MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 3157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017223	GGCAA	2	10	1501	1510	40 %	0 %	40 %	20 %	384202564
2	NC_017223	CTGGC	2	10	2703	2712	0 %	20 %	40 %	40 %	384202566
3	NC_017223	GGGAG	2	10	3457	3466	20 %	0 %	80 %	0 %	384202567
4	NC_017223	GCTGG	2	10	8516	8525	0 %	20 %	60 %	20 %	384202570
5	NC_017223	TCGCC	2	10	9915	9924	0 %	20 %	20 %	60 %	384202573
6	NC_017223	TACCG	2	10	10058	10067	20 %	20 %	20 %	40 %	384202573
7	NC_017223	GACCA	2	10	13225	13234	40 %	0 %	20 %	40 %	384202576
8	NC_017223	TGCCT	2	10	13748	13757	0 %	40 %	20 %	40 %	384202576
9	NC_017223	CTGGG	2	10	15067	15076	0 %	20 %	60 %	20 %	384202576
10	NC_017223	TCGCC	2	10	15844	15853	0 %	20 %	20 %	60 %	384202577
11	NC_017223	AAGGC	2	10	17101	17110	40 %	0 %	40 %	20 %	384202577
12	NC_017223	CGGCC	2	10	19406	19415	0 %	0 %	40 %	60 %	384202577
13	NC_017223	CTGGC	2	10	19852	19861	0 %	20 %	40 %	40 %	384202577
14	NC_017223	GCGCC	2	10	20818	20827	0 %	0 %	40 %	60 %	384202579
15	NC_017223	GGGCT	2	10	25385	25394	0 %	20 %	60 %	20 %	384202580
16	NC_017223	GGCGC	2	10	26926	26935	0 %	0 %	60 %	40 %	384202581
17	NC_017223	CAGGG	2	10	29916	29925	20 %	0 %	60 %	20 %	384202584
18	NC_017223	TGGAT	2	10	30274	30283	20 %	40 %	40 %	0 %	384202584
19	NC_017223	ACTCC	2	10	30437	30446	20 %	20 %	0 %	60 %	384202585
20	NC_017223	ACGGC	2	10	32546	32555	20 %	0 %	40 %	40 %	384202587
21	NC_017223	GCGCC	2	10	36289	36298	0 %	0 %	40 %	60 %	384202590
22	NC_017223	CTGGG	2	10	37388	37397	0 %	20 %	60 %	20 %	384202591
23	NC_017223	CCGCG	2	10	39131	39140	0 %	0 %	40 %	60 %	384202592
24	NC_017223	GCGCC	2	10	39410	39419	0 %	0 %	40 %	60 %	384202592
25	NC_017223	GCCGC	2	10	42829	42838	0 %	0 %	40 %	60 %	384202597
26	NC_017223	GTTTC	2	10	45215	45224	0 %	60 %	20 %	20 %	384202599
27	NC_017223	TCCTG	2	10	48156	48165	0 %	40 %	20 %	40 %	384202602
28	NC_017223	GCGCA	2	10	48340	48349	20 %	0 %	40 %	40 %	384202602
29	NC_017223	GGCGC	2	10	48789	48798	0 %	0 %	60 %	40 %	384202602
30	NC_017223	GCACG	2	10	48843	48852	20 %	0 %	40 %	40 %	384202602
31	NC_017223	CGGCG	2	10	51761	51770	0 %	0 %	60 %	40 %	384202605
32	NC_017223	GGCCG	2	10	52244	52253	0 %	0 %	60 %	40 %	384202605
33	NC_017223	CCAGC	2	10	53641	53650	20 %	0 %	20 %	60 %	384202606
34	NC_017223	GTTGC	2	10	54993	55002	0 %	40 %	40 %	20 %	384202607
35	NC_017223	ACGGC	2	10	56452	56461	20 %	0 %	40 %	40 %	384202608
36	NC_017223	TGTCC	2	10	60801	60810	0 %	40 %	20 %	40 %	384202612
37	NC_017223	GAACG	2	10	61609	61618	40 %	0 %	40 %	20 %	384202613
38	NC_017223	TTTTG	2	10	62972	62981	0 %	80 %	20 %	0 %	384202614
39	NC_017223	TTTTC	2	10	64313	64322	0 %	80 %	0 %	20 %	384202616
40	NC_017223	CCTGT	2	10	64681	64690	0 %	40 %	20 %	40 %	384202617
41	NC_017223	CATCT	2	10	65574	65583	20 %	40 %	0 %	40 %	384202618
42	NC_017223	GGCAC	2	10	66588	66597	20 %	0 %	40 %	40 %	384202618
43	NC_017223	ATGGG	2	10	67998	68007	20 %	20 %	60 %	0 %	384202619
44	NC_017223	CGATT	2	10	68204	68213	20 %	40 %	20 %	20 %	384202619
45	NC_017223	GGCGA	2	10	70376	70385	20 %	0 %	60 %	20 %	384202621
46	NC_017223	GGGGT	2	10	72024	72033	0 %	20 %	80 %	0 %	384202622
47	NC_017223	GCGCA	2	10	75128	75137	20 %	0 %	40 %	40 %	384202625
