	384206426
19	NC_017224	CA	3	6	12120	12125	50 %	0 %	0 %	50 %	384206427
20	NC_017224	AT	3	6	12789	12794	50 %	50 %	0 %	0 %	384206428
21	NC_017224	AT	4	8	13181	13188	50 %	50 %	0 %	0 %	384206429
22	NC_017224	AT	3	6	13459	13464	50 %	50 %	0 %	0 %	384206429
23	NC_017224	AT	3	6	13869	13874	50 %	50 %	0 %	0 %	384206430
24	NC_017224	AT	3	6	15070	15075	50 %	50 %	0 %	0 %	384206431
25	NC_017224	TA	3	6	15172	15177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017224	TA	3	6	15181	15186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017224	AT	3	6	15472	15477	50 %	50 %	0 %	0 %	384206433
28	NC_017224	CA	3	6	15511	15516	50 %	0 %	0 %	50 %	384206433
29	NC_017224	AT	3	6	15882	15887	50 %	50 %	0 %	0 %	384206434
30	NC_017224	AT	3	6	17142	17147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017224	AT	3	6	17202	17207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017224	AT	3	6	17283	17288	50 %	50 %	0 %	0 %	384206437
33	NC_017224	AT	3	6	17832	17837	50 %	50 %	0 %	0 %	384206437
34	NC_017224	AT	3	6	18031	18036	50 %	50 %	0 %	0 %	384206438
35	NC_017224	AC	3	6	18061	18066	50 %	0 %	0 %	50 %	384206438
36	NC_017224	CT	3	6	18737	18742	0 %	50 %	0 %	50 %	384206438
37	NC_017224	TA	3	6	19065	19070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017224	GT	3	6	19816	19821	0 %	50 %	50 %	0 %	384206439
39	NC_017224	AT	4	8	20040	20047	50 %	50 %	0 %	0 %	384206439
40	NC_017224	TA	3	6	20762	20767	50 %	50 %	0 %	0 %	384206440
41	NC_017224	AT	3	6	20936	20941	50 %	50 %	0 %	0 %	384206440
42	NC_017224	AG	3	6	21721	21726	50 %	0 %	50 %	0 %	384206441
43	NC_017224	AT	3	6	22103	22108	50 %	50 %	0 %	0 %	384206442
44	NC_017224	AT	3	6	22327	22332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017224	TA	4	8	22782	22789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017224	AT	3	6	22793	22798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017224	TA	3	6	22932	22937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017224	TA	3	6	23318	23323	50 %	50 %	0 %	0 %	384206443
49	NC_017224	GT	3	6	24446	24451	0 %	50 %	50 %	0 %	384206444
50	NC_017224	AT	3	6	25610	25615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017224	CA	3	6	25742	25747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017224	TA	3	6	25756	25761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017224	TG	3	6	25765	25770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017224	AT	3	6	25771	25776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017224	GA	3	6	25846	25851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017224	AG	3	6	26371	26376	50 %	0 %	50 %	0 %	384206446
57	NC_017224	TA	3	6	27094	27099	50 %	50 %	0 %	0 %	384206447
58	NC_017224	GA	3	6	27219	27224	50 %	0 %	50 %	0 %	384206447
59	NC_017224	TA	3	6	27593	27598	50 %	50 %	0 %	0 %	384206447
60	NC_017224	GA	3	6	27687	27692	50 %	0 %	50 %	0 %	384206447
61	NC_017224	AT	4	8	27962	27969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017224	AT	3	6	28162	28167	50 %	50 %	0 %	0 %	384206448
63	NC_017224	TG	3	6	28907	28912	0 %	50 %	50 %	0 %	384206449
64	NC_017224	AT	3	6	29433	29438	50 %	50 %	0 %	0 %	384206450
65	NC_017224	AT	3	6	29773	29778	50 %	50 %	0 %	0 %	384206450
66	NC_017224	GA	3	6	30266	30271	50 %	0 %	50 %	0 %	384206450
67	NC_017224	AC	4	8	30373	30380	50 %	0 %	0 %	50 %	384206450
68	NC_017224	AT	3	6	30433	30438	50 %	50 %	0 %	0 %	384206450
69	NC_017224	AG	3	6	30679	30684	50 %	0 %	50 %	0 %	384206450

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.