48	NC_017223	GGGCG	3	15	75162	75176	0 %	0 %	80 %	20 %	384202625
49	NC_017223	CAGCG	2	10	75363	75372	20 %	0 %	40 %	40 %	384202626
50	NC_017223	GACGG	2	10	80945	80954	20 %	0 %	60 %	20 %	384202629
51	NC_017223	GCGCG	2	10	84368	84377	0 %	0 %	60 %	40 %	384202631
52	NC_017223	CGATG	2	10	85506	85515	20 %	20 %	40 %	20 %	384202633
53	NC_017223	GGGCA	2	10	86640	86649	20 %	0 %	60 %	20 %	384202633
54	NC_017223	AGGGC	2	10	87445	87454	20 %	0 %	60 %	20 %	384202634
55	NC_017223	CTTCG	2	10	89858	89867	0 %	40 %	20 %	40 %	384202636
56	NC_017223	CAGCG	2	10	91161	91170	20 %	0 %	40 %	40 %	384202638
57	NC_017223	GGCCG	2	10	92481	92490	0 %	0 %	60 %	40 %	384202639
58	NC_017223	GGCCT	2	10	93856	93865	0 %	20 %	40 %	40 %	384202640
59	NC_017223	CAGCG	2	10	96064	96073	20 %	0 %	40 %	40 %	384202643
60	NC_017223	GCCGC	2	10	99181	99190	0 %	0 %	40 %	60 %	384202646
61	NC_017223	GCCCA	2	10	102131	102140	20 %	0 %	20 %	60 %	384202649
62	NC_017223	GCGCC	2	10	103349	103358	0 %	0 %	40 %	60 %	384202651
63	NC_017223	GCGCG	2	10	106179	106188	0 %	0 %	60 %	40 %	384202654
64	NC_017223	GGCCG	2	10	106513	106522	0 %	0 %	60 %	40 %	384202655
65	NC_017223	GGCCT	2	10	110156	110165	0 %	20 %	40 %	40 %	384202657
66	NC_017223	CGAAT	2	10	110730	110739	40 %	20 %	20 %	20 %	384202658
67	NC_017223	CGTCC	2	10	111699	111708	0 %	20 %	20 %	60 %	384202659
68	NC_017223	TCCGG	2	10	111942	111951	0 %	20 %	40 %	40 %	384202660
69	NC_017223	CGGCG	2	10	112359	112368	0 %	0 %	60 %	40 %	384202660
70	NC_017223	AGGCC	2	10	112842	112851	20 %	0 %	40 %	40 %	384202660
71	NC_017223	GCGCG	2	10	113269	113278	0 %	0 %	60 %	40 %	384202660
72	NC_017223	CATTC	2	10	113917	113926	20 %	40 %	0 %	40 %	384202661
73	NC_017223	GACCT	2	10	114222	114231	20 %	20 %	20 %	40 %	384202661
74	NC_017223	GCGCT	2	10	115260	115269	0 %	20 %	40 %	40 %	384202663
75	NC_017223	ACGCG	2	10	115380	115389	20 %	0 %	40 %	40 %	384202663
76	NC_017223	CGGCG	2	10	116667	116676	0 %	0 %	60 %	40 %	384202664
77	NC_017223	GCCAG	2	10	119102	119111	20 %	0 %	40 %	40 %	384202667
78	NC_017223	GGTGC	2	10	120426	120435	0 %	20 %	60 %	20 %	384202668
79	NC_017223	GGCGT	2	10	129465	129474	0 %	20 %	60 %	20 %	384202673
80	NC_017223	CCGCG	2	10	131524	131533	0 %	0 %	40 %	60 %	384202675
81	NC_017223	GGCCG	2	10	131926	131935	0 %	0 %	60 %	40 %	384202675
82	NC_017223	ATGCG	2	10	133249	133258	20 %	20 %	40 %	20 %	384202677
83	NC_017223	TCGGG	2	10	133339	133348	0 %	20 %	60 %	20 %	384202677
84	NC_017223	GGTGC	2	10	133784	133793	0 %	20 %	60 %	20 %	384202677
85	NC_017223	CGGCT	2	10	136893	136902	0 %	20 %	40 %	40 %	384202679
86	NC_017223	GCCGT	2	10	137338	137347	0 %	20 %	40 %	40 %	384202679
87	NC_017223	CAGCC	2	10	137761	137770	20 %	0 %	20 %	60 %	384202679
88	NC_017223	CCGCG	2	10	139148	139157	0 %	0 %	40 %	60 %	384202680
89	NC_017223	CCTGG	2	10	139750	139759	0 %	20 %	40 %	40 %	384202680
90	NC_017223	AGGCC	2	10	142525	142534	20 %	0 %	40 %	40 %	384202680
91	NC_017223	GCGCC	2	10	142702	142711	0 %	0 %	40 %	60 %	384202680
92	NC_017223	GCGGG	2	10	143045	143054	0 %	0 %	80 %	20 %	384202681
93	NC_017223	CGGCG	2	10	143456	143465	0 %	0 %	60 %	40 %	384202681
94	NC_017223	GCACG	2	10	143919	143928	20 %	0 %	40 %	40 %	384202682
95	NC_017223	GGCTG	2	10	149344	149353	0 %	20 %	60 %	20 %	384202686
96	NC_017223	GCTCG	2	10	149717	149726	0 %	20 %	40 %	40 %	384202686
97	NC_017223	AGCGC	2	10	150702	150711	20 %	0 %	40 %	40 %	384202687
98	NC_017223	GGCCG	2	10	151233	151242	0 %	0 %	60 %	40 %	384202687
99	NC_017223	GGCGC	2	10	151773	151782	0 %	0 %	60 %	40 %	384202688
100	NC_017223	CCGGG	2	10	152057	152066	0 %	0 %	60 %	40 %	384202688
101	NC_017223	GCGCC	2	10	154205	154214	0 %	0 %	40 %	60 %	384202691
102	NC_017223	CGCGC	2	10	154293	154302	0 %	0 %	40 %	60 %	384202691
103	NC_017223	GAACA	2	10	154944	154953	60 %	0 %	20 %	20 %	384202691
104	NC_017223	GGCCG	2	10	155150	155159	0 %	0 %	60 %	40 %	384202692
105	NC_017223	GGCGT	2	10	156735	156744	0 %	20 %	60 %	20 %	384202693
106	NC_017223	GCGCC	2	10	158028	158037	0 %	0 %	40 %	60 %	384202695
107	NC_017223	GCGCC	2	10	158309	158318	0 %	0 %	40 %	60 %	384202695
108	NC_017223	GCGCC	2	10	158696	158705	0 %	0 %	40 %	60 %	384202695
109	NC_017223	GGCTG	2	10	160713	160722	0 %	20 %	60 %	20 %	384202697
110	NC_017223	CGGCG	2	10	161359	161368	0 %	0 %	60 %	40 %	384202698
111	NC_017223	GCGCC	2	10	164220	164229	0 %	0 %	40 %	60 %	384202700
112	NC_017223	CGGCG	2	10	168631	168640	0 %	0 %	60 %	40 %	384202703
113	NC_017223	CGGCG	2	10	170098	170107	0 %	0 %	60 %	40 %	384202704
114	NC_017223	GCGCC	2	10	170296	170305	0 %	0 %	40 %	60 %	384202704
115	NC_017223	GCGCT	2	10	177436	177445	0 %	20 %	40 %	40 %	384202711
116	NC_017223	CGTCG	2	10	177522	177531	0 %	20 %	40 %	40 %	384202711
117	NC_017223	CGGGC	2	10	177557	177566	0 %	0 %	60 %	40 %	384202711
118	NC_017223	CGGCG	2	10	180155	180164	0 %	0 %	60 %	40 %	384202713
119	NC_017223	AGGGC	2	10	180658	180667	20 %	0 %	60 %	20 %	384202713
120	NC_017223	GACGC	2	10	182614	182623	20 %	0 %	40 %	40 %	384202716
121	NC_017223	GGCCT	2	10	183244	183253	0 %	20 %	40 %	40 %	384202716
122	NC_017223	CTGGT	2	10	184341	184350	0 %	40 %	40 %	20 %	384202717
123	NC_017223	CGTGG	2	10	184571	184580	0 %	20 %	60 %	20 %	384202717
124	NC_017223	GCGCC	2	10	185763	185772	0 %	0 %	40 %	60 %	384202717
125	NC_017223	GGCGC	2	10	186398	186407	0 %	0 %	60 %	40 %	384202717
126	NC_017223	ACGCC	2	10	186478	186487	20 %	0 %	20 %	60 %	384202717
127	NC_017223	TGCGC	2	10	188179	188188	0 %	20 %	40 %	40 %	384202718
128	NC_017223	GGCCG	2	10	188908	188917	0 %	0 %	60 %	40 %	384202719
129	NC_017223	CGGGG	2	10	190243	190252	0 %	0 %	80 %	20 %	384202721
130	NC_017223	CCGGC	2	10	193246	193255	0 %	0 %	40 %	60 %	384202723
131	NC_017223	TGCCG	2	10	193456	193465	0 %	20 %	40 %	40 %	384202723
132	NC_017223	GGGCA	2	10	193734	193743	20 %	0 %	60 %	20 %	384202723
133	NC_017223	GCGCG	2	10	196620	196629	0 %	0 %	60 %	40 %	384202726
134	NC_017223	CGCGC	2	10	197782	197791	0 %	0 %	40 %	60 %	384202727
135	NC_017223	TGCGC	2	10	198261	198270	0 %	20 %	40 %	40 %	384202727
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149	NC_017223	CCGCG	2	10	222863	222872	0 %	0 %	40 %	60 %	384202746
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195	NC_017223	CCGGC	2	10	283177	283186	0 %	0 %	40 %	60 %	384202802
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262	NC_017223	GGCCG	2	10	344433	344442	0 %	0 %	60 %	40 %	384202856
